Du même auteur

Dictionnaire des sciences de la vie

Préface

Les sciences de la vie constituent des champs spécialisés en plein essor. L’expression des connaissances nécessite des terminologies progressivement plus riches et plus précises. Le vocabulaire spécifique doit prendre en compte d’une part les explications qui tiennent au développement des nouvelles biosciences comme la biologie moléculaire, la biologie du développement, la neurobiologie, d’autre part les données traditionnelles de la biologie animale, de la biologie végétale, de la génétique, de la physiologie générale, de l’écologie…

L’intérêt du dictionnaire spécialisé est de faciliter l’assimilation de définitions précises et d’explications actualisées rapprochant le règne végétal et le règne animal ainsi que les notions construites aux divers niveaux d’organisation du vivant, de la molécule et des microorganismes jusqu’à l’écosystème. C’est bien le choix qui a été fait par Romaric FORET dans le dictionnaire de biologie qu’il propose. Environ 11 800 définitions représentent autant d’entrées faciles vers les biosciences. À chaque entrée sont associés la nature grammaticale et le genre, l’étymologie, la traduction anglaise, la ou les définitions, un développement encyclopédique, et éventuellement le synonyme, l’antonyme et un ou plusieurs exemples. Le caractère désuet de certains mots est souligné. La qualité de l’ouvrage tient aussi au respect et à la prise en compte équilibrée des différents domaines des sciences de la vie. Par des liens ou renvois vers des termes corrélatifs et par le jeu des synonymes, les regroupements thématiques ou l’établissement de réseaux notionnels sont tout à fait possibles.

L’outil de travail proposé est d’un très grand intérêt pour les universitaires, les étudiants des filières de sciences de la vie et les chercheurs en biologie. Le vocabulaire spécialisé est aussi mis au service des professeurs du secondaire et de leurs élèves. Ainsi, le dictionnaire peut apporter une aide véritable aux enseignants qui, dans le cadre des programmes officiels, explicitent les contenus de formation, dans les collèges et les lycées d’enseignement général, les lycées professionnels et les lycées technologiques. Définir les notions exigibles à chaque niveau de scolarité reste une préoccupation majeure des professeurs, le choix d’un niveau de formulation des notions contribuant à la cohérence verticale des enseignements et à une représentation commune des connaissances à faire acquérir.

L’ouvrage présente aussi un très grand intérêt pour les étudiants qui préparent les concours externes et internes de recrutement de l’enseignement secondaire (agrégations, CAPES, CAPET), ainsi que pour les étudiants des classes préparatoires aux grandes écoles. Le rôle explicatif du dictionnaire, sa facilité d’utilisation, la clarté et la précision des définitions apportent une contribution essentielle au développement de l’univocité du langage et à l’établissement de ponts entre disciplines d’enseignement. L’approche transversale et les complémentarités nécessaires entre biologie, biochimie, chimie et physique… sont en effet recherchées.

Au-delà de son utilisation professionnelle, le dictionnaire présente un intérêt majeur pour un vaste public, en France et dans les pays d’expression française. En effet, la composante scientifique du développement culturel apparaitO.R. aujourd’hui indispensable. Complémentaire de la culture humaniste, elle fait partie de la culture générale utile à la compréhension des enjeux de la biologie dans la société.

Précis, juste, actualisé, le dictionnaire de Romaric FORET respecte à la fois la sauvegarde utile de toute la richesse de la culture naturaliste et les signaux de la recherche scientifique moderne. Ce parcours pertinent sur le vivant sera très vivement apprécié.

Annie MAMECIER-DEMOUNEM
Ancienne Inspectrice générale de l’Éducation nationale

Avant-propos

Les dernières décennies ont connu l’essor exponentiel de nouvelles disciplines comme la biologie moléculaire, la génomique, la physiologie, la biochimie et l’enzymologie, alors que les disciplines naturalistes, telles que la zoologie, la botanique et la mycologie, se sont vues progressivement réduites dans la recherche et l’enseignement. Aujourd’hui, les frontières entre les disciplines des sciences de la vie, qui aboutissent à une vision réductionniste des phénomènes naturels, ne sont heureusement plus aussi étanches qu’autrefois. Dans la compréhension des phénomènes, de leurs causes à leurs effets, l’étude aux échelles microscopiques (atomes, ions, molécules, cellules) doit être en lien avec celle aux échelles macroscopiques (organes, organismes, populations, écosystèmes).

Le Dictionnaire des sciences de la vie se donne pour objectif de décrire de façon intégrée les phénomènes de la nature et de la vie, grâce à ses 11 800 définitions appartenant aux 190 disciplines des sciences de la vie. Loin de les opposer, il crée de nombreux ponts entre les disciplines, entre les différentes échelles d’étude, ainsi qu’entre les lexiques naturalistes et modernes. Les champs disciplinaires couverts concernent tous les domaines de la biologie, mais les termes concernant uniquement les humains et ceux liés aux pathologies en sont exclus. Les espèces vivantes ne sont pas définies. Cependant, lorsque qu’elles sont citées, leur binôme linnéen et le groupe auquel elles appartiennent sont précisés.

Les articles sont composés généralement de quatre parties :

➢ la zone entrée : elle détaille le libellé du mot avec les orthographes recommandée et traditionnelle, sa nature grammaticale et son genre, l’auteur, l’inventeur ou le découvreur, son étymologie, et se termine par sa traduction en anglais ;

➢ la ou les définition(s), composée(s) des éléments essentiels dans un langage clair, concis et univoque ;

➢ le développement encyclopédique : il dépasse la définition lexicale en apportant des notions soit plus détaillées soit plus générales ;

➢ l’ouverture : elle comporte un exemple, et le cas échéant le synonyme et l’antonyme, ainsi que des renvois vers une autre définition.

Alors que cette période de l’histoire de la Terre est fortement dégradée par les activités humaines, qui détruisent les écosystèmes, diminuent la biodiversité, modifient le climat, pillent les ressources naturelles, période que d’aucuns appellent anthropocène voire molysmocène (ère des déchets), j’ai l’espoir que ce dictionnaire contribuera à instiller, notamment chez les jeunes lecteurs, le sentiment de l’équilibre et de la beauté fragiles de la nature, et à attiser leur envie de mieux le comprendre pour mieux le respecter.

Je remercie Fabrice CHRÉTIEN et Florence LEMOINE pour leur accompagnement lors de cette nouvelle édition, ainsi que Colette CORDIER pour son aide à la correction et Stéphane BASSET pour ses suggestions d’articles. Le dictionnaire a bénéficié à chaque instant d’attention et de rigueur, ce qui ne le protège pourtant pas complètement des omissions, des généralisations abusives voire des erreurs. Je serai reconnaissant aux lecteurs de bien vouloir transmettre à l’éditeur leurs observations et leurs suggestions.

Éditions De Boeck Supérieur
à l’attention de Fabrice CHRÉTIEN
5 allée de la 2e Division Blindée
75 015 PARIS
fabrice.chretien@deboecksuperieur.com

Romaric FORÊT, le 20 juin 2020

Orthographe recommandée

La nouvelle orthographe du français n’est pas imposée mais officiellement recommandée par la réforme de l’orthographe de 1990. Aucune des deux graphies, traditionnelle ou recommandée, n’est tenue pour fautive.

En entrée, un mot modifié est écrit d’abord dans son orthographe recommandée puis dans son orthographe traditionnelle. Ex. : Saccarose ou Saccharose.

Dans le texte des définitions, l’orthographe recommandée est repérée par les initiales O.R. placées en exposant à la fin du mot. Ex. : piqureO.R..

A. Le trait d’union et la soudure

1. Adjectifs numéraux composés : ils sont reliés par des traits d’union. Ex. : trente-et-un, quarante-et-unième, deux-millions-trois-cent-quatre-vingts.

2. Trait d’union remplacé par la soudure : dans les composés de contr(e)-, entr(e)-, extra-, infra-, intra-, ultra-, ou d’éléments savants. Ex. : contrecourant, contrindication, extraembryonnaire, céphalorachidien, corticosurrénal, microorganisme. Exceptions : le trait d’union est maintenu si la soudure entraine une mauvaise prononciation (intra-utérin), ainsi que dans les termes géographiques (indo-malais).

B. Le pluriel

1. Pluriel des mots composés de types verbe-nom et préposition-nom : le second élément prend la marque du pluriel seulement et toujours lorsque le mot est au pluriel. Ex. : un porte-objet, des porte-objets ; un avant-main, des avant-mains (chez le cheval).

2. Pluriel des mots empruntés à d’autres langues (dont le latin) : ils suivent la règle générale du pluriel. Ex. : des acinus, des chlamydias, des minimums, des pronucléus, des stimulus.

C. Les accents et le tréma

1. Accentuation des mots empruntés à d’autres langues (dont le latin) : ils suivent la règle des mots français. Ex. : à postériori, édelweiss, placébo.

2. Accent grave : il est employé plutôt que l’accent aigu devant une syllabe contenant un « e » muet, au futur et au conditionnel des verbes du type « céder », et dans les inversions interrogatives. Ex. : cèleri, évènement, règlementaire, sècheresse, sèneçon ; il règlera(it) ; dussè-je. Exceptions : médecin, médecine ; les mots avec é initial (ex. : échelon, élever), et avec les préfixes pré- (ex. : prévenir) et dé- (ex. : dégeler).

3. Accent circonflexe : il disparait sur les lettres « i » et « u ». Ex. : affut, aoutement, boite, brulis, brulure, cout, fraiche, gite, gout, huitre, murier, piqure, voute ; accroit(re), entraine(r), apparait(re), murir. Exceptions : dans les terminaisons verbales du passé simple et du subjonctif, et dans cinq cas d’ambigüité (jeûne, dû, mûr, sûr et les formes conjuguées de croitre).

4. Tréma : il est déplacé sur la lettre « u » prononcée dans les suites « güe » et « güi ». Ex. : aigüe, ambigüe, ambigüité, cigüe, contigüe, contigüité. Le tréma est ajouté dans quelques mots de prononciation difficile. Ex. : argüer, gageüre, mangeüre, rongeüre, vergeüre.

D. Simplification des consonnes doubles

1. Verbes en « -eler » ou « -eter » : les formes conjuguées s’écrivent avec un accent grave et une consonne simple devant une syllabe contenant un « e » muet. Les dérivés en « -ment » suivent la même règle. Ex. : il ruissèle, le ruissèlement ; il renouvèle, le renouvèlement ; elle halète, le halètement ; elle craquète, le craquètement. Exceptions : appeler, jeter (j’appelle, je jette) et leurs composés.

2. Mots se terminant en « -olle » et verbes en « -otter » : ils sont écrits avec une consonne simple, y compris les dérivés. Ex. : arole, corole, girole, niverole, rousserole ; frisoter, greloter, grelotement. Exceptions : colle, folle, molle et les mots de la même famille qu’un nom en « -otte » (ex. : botter, de botte).

E. Correction des anomalies

1. Familles réaccordées : ex. : bonhommie, boursouffler, charriot, combattif, levreau.

2. Anomalies supprimées : ex. : assoir, dissout, exéma, nénufar, ognon, prunelier, relai, saccarose, sorgo.

3. Accents ajoutés : ex. : asséner, gangréneux, gélinotte, grainèterie, recépage, réfréner, répartie, trompéter.

4. Mots se terminant en « -illier » : le second « i » est supprimé lorsqu’il ne s’entend pas. Ex. : coquiller, -ère. Exceptions : le « i » est conservé quand il s’entend (ex. : millier), ainsi que dans les noms de végétaux (ex. : bougainvillier, groseillier, myrtillier, mancenillier, sapotillier, vanillier).

Conventions

Structure des articles

– L’intitulé du mot, en gras.

– La nature grammaticale et le genre du mot, et le cas échéant sa prononciation et son pluriel.

– Son auteur, le découvreur, l’inventeur, entre crochets.

– La date de création du mot et son étymologie, entre parenthèses.

– La traduction en anglais, entre crochets et en gras.

– La ou les définitions, indiquée par un chiffre entouré et précédé d’un triangle noir.

– Le développement encyclopédique.

– Un ou des exemple(s).

– Le(s) synonyme(s), le(s) antonyme(s).

Classement alphabétique

– Lorsque l’entrée comprend plusieurs mots (ex. : cellule de Sertoli), c’est le premier mot qui détermine le placement alphabétique (cas des cellules, des glandes, des canaux, des hormones, des facteurs, des corps, des cavités…).

– La préposition « de » entre les deux mots d’une entrée est prise en compte dans l’ordre alphabétique des entrées.

– Les acides communs dans le métabolisme sont définis généralement sous leur nom de base conjuguée plutôt que d’acide. Ex. : définition à Acétate au lieu de Acide acétique.

Texte des définitions

1. Les termes sont définis dans leur acception biologique uniquement.

2. L’orthographe recommandée ou rectifiée par la réforme de 1990 est repérée par les initiales O.R. placées en exposant à la fin du mot. Ex. : piqureO.R..

3. L’italique est employé pour l’étymologie, pour les mots anglais, et pour les binômes linnéens.

4. La majuscule est employée pour les clades monophylétiques. Les groupes polyphylétiques sont en minuscules. Ex. : poissons, crustacés, végétaux, algues, procaryotes, protozoaires...

5. Le numéro de chromosome indiqué entre parenthèses pour une protéine est le chromosome humain portant le gène de cette protéine.

6. Le nombre d’acides aminés est celui du peptide humain mature, sans prendre en compte le peptide signal ni les propeptides.

7. Les enzymes sont suivies de leur numéro EC (angl. : Enzyme Commission) :

– le premier nombre est la classe enzymatique, indiquant le type de réaction catalysée. Il existe six classes enzymatiques : EC 1 : oxydoréductases, EC 2 : transférases, EC 3 : hydrolases, EC 4 : lyases, EC 5 : isomérases, EC 6 : ligases ;

– le deuxième nombre est la sous-classe, indiquant le type de substrat impliqué dans la réaction ;

– le troisième numéro est le substrat décrit plus précisément ;

– le quatrième est le numéro de série de l’enzyme.

8. Les symboles > et < sont employés pour indiquer l’inclusion d’un clade ou d’une durée géologique dans un ensemble plus grand. Exemples :

– Chordés > Vertébrés (les Chordés forment un clade incluant les Vertébrés) ;

– Sinémurien < Jurassique (le Sinémurien est un étage inclus dans le Jurassique).

Genre des mots

1. Le genre est précisé, pour les mots pour lesquels on hésite, par la lettre M ou F placée en exposant à la fin du mot. Exemples :

– mots féminins : allantoïdeF, alvéoleF, ébèneF, fumeterreF, oasisF ;

– mots masculins : élytreM, grèbeM, haltèreM, hémisphèreM, pétaleM, tentaculeM, termiteM.

2. La nature et le genre d’une entrée sont ceux correspondant au mot pris dans son contexte biologique uniquement.

3. Les mots « enzyme » et « coenzyme » sont parfois rencontrés avec le genre masculin. Cet usage a été critiqué par l’Académie des Sciences (1959), l’Académie de Médecine (1967) et l’Académie française (1970). Le genre féminin étant devenu majoritaire, il est utilisé dans ce dictionnaire.

4. Les sigles des nucléotides comme AMP, ADP, ATP, AMPc sont réputés de genre masculin bien qu’ils fassent référence à des mots féminins (ex. : un ATP et une adénine triphosphate).

Abréviations et sigles employés

Les points et les majuscules doivent être pris en compte.

a. a.

acide aminé

abrév.

abréviation

Acad.

Académie française

adj.

adjectif

ADN

acide désoxyribonucléique

ADP

adénosine-5’-diphosphate

all.

allemand

altér.

altération

AMPc

adénosine-5’-monophosphate cyclique

anc.

anciennement

angl.

anglais

Ant.

antonyme

ant.

antérieur

ap.

après

ARN

acide ribonucléique

ARNm

ARN messager

ARNr

ARN ribosomique

ARNt

ARN de transfert

ATP

adénosine-5’-triphosphate

auj.

aujourd’hui

av.

avant

bot.

botanique

C

atome de carbone

cf.

confer

ch.

chaineO.R.

chl.

chlorophylle

chr.

chromosome

Cl.

classe

Da

dalton

dér.

dérivé

dim.

diminutif

E.

embranchement

EC

Enzyme commission

empr.

emprunt

Encycl.

encyclopédie

env.

environ

esp.

espèce ; espagnol

et al.

et alii (= et les autres)

ex.

exemple

F.

famille

f.

forme

f. ou F

féminin

FAD

flavine adénine dinucléotide

fam.

famille

FMN

flavine mononucléotide

Fr.

France

g.

genre

gr.

grec

*h

h aspiré

Ig

immunoglobuline

IL

interleukine

incl.

incluant

inf.

inférieur

ital.

italien

IUPAC

International union of pure and applied chemistry

kcal

kilocalorie

kDa

kilodalton

l.

lymphocyte

lat.

latin

loc.

locution

l.s.

lato sensu

m. ou M

masculin

Ma

millions d’années

n.

nom

N

atome d’azote

NAD⁺

nicotinamide adénine dinucléotide oxydé

NADH

nicotinamide adénine dinucléotide réduit

NADP

nicotinamide adénine dinucléotide phosphate oxydé

NADPH,H⁺

nicotinamide adénine dinucléotide phosphate réduit

O.

ordre

onomat.

onomatopéique

O.R.

orthographe recommandée (en exposant)

pb

paire de bases

p.-ê.

peut-être

pl.

pluriel

P. N.

prix Nobel

pop.

populaire

port.

portugais

post.

postérieur

p. p.

participe passé

p. pr.

participe présent

probabl.

probablement

prov.

provençal

sF.

sous-famille

SF.

superfamille

SI

Système international

sing.

singulier

s. s.

stricto sensu

sO.

sous-ordre

SO.

superordre

subg.

sous-genre

subsp.

sous-espèce

sup.

supérieur

superl.

superlatif

symb.

symbole

syn.

synonyme

S

svedberg

UI

unité internationale

UK

United Kingdom (= Royaume-Uni)

USA

United States of America (= États-Unis)

v.

vers

v. i.

verbe intransitif

v. t.

verbe transitif

var.

variété

%

pourcent

>

incluant ; supérieur à

<

inclus dans ; inférieur à

A

A (lettre capitale). [A] ► ① Symbole de l’adénine (nucléobase purique), de l’adénosine (nucléoside) et de l’adénosine-5’-monophosphate (= AMP) ou adénylate (nucléotide). Voir Adénine, Adénosine, AMP ;

► ② Symbole à une lettre de l’alanine, acide aminé protéinogène, utilisé dans une séquence peptidique. Syn. : Ala. Voir Alanine ;

► ③ Groupe A [A group] Voir Système ABO ;

► ④ Vitamine A [Vitamin A] Une des vitamines liposolubles. Voir Rétinol et Rétinal ;

► ⑤ Protéine A [Protein A] Protéine (42 kDa) de la paroi des Bactéries. Voir Protéine A ;

► ⑥ Bande A (initiale de Anisotropique). [A-band] Une des bandes sombres des sarcomères. Voir Bande A ;

► ⑦ Site A (initiale de Aminoacyl-ARNt). [A site] Voir Site ribosomique ;

► ⑧ Cellule A [A cell] Cellule des ilotsO.R. pancréatiques. Voir Cellule A ou α ;

► ⑨ Symbole des nervures anales des ailes des Insectes, dans le système de Comstock-Needham (1898) ;

► ⑩ Symbole du nombre de masse, c’est-à-dire du nombre de nucléons d’un noyau atomique, écrit conventionnellement en haut à gauche du symbole d’un élément chimique. Ne pas confondre avec le numéro atomique (= Z) ;

► ⑪ Symbole de l’absorbance. Voir cette entrée ;

► ⑫ (en capitale car initiale du nom propre Ampère, André-Marie, physicien français 1775–1836). Symbole de l’ampère, unité SI d’intensité électrique.

Å n. m. inv. (en capitale car initiale du nom propre Ångström, Anders Jonas, physicien suédois 1814–1874). [Å] Symbole de l’angstrœmO.R., unité non SI de longueur valant 10⁻¹⁰ m = 0,1 nm, soit un dix-milliardième de mètre.

a (lettre minuscule). [a] ► ① (initiale de artère). Symbole du sang artériel. Ant. : v (sang veineux) ;

► ② (initiale de alvéole). Symbole de l’air alvéolaire ;

► ③ Symbole de l’activité chimique ;

► ④ (initiale de année). Symbole de l’année, unité non SI de temps ;

► ⑤ (du danois atten, dix-huit). Symbole du préfixe SI atto-, qui indique une division par 10¹⁸ de l’unité qui le suit. Ex. : un attomètre (= am), une attoseconde (= as).

α [prononcer alpha] (1re lettre de l’alphabet grec). [α] Voir ADN polymérase α, Cellule α, Hélice α, Protéobactérie α, Récepteur adrénergique α…

AI, AII et AIII n. f. (initiale). [AI, AII et AIII] Abréviations de Angiotensine I, II et III. Voir Angiotensine.

aa ou a. a. n. m. (initiales). [aa] Abréviation de acide aminé. Voir cette entrée.

aa-AMP n. m. (sigle). [aa-AMP] Sigle de aminoacyl-Adénosine-5’-MonoPhosphate. Voir Aminoacyl-AMP.

aa-ARNt n. m. (sigle). [aa-ARNt] Sigle de aminoacyl-Acide RiboNucléique de transfert. Voir Aminoacyl-ARNt.

Aalénien, enne n. m. et adj. [K. Mayer-Eymar 1864] (de Aalen, ville du sud de l’Allemagne). [Aalenian] Notation : j1 – Cinquième étage (ou âge) du Jurassique (Mésozoïque), de –174,1 à –170,3 Ma (durée : 3,8 Ma), précédé par le Toarcien et suivi par le Bajocien.

AAR adj. (sigle). Sigle de Acido-Alcoolo-Résistant. Voir cette entrée.

ABA n. m. (sigle). [ABA] Sigle de l’anglais ABscisic Acid. Voir Acide abscissique.

Abactérien, enne adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de bactérie, du lat. moderne bacterium, microorganisme unicellulaire). [Abacterial] Qui ne contient pas de bactéries, qui n’est pas dû à des bactéries. Ex. : milieu de culture abactérien, pharyngite abactérienne.

Abajoue n. f. (1766, agglut. de la bajoue, de bas et joue). [Cheek pouch] Évagination interne bilatérale et extensible des joues de certains Rongeurs, de la plupart des Catarrhiniens (singes de l’Ancien monde) et de l’ornithorynque Ornithorhynchus anatinus (Mammifères Monotrèmes), utilisée généralement pour accumuler temporairement de la nourriture.

Abaxial, ale, aux adj. (du lat. ab, loin de, et axis, axe). [Abaxial] Qui est éloigné de l’axe, qui est orienté en direction opposée à l’axe. Ex. : face abaxiale (ou dorsale) d’une feuille, tournée vers l’extérieur ou vers le bas. Ant. : Adaxial.

Abdomen n. m. (1537, empr. au lat. abdomen, ventre). [Abdomen] ► ① Cavité postérieure du tronc des Mammifères et des Archosauriens (Oiseaux et Crocodiliens), limitée à l’avant par le diaphragme de type mammalien ou ornithique, et à l’arrière par la ceinture pelvienne. S’oppose à Thorax ;

► ② Partie postérieure du corps des Euarthropodes, particulièrement des Insectes, abritant la majorité des appareils physiologiques (appareils digestif, excréteur, reproducteur), et pouvant contribuer à la locomotion (ex. : chambre rectale des larves d’Odonates, furca des CollembolesM) et à la défense (glande à venin et dard). S’oppose à Thorax.

Abducteur adj. m. et n. m. (1565, empr. au lat. abductor, du lat. ab, loin de, et ducere, conduire). [Abducent (adj.), Abductor (n.)] Voir Abduction.

Abduction n. f. (1541, empr. au lat. abductio, action d’écarter, du lat. ab, loin de, et ducere, conduire). [Abduction] Mouvement qui écarte un membre ou une partie d’un membre du plan de symétrie (plan médian) de l’organisme, réalisé par les muscles abducteurs. Ant. : Adduction (et adducteur).

Aberration chromosomique f. (empr. au lat. aberratio, éloignement ; de chromosome, empr. à l’all. Chromosom, du gr. khrôma, couleur, et sôma, corps, et suff. -ique). [Chromosomal aberration] Toute anomalie du matériel chromosomique portant soit sur la structure des chromosomes, avec ou sans modification quantitative, soit sur leur nombre (aneuploïdies). Syn. : Anomalie chromosomique.

Abiétaie n. f. (du lat. abies, sapin). [Abies plantation] Syn. : Sapinière. Voir cette entrée.

Abiéticole adj. (du lat. abies, sapin, et colere, habiter). [Abieticolous] Qui vit sur ou sous les sapins Abies (F. Pinacées). Ex. : amanite panthère Amanita pantherina f. abietum (Basidiomycètes > Agaricomycètes).

Abiogenèse n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, bios, vie, et genesis, formation). [Abiogenesis] Théorie selon laquelle la vie pourrait naitreO.R. de la matière organique inanimée. L’emploi de ce terme est maintenant circonscrit au contexte de l’origine terrestre ou extraterrestre de la vie. Syn. (ancienne acception) : Génération spontanée, Hétérogénie, Archébiose. Ant. : Biogenèse.

Abiose n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, et bios, vie). [Abiosis] Suspension seulement apparente des signes de vie d’un organe ou d’un organisme entier, lorsque les conditions du milieu sont défavorables. La vie reprendra lors du retour de conditions favorables. Ex. : dormance des bourgeons et des graines, anhydrobiose des Tardigrades et des mousses. Syn. : Cryptobiose.

Abiotique adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; empr. au gr. biôtikos, qui permet la vie). [Abiotic] ► ① Se dit d’un facteur écologique physique ou chimique qui ne dépend pas des êtres vivants. Ex. : lumière, température, vent, pression. Ant. : Biotique ;

► ② Se dit d’un milieu où la vie est absente ou impossible. Ex. : les surfaces lunaire et solaire. Ant. : Biotique ;

► ③ Se dit d’un processus, d’un mécanisme, d’une réaction qui ne dépend pas d’un être vivant. Ex. : synthèse abiotique de la glycine. Ant. : Biotique.

ABO (groupes sanguins A, B et O). [ABO] Voir Système.

Abomasum n. m. (du lat. ab, du côté de, et omasum, tripes de bœuf). [Abomasum] Syn. : Caillette. Voir cette entrée.

Abondance n. f. (du lat. abundantia, affluence). [Abundance] Nombre d’individus d’une espèce donnée par unité d’espace.

Abondance-dominance n. f. (du lat. abundantia, affluence ; de dominant, p. pr. de dominer, empr. au lat. dominari). [Abundance-dominance] En phytosociologie, quantité d’un type biologique ou des individus d’une espèce donnée, du double point de vue de leur nombre et de la surface qu’ils couvrent dans la station considérée.

Aboral, ale, aux adj. (du lat. ab, loin de, et os, oris, bouche). [Aboral] Qui est situé à l’opposé de la bouche. Ex. : plaque madréporique aborale des oursins réguliers (Échinodermes > Échinoïdes). S’oppose à Oral.

Abortif, ive adj. et n. m. (empr. au lat. abortivus, qui fait avorter). [Abortive (adj.), Abortifacient (n.)] ► ① Se dit d’un organe ou d’un organisme qui n’a pas accompli son développement complet ou de la maladie qui en est responsable ;

► ② Qui provoque l’avortement. Ex. : mifépristone qui est l’hormone stéroïde antiprogestative de la pilule abortive.

ABP n. f. (sigle). [ABP] ► ① Sigle de l’angl. Actin-Binding Protein. Voir Protéine de liaison à l’actine ;

► ② Sigle de l’angl. Androgen-Binding Protein. Voir Protéine de liaison aux hormones sexuelles ;

► ③ Sigle de l’angl. Auxin-Binding Protein. Voir Protéine de liaison à l’auxine.

Abranche adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de branchie). [Abranchiate] Qui n’a pas de branchies ou dont les branchies ne sont pas apparentes. Ex. : lombrics (Annélides > Oligochètes).

Abricot n. m. (empr. à l’ar. ‘al barqūq, lui-même empr. au gr. praikokion, du lat. praecoquum, fruit précoce). [Apricot] Fruit charnu simple comestible des abricotiers Prunus subg. Prunus sect. armeniaca (F. Rosacées < O. Rosales), arbres monoïques originaires de l’est de l’Asie. ENCYCL. : Le fruit couramment consommé provient de l’abricotier commun Prunus armeniaca, arbuste ou arbre de 3 à 9 m de haut, originaire du nord-ouest de la Chine (province de Xinjiang). Le fruit est orangé, sphérique, de 3 à 5 cm de diamètre, trichocarpe (épicarpe velouté). L’abricot est une drupe (fruit charnu à endocarpe lignifié) provenant d’un ovaire infère unicarpellé, non adhérent, le conceptacle et les pièces florales étant caducs.

Abrine n. f. (du genre Abrus, et suff. -ine). [Abrin] Toxine végétale synthétisée par le pois rouge Abrus precatorius (F. Fabacées), une liane originaire d’Indonésie.

Abscisse n. f. (de abscission, du lat. abscessio, action de s’éloigner). [Separation layer] Dans une zone d’abscission, couche cellulaire séparatrice dont les parois cellulaires sont digérées par les cellulases et les pectinases synthétisées sous l’action de l’éthylène H₂C=CH₂, une hormone gazeuse synthétisée par les organes sénescents (feuilles, fruits, rameaux). Syn. : Assise séparatrice. Voir Abscission.

Abscissine n. f. (de absciss(ion), et suff. -ine). [Abscisin] Syn. : Acide abscissique. Voir cette entrée.

Abscission n. f. (du lat. abscessio, action de s’éloigner). [Abscission] Long processus physiologique qui s’achève par la chute des organes sénescents (feuilles, fleurs, fruits et parfois rameaux) d’une plante, régulé par des facteurs externes (température, photopériode) et internes (teneurs en auxine et en éthylène H₂C=CH₂).

Abscissique adj. (de abscission, du lat. abscessio, action de séparer). [Abscisic] Voir Acide abscissique.

Absentéisme n. m. (de absent, empr. au lat. absens, p. pr. de abesse, être éloigné de). [Absenteeism] Comportement parental consistant à rester à l’écart des petits et à ne venir les voir que pour leur apporter les soins essentiels comme la nourriture et la chaleur, selon une fréquence qui dépend de l’âge des petits. Ex. : lapin de garenne Oryctolagus cuniculus (O. Lagomorphes).

Absorbance n. f. (du lat. absorbere, absorber). [Absorbance] Symb. : A – Grandeur physique sans unité correspondant à la capacité d’une solution à absorber une onde électromagnétique d’une longueur d’onde donnée, mesurée par un spectrophotomètre, proportionnelle à la concentration de la solution en solutés absorbants et à l’épaisseur de la couche traversée. A = log₁₀ (I₀ / I) avec I₀ : intensité lumineuse incidente et I : intensité lumineuse transmise. Syn. : Densité optique (= DO), Extinction (désuet).

Absorbant, e adj. (p. pr. de absorber, du lat. absorbere). [Absorbant] Se dit d’une cellule (ex. : entérocyte) ou d’un organe (ex. : poil absorbant) dont la fonction principale est d’absorber l’eau et des solutés. Voir Absorption ci-après.

Absorption n. f. (empr. au lat. absorptio, de absorbere). [Absorption] ► ① Passage d’une substance, d’une solution, d’un soluté, du milieu extérieur vers l’intérieur d’une cellule vivante, donc au travers d’une membrane plasmique et parfois d’une paroi. Ne pas confondre avec Adsorption ;

► ② Diminution de l’intensité d’un rayonnement électromagnétique visible ou non, après la traversée d’un milieu absorbant. Ex. : absorption de lumière par les chloroplastes ;

► ③ Syn. : Ingestion. Voir cette entrée.

Abyssal, ale, aux adj. (1886, du lat. abyssus, abimeO.R.). [Abyssal] Relatif à l’étage des profondeurs moyennes, de –3 000 à –6 000 m, situé entre l’étage bathyal (supérieur) et l’étage hadal (inférieur), totalement obscur, aphotique, donc non colonisé par les organismes photosynthétiques.

Abyssobenthique adj. (du lat. abyssus, abimeO.R. ; du gr. benthos, profondeur). [Abyssobenthic] Relatif aux fonds marins de l’étage abyssal, qui vit sur ou dans les sédiments de l’étage abyssal (de –3 000 à –6 000 m). Voir Abyssobenthos.

Abyssobenthos n. m. (du lat. abyssus, abimeO.R. ; du gr. benthos, profondeur). [Abyssobenthos] Ensemble des organismes benthiques de l’étage abyssal (de –3 000 à –6 000 m) appartenant à plusieurs groupes (Échinodermes, vers, Spongiaires, Foraminifères, Bactéries) résistant à l’absence de lumière, à une pression très élevée, à une température constante très basse (sauf près des cheminées hydrothermales), à une teneur en dioxygène faible, à une nourriture rare.

Abyssopélagique adj. (du lat. abyssus, abimeO.R. ; empr. au lat. pelagicus, de la mer). [Abyssopelagic] Relatif à la pleine mer de l’étage abyssal (de –3 000 à –6 000 m), qui vit dans cette zone.

Abzyme n. f. (mot-valise, de l’angl. a(nti)b(ody), anticorps, et (en)zyme). [Abzyme] Anticorps à activité enzymatique qui catalyse une réaction chimique grâce à l’affinité de son paratope pour le complexe de transition de la réaction ce qui abaisse l’énergie d’activation. Syn. : Anticorps monoclonal catalytique.

Ac n. m. (abrév.). [Ac] Abréviation de Anticorps. Voir cette entrée.

AC n. f. (sigle). [AC] Sigle de Adénylate Cyclase. Voir cette entrée.

Acalorique adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de calorie, du lat. calor, chaleur). [Calorie-free] Se dit d’une substance dont l’absorption n’apporte pas ou très peu de calories à l’organisme. Ex. : eau, thé, son. Ant. : Calorique.

Acanthé, e ou Acanthacé, e adj. (du gr. akantha, épine). [Acanthaceous] Se dit d’une plante qui est pourvue d’épines, d’aiguillons. Ex. : ronce commune Rubus fruticosus (F. Rosacées), acanthesFAcanthus (F. Acanthacées). Ant. : Anacanthé.

Acanthocarpe adj. (du gr. akantha, épine, et karpos, fruit). [Acanthocarpous] Se dit d’une plante qui produit des fruits accrochants, à épines ou à crochets, qui s’agrippent facilement aux poils et aux plumes des animaux et favorisent ainsi la dissémination des fruits par épizoochorie. Ex. : bardane Arctium lappa (F. Astéracées), lampourdes Xanthium (F. Astéracées).

Acanthocéphales (Acanthocephala) n. m. pl. [Kölreuter 1771] (du grec akantha, épine, et kephalê, tête). [Acanthocephalans] Clade (rang : embranchement) de Gnathifères (Eumétazoaires > Bilatériens > Protostomiens > Spiraliens), constituant le groupe frère des Rotifères, et regroupant de petits animaux vermiformes blancs à rouges, parasites internes obligatoires d’Euarthropodes à l’état larvaire (larves acanthor puis acanthella puis cystacanthe) et des intestins de Vertébrés à l’état adulte. ENCYCL. : Leur corps est cylindrique, à symétrie bilatérale, non segmenté, mesurant de quelques millimètres à 1 m. Les Acanthocéphales sont probablement des Rotifères devenus parasites. 1 192 espèces sont connues, réparties en 3 classes : Archiacanthocéphales, Éoacanthocéphales, Paléacanthocéphales.

Acanthoclade n. m. et adj. (du gr. akantha, épine, et klados, rameau). ► ① n. m. [Acanthoclade] Rameau acanthé, c’est-à-dire qui porte des épines (origine tissulaire profonde) ou des aiguillons (origine épidermique), servant à la défense de la plante contre les herbivores ;

► ② adj. [Acanthocladous] Se dit d’une plante dont les rameaux sont épineux (ex. : ronce commune Rubus fruticosus (F. Rosacées)) ou dont les rameaux se terminent en pointe (ex. : acacia acanthoclade Acacia acanthoclada (F. Fabacées)).

Acanthodiens (Acanthodii) n. m. pl. [Owen 1846] (du gr. akantha, épine, et eidos, aspect). [Acanthodians] Groupe paraphylétique éteint de petits poissons (< 50 cm) marins et dulçaquicoles, ressemblant à de petits requins, apparus il y a 430 Ma (Silurien inf.) et disparus il y a 270 Ma (Permien > Guadalupien), constituant les premiers Gnathostomes (Vertébrés à mâchoire) connus. Le groupe rassemble trois ordres : les Acanthodiformes, les Climatiiformes et les Ischnacanthiformes.

Acanthophylle adj. et n. f. (du gr. akantha, épine, et phullon, feuille). ► ① adj. [Acanthophyllous] Se dit d’une plante qui porte des feuilles ou des folioles transformées en épines. Ex. : épine-vinette Berberis vulgaris (F. Berbéridacées) ;

► ② n. f. [Acanthophyll] Feuille en forme d’épine. Syn. : Feuille-épine.

Acanthozoïde n. m. (du gr. akantha, épine, et zôoeidês, semblable à un animal). [Acanthozooid] Chez certains Cnidaires Hydrozoaires coloniaux, individu régressé stérile, sans bouche ni tentacules, en forme d’épine, constituant un abri protecteur de la cormidie. Ne pas confondre avec Dactylozoïde. Syn. : Aspidozoïde.

Acariforme adj. (de acari(en), du gr. akari, ciron, et forme). [Acariform] Se dit de la larve des Pentastomides (Pancrustacés > Ichthyostracés), parasite, ovoïde, pourvue d’un rostre perforant et de deux paires d’appendices terminés en griffe, ce qui lui donne l’apparence d’un acarien.

Acarocécidie n. f. (de acarien, du gr. akari, ciron ; du gr. kêkis, -idos, noix de galle). [Acarocecidium, pl. -dia] Zoocécidie formée par la piqureO.R. d’Acariens parasites cécidogènes et vermiformes, notamment les ériophyes Eriophyes et les Aceria. Ne pas confondre avec Acarodomatie.

Acarodomatie n. f. (de acarien, du gr. akari, ciron ; du lat. domus, maison). [Acarodomatium, pl. -tia] Domatie abritant des Acariens, fréquente chez les tilleuls et les Rubiacées, absente chez les Acrogymnospermes et les Monocotylédones. ENCYCL. : La relation est une coopération, chacun en tirant bénéfice : la plante acarophile fournit l’abri et l’acarien la débarrasse de ses parasites. Ne pas confondre avec Acarocécidie.

Acarologie n. f. (de acarien, du gr. akari, ciron, et logos, discours). [Acarology] Discipline de la zoologie qui étudie les Acariens (Euarthropodes > Arachnides). Le (la) spécialiste est l’acarologiste (rarement : acarologue).

Acarophile adj. (de acarien, du gr. akari, ciron, et du gr. philos, ami). [Acarophilous] Se dit d’une plante vivant en coopération avec des Acariens. ENCYCL. : Ce caractère s’appelle l’acarophilie. Les Acariens sont abrités par la plante dans des acarodomaties, se nourrissent de spores fongiques dont ils débarrassent les feuilles, et entrent en compétition avec certains parasites de la plante. Voir Acarodomatie.

Acarpe adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et karpos, fruit). [Acarpous] Se dit d’une Angiosperme qui ne produit pas de fruits malgré une floraison. Ce caractère s’appelle l’acarpie.

ACAT n. f. (sigle de Acyl-coenzyme A Cholestérol AcylTransférase). [ACAT] Enzyme (EC 2.3.1.26) de la face cytoplasmique du réticulum endoplasmique qui estérifie le cholestérol en transférant le groupe acyle d’une acyl-CoA sur l’hydroxyle du noyau A du cholestérol. ENCYCL. : Les esters de cholestérol ou cholestérylesters constituent la forme de stockage cytoplasmique du cholestérol, sous forme de gouttelettes lipidiques, et sa principale forme de transport plasmatique. Syn. : Stérol O-acyltransférase.

Acaule adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et kaulos, tige). [Acaulous, Acauline] Se dit d’un végétal sans tige apparente. ENCYCL. : Ce caractère s’appelle l’acaulie. Les feuilles, dites radicales, sont regroupées à la base de la plante près de la racine, tandis que la ou les fleurs sont surélevées sur une hampe florale. Ex. : pissenlits Taraxacum (F. Astéracées), primevères Primula (F. Primulacées). Syn. : Acaulescent. Ant. : Caulescent.

Acaulescent, e adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et kaulos, tige). [Acaulescent] Syn. : Acaule. Voir cette entrée.

Acaulie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, et kaulos, tige). [Acauly] Caractère des plantes acaules. Voir Acaule.

ACC n. m. (sigle de 1-AminoCyclopropane-1-Carboxylate). [ACC] Acide aminé à cyclopropane, non protéinogène, précurseur direct de l’éthylène H₂C=CH₂, une phytohormone gazeuse, et synthétisé à partir de la S-adénosylméthionine (= SAM) grâce à l’ACC synthase (EC 4.4.1.14) dans les tissus végétaux sénescents. Formule : [C₃H₄]–(NH₂)–COOH. Voir ACC oxydase.

ACC oxydase n. f. (sigle de 1-AminoCyclopropane-1-Carboxylate). [ACC oxidase] Enzyme (EC 1.14.17.4) qui catalyse la transformation de l’aminocyclopropane-1-carboxylate (= ACC) en éthylène H₂C=CH₂. Syn. : Aminocyclopropane-carboxylate oxydase, Enzyme formant l’éthylène. Voir Éthylène.

Accélérine n. f. (de l’angl. accelerin, de to accelerate, accélérer) [Accelerin] Forme activée du facteur V de la coagulation sanguine ou proaccélérine. Syn. : Facteur Va. Voir Facteur V de la coagulation.

Accepteur n. m. et adj. m. (empr. au lat. acceptor, celui qui reçoit). [Acceptor (n.)] ► ① Molécule ou groupe chimique capable de se lier à d’autres molécules, particulièrement au dioxygène O₂ et au dihydrogène H₂. Ant. : Donneur ;

► ② Molécule capable d’attirer et de fixer des électrons et qui sert donc d’oxydant dans les réactions d’oxydoréduction. ENCYCL. : Les accepteurs d’électrons sont nombreux dans la chaineO.R. respiratoire mitochondriale et dans la chaineO.R. photosynthétique de transporteurs d’électrons. Ex. : NAD, NADP et FAD, trois accepteurs de protons et d’électrons. Ant. : Donneur.

Accidentel, elle adj. (du lat. accidens, qui survient). [Accidental] Se dit d’une plante présente dans une station qui ne lui est pas habituelle, généralement en petit nombre, chétive et stérile.

Accipitriformes n. m. pl. [Vieillot 1816] (du genre Accipiter, mot lat., épervier, et forma, type). [Accipitriformes] Clade (rang : ordre) d’Oiseaux Néoaves Dendrornithes Afroaves, regroupant les rapaces diurnes, de grands oiseaux trapus possédant un bec crochu, une longue queue, des pieds anisodactyles (orteil 1 vers l’arrière) pourvus de serres. ENCYCL. : Leur répartition est mondiale sauf en Antarctique et au nord du cercle polaire arctique. Ce sont des prédateurs diurnes ou des charognards. Leurs yeux ont la plus grande acuité du monde animal. Ils construisent leur nid, contrairement aux Strigiformes et aux Falconidés. 266 espèces sont connues, réparties dans 4 familles (74 genres) : Accipitridés, Cathartidés, Pandionidés et Sagittariidés.

Acclimatation n. f. (1832, de acclimater, de climat, empr. au lat. clima, latitude, région). [Acclimation, Acclimatization (UK)] Processus réalisé par les humains ayant pour but de faire vivre des organismes hors de leurs stations naturelles ou dans des conditions artificielles contrôlées. Ne pas confondre avec Acclimatement, Accommodation (naturelle) et Adaptation (héréditaire).

Acclimaté, e adj. (p. p. de acclimater, de climat, empr. au lat. clima, latitude, région). [Acclimated] Se dit d’une espèce, d’un individu qui vit hors de son habitat naturel, dont on a réussi l’acclimatation. Voir Acclimatation.

Acclimatement n. m. (1801, de acclimater, de climat, empr. au lat. clima, latitude, région). [Acclimation, Acclimatization (UK)] Le fait de vivre et de se reproduire dans un milieu différent du milieu originel ; Résultat de l’acclimatation.

Accombant, e adj. (du lat. accumbere, être couché). [Accumbent] Se dit d’un organe qui est couché sur un autre. Ex. : écailles couchées sur le rameau chez les cyprès Cupressus (F. Cupressacées).

Accommodat n. m. (du lat. accommodatio, appropriation). [Non-inherited phenotype] Caractère adaptatif réversible, non héréditaire qui apparaitO.R. à la suite d’un changement de milieu et qui permet à un organisme de s’adapter à de nouvelles conditions du milieu de vie ; L’organisme qui possède un tel caractère. ENCYCL. : L’accommodat est la conséquence de l’expression du génotype qui permet cette plasticité phénotypique. Ex. : bronzage.

Accommodation n. f. (empr. au lat. accommodatio, -onis, action d’accommoder). [Accommodation] ► ① Adaptation phénotypique réversible et non héréditaire d’un organisme à de nouvelles conditions de son milieu de vie. ENCYCL. : L’organisme est dit accommodé. L’accommodation s’inscrit dans les limites de la plasticité phénotypique de l’espèce permise par le génotype. Ne pas confondre avec l’adaptation qui est héréditaire ni avec l’acclimatation qui est artificielle ;

► ② (1863). Accommodation visuelle, mise au point réflexe de l’image sur les photorécepteurs, en fonction de la distance de l’objet. ENCYCL. : L’accommodation visuelle peut être réalisée soit par déplacement (Cyclostomes, Téléostéens, Batraciens) soit par changement de convexité ;

► ③ Accommodation neuronale, diminution de l’excitabilité d’un neurone, d’un récepteur sensoriel, provoquée par une stimulation continue.

Accommodé, e adj. (p. p. de accommoder, empr. au lat. accommodare, adapter). [Accommodated] Se dit d’un individu qui présente un accommodat, c’est-à-dire un caractère réversible non héréditaire obtenu par accommodation. Voir 1. Accommodation.

Accompagnateur, trice adj. (de accompagner). Voir Essence accompagnatrice.

Accouplement n. m. (1538, de accoupler, de couple, du lat. copula, groupe de deux personnes). [Mating] Rapprochement physique étroit de deux organismes appartenant à la même espèce ou à deux espèces très proches, en vue de réaliser une reproduction sexuée, souvent favorisé par un ensemble de comportements stéréotypés appelé parade. Lors d’un accouplement, la fécondation peut être rarement externe (ex. : amplexus des Batraciens). Syn. (en cas de fécondation interne) : Copulation, Coït.

Accrescent, e adj. (du lat. accrescere, s’accroitreO.R.). [Accrescent] Se dit d’une pièce florale autre que l’ovaire qui poursuit sa croissance après la fécondation. Ce caractère s’appelle l’accrescence. Ex. : les styles des benoitesO.R.Geum (F. Rosacées), le réceptacle floral des fraisiers Fragaria (F. Rosacées).

Accrochant, e adj. (de accrocher, de croc). [Hooked] Se dit d’une diaspore pourvue d’épines ou de crochets qui s’accrochent au pelage ou au plumage, ce qui facilite la dissémination des diaspores par épizoochorie. Ex. : fruit de la bardane Arctium lappa (F. Astéracées). Voir Acanthocarpe.

Accru n. m. (p. p. de accroitreO.R.). [Sucker] Chez les essences ligneuses, nouvelle pousse d’origine racinaire qui participe à l’extension d’une région boisée. Ne pas confondre avec Accrue.

Accrue n. f. (p. p. de accroitreO.R.). Extension naturelle d’une forêt qui progresse sur le terrain voisin grâce à des rejets naturels ou accrus. Ne pas confondre avec Accru.

ACE n. f. (sigle). [ACE] Sigle de l’anglais Angiotensin-Converting Enzyme. Voir Enzyme de conversion de l’angiotensine.

Acèle → Acœle

Acellulaire adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de cellule, empr. au lat. cellula, dim. de cella, chambre). [Acellular] Qui ne possède pas de cellules. ENCYCL. : Si des noyaux sont présents mais ne sont pas contenus dans une membrane plasmique, on parle de structure cœnocytique ou syncytiale. Ex. : mésoglée des Spongiaires et Cnidaires, paroi végétale.

Acentrique adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de centr(omère)). [Acentric] ► ① Se dit d’un fragment de chromosome qui est dépourvu de centromère. ENCYCL. : Lors de la multiplication cellulaire, les fragments acentriques ne se déplacent pas au cours de l’anaphase car ils ne possèdent pas de point d’ancrage aux microtubules, et se répartissent donc au hasard dans les cellules filles ;

► ② Syn. : Anastral. Voir cette entrée.

Acéphale adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et kephalê, tête). [Acephalous] Qui est dépourvu de tête. Ce caractère s’appelle l’acéphalie. Ex. : larve acéphale des Diptères (Insectes).

Acéraie n. f. (du genre Acer, mot lat., érable). Syn. : Érablaie. Voir cette entrée.

Acercariens (Acercaria) n. m. pl. [Börner 1904] (du gr. a-, préfixe privatif, et kerkos, queue). [Acercaria(ns)] Syn. valide de Paranéoptères (Paraneoptera). Voir cette entrée.

Acériforme adj. (du genre Acer, mot lat., érable, et du lat. forma, type). [Aceriform] Se dit d’une feuille palmée dont la forme et la taille rappellent les feuilles des érables Acer (F. Sapindacées). Ex. : mauve sylvestre Malva sylvestris (F. Malvacées), mukdénie de Ross Mukdenia rossii (F. Saxifragacées).

Acérola n. f. (de l’ar. andalou azza 'rúra) [Acerola, Barbados cherry] Fruit charnu simple comestible de l’acérolier Malpighia emarginata (F. Malpighiacées < O. Malpighiales), arbrisseau ou arbuste monoïque, mesurant jusqu’à 6 m de haut, originaire d’Amérique centrale. ENCYCL. : Le fruit est vert puis rouge vif à maturité, brillant, lisse, sphérique, de 1 à 3 cm de diamètre, et présentant trois lobes peu marqués. L’acérola est une drupe syncarpique (à carpelles soudés), provenant d’un ovaire supère tricarpellé. C’est le deuxième fruit (« superfruit ») le plus riche en vitamine C (1 700 mg/100 g) après le camu-camu Myrciaria dubia (2 700 mg/100 g). Syn. : Cerise de la Barbade ou des Antilles ou de Cayenne. Ne pas confondre avec l’azérola, fruit de l’azérolier Crataegus azarolus.

Acervule n. m. (du lat. acervus, amas). [Acervulus, pl. -uli] ► ① Chez les Eumycètes deutéromycètes cœlomycètes de l’ordre des Mélanconiales, structure asexuée abritant les conidiophores et les conidies, sur la plante parasitée ;

► ② Dans l’épiphyse et les plexus choroïdes, chacune des concrétions extracellulaires d’aspect feuilleté ou en forme de mureO.R., constituées de couches concentriques de phosphate de calcium et de magnésium dans une matrice organique, formant ensemble le sable cérébral dont le rôle est inconnu.

Acétabulaire adj. (du lat. acetabulum, bol). [Acetabular] Relatif à la cavité cotyloïde. Voir cette entrée.

Acétabulum n. m. (du lat. acetabulum, bol). [Acetabulum] Chez les Tétrapodes, fosse osseuse des deux surfaces externes du bassin, recevant le fémur et formant ainsi l’articulation coxo-fémorale, constituée par la jonction de trois os : l’ischium (antérieur), l’ilium (postérieur) et le pubis (ventral). Syn. (ancienne nomenclature) : Cavité cotyloïde et Cotyle.

Acétaldéhyde n. m. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et aldéhyde). [Acetaldehyde] Métabolite intermédiaire obtenu :

– par décarboxylation non oxydative du pyruvate par la pyruvate décarboxylase (EC 4.1.1.1) lors de la fermentation alcoolique ;

– par oxydation de l’éthanol par l’alcool déshydrogénase (EC 1.1.1.1), dans le cytoplasme des hépatocytes.

ENCYCL. : En excès, l’acétaldéhyde est toxique (davantage que l’éthanol) et est responsable de la fibrose hépatique. Formule : CH₃–CHO. Syn. : Éthanal (nom IUPAC), Aldéhyde acétique (désuet), Éthylaldéhyde (désuet), Oxoéthane (désuet).

Acétate n. m. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et suff. -ate). [Acetate] Anion de l’acide acétique, acide carboxylique à deux atomes de carbone, synthétisé (= acétogenèse) au cours de plusieurs processus cellulaires :

– lors d’une consommation d’alcool (= éthanol), l’acétate est formé dans le cytoplasme des hépatocytes à partir de l’acétaldéhyde issu de l’éthanol ;

– par oxydation de l’éthanol lors de la fermentation acétique aérobie (Acetobacter). Voir Fermentation acétique ;

– par la voie de Wood-Ljungdahl des Bactéries et des Archées hydrogénotrophes selon la réaction : 2 CO₂ + 4 H₂ → CH₃–COOH + 2 H₂O.

– c’est aussi un catabolite issu de l’hydrolyse de l’acétylcholine par l’acétylcholinestérase (EC 3.1.1.7).

Formule : CH₃–COO–. Syn. : Acide acétique, Acide éthanoïque, Éthanoate.

Acétate-Co(enzyme)A ligase n. f. [Acetate-CoA ligase] Enzyme (EC 6.2.2.1) qui catalyse l’activation d’un acétate par une coenzyme A en acétyl-coenzyme A, avec consommation d’un ATP, constituant une alternative à la synthèse d’acétyl-CoA par décarboxylation oxydative du pyruvate. Syn. : Acétyl-Co(enzyme)A synthétase. Voir Acétyl-CoA.

Acétoacétate n. m. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre). [Acetoacetate] Anion de l’acide acétoacétique, un corps cétonique provenant :

– du clivage de la HMG-CoA (β-hydroxy-β-méthylglutaryl-CoA) issue de la condensation de trois acétyl-coenzymes A, dans les cellules hépatiques ;

– du catabolisme de la phénylalanine et de la tyrosine, dont il est le produit terminal. Ces acides aminés sont dits cétoformateurs.

ENCYCL. : L’acétoacétate étant soluble, il est plus facile à transporter par voie sanguine que les acides gras. Une petite partie de l’acétoacétate est décarboxylée en acétone CH₃–CO–CH₃ qui sera éliminée par les poumons et qui donnera à l’haleine lors du jeûne une odeur fruitée caractéristique. Formule : CH₃–CO–CH₂–COO–. Syn. : Acétylacétate, Acide acétoacétique, Acide 3-oxobutanoïque (nom IUPAC). Voir Cétogenèse.

Acétogenèse n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et du gr. genesis, origine). [Acetogenesis] Synthèse d’acétate CH₃–COO– (= éthanoate) par des procaryotes (Bactéries et Archées), particulièrement dans l’estomac des Ruminants. ENCYCL. : L’acétate peut être formé par fermentation acétique aérobie de l’éthanol (Acetobacter), par fermentation acide mixte anaérobie du pyruvate, et par acétogenèse réductrice (voie de Wood-Ljungdahl), notamment chez les Bactéries symbiotiques des termitesM, à partir de dihydrogène et de CO₂.

Acétylacétate n. m. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre). [Acetylacetate] Syn. : Acétoacétate. Voir cette entrée.

Acétylation n. f. (de acétyle, de acét(ique)). [Acetylation] Transfert d’un groupe acétyle CH₃–CHO sur une molécule réceptrice, le donneur d’acétyle étant généralement l’acétyl-CoA. ENCYCL. : L’acétylation des osides a lieu sur les amines de la glucosamine (par la glucosamine N-acétyltransférase, EC 2.3.1.3) et de la galactosamine. L’acétylation post-traductionnelle des polypeptides est réalisée en général sur l’α-amine N-terminale. Dans les histones, l’acétylation a lieu sur l’ε-amine de lysines. Syn. : Éthanoylation. Ant. : Désacétylation.

Acétylcholine n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et choline). [Acetylcholine] Abrév. : ACh – Neurotransmetteur des synapses dites cholinergiques situées dans les axones pré- et postganglionnaires du système nerveux parasympathique, dans les axones préganglionnaires du système nerveux orthosympathique, dans les jonctions neuromusculaires et dans certains axones du système nerveux central. ENCYCL. : L’acétylcholine est synthétisée par la choline O-acétyltransférase (EC 2.3.1.6) à partir d’acétyl-CoA et de choline. Lors de l’arrivée de l’influx nerveux, les vésicules synaptiques, contenant chacune de 1 000 à 10 000 molécules d’acétylcholine, s’ouvrent dans la fente synaptique par exocytose. Formule : CH₃–COO–CH₂–CH₂–N⁺–(CH₃)₃. Syn. (nom IUPAC) : 2-Acétoxy-N,N,N-triméthyléthanaminium.

Acétylcholinestérase n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, choline, et estérase). [Acetylcholinesterase] Abrév. : AChE – Enzyme (EC 3.1.1.7, chr. 7) qui catalyse l’hydrolyse de l’acétylcholine en acétate et en choline dans les fentes synaptiques cholinergiques, permettant de libérer l’acétylcholine de son récepteur postsynaptique et ainsi de restaurer l’excitabilité de la membrane postsynaptique. Voir Acétylcholine.

Acétyl-CoA n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et de co(enzyme) A). [Acetyl-CoA] Abrév. de Acétyl-coenzyme A. Voir cette entrée.

Acétyl-Co(enzyme)A carboxylase n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et co(enzyme) A). [Acetyl-co(enzyme) A carboxylase] Enzyme (EC 6.4.1.2, à biotine) qui catalyse la carboxylation de l’acétyl-coenzyme A en malonyl-coenzyme A HOOC–CH₂–CO–S–CoA, avec consommation d’un ATP, première réaction, irréversible et limitante, de la biosynthèse des acides gras. ENCYCL. : C’est la seule enzyme de la biosynthèse des acides gras qui n’appartienne pas au complexe multienzymatique appelé acide gras synthase (= AGS).

Acétyl-Co(enzyme)A synthétase n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et co(enzyme) A). [Acetyl-Co(enzyme)A synthetase] Syn. : Acétate-CoA ligase. Voir cette entrée.

Acétyl-coenzyme A n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et coenzyme A). [Acetyl-coenzyme A] Abrév. : Acétyl-CoA – Forme activée de la coenzyme A sous forme de thioester acétique H₃C–CO–S–CoA, constituant un métabolite central situé au carrefour de très nombreuses voies biochimiques chez tous les êtres vivants. ENCYCL. : L’acétyl-coenzyme A est formée lors de la décarboxylation du pyruvate, de la β-oxydation des acides gras, et lors du catabolisme de certains acides aminés comme la leucine, l’isoleucine, le tryptophane et la lysine. L’acétyl-coenzyme A est un donneur de groupe acétyle CH₃–CO– dans de nombreuses voies biochimiques : biosynthèse des acides gras, cycle de Krebs (synthèse du citrate à 6 C à partir de l’oxaloacétate à 4 C), cycle du glyoxylate (pour former le citrate et le malate), biosynthèse de l’acétylcholine, biosynthèse hépatique des corps cétoniques (trois acétyl-coenzymes A sont condensées en une HMG-CoA), biosynthèse des triterpènes et des stéroïdes (trois acétyl-coenzymes A condensées en une HMG-CoA qui sera réduite en mévalonate), formation d’ATP par l’intermédiaire d’acétylphosphate.

Acétyle n. m. (1853, de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre). [Acetyle] Groupe CH₃–CO– dérivant de l’acide acétique CH₃–COOH. Voir Acétyl-coenzyme A (forme activée de l’acétyle).

N-acétylgalactosamine n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre ; de galactos(e) et amine). [N-acetylgalactosamine] Abrév. : GalNAc – Dérivé aminé et acétylé du galactose sur son carbone 2, constituant le premier résidu fixé lors d’une O-glycosylation sur une sérine ou une thréonine par la polypeptide N-acétylgalactosaminyltransférase (EC 2.4.1.41). ENCYCL. : La N-acétylgalactosamine est aussi présente dans certains glycosaminoglycanes (chondroïtine sulfate et dermatane sulfate). C’est le glucide terminal de l’antigène du groupe sanguin A. Formule brute : C₈H₁₅NO₆. Syn. : 2-(Acétylamino)-2-désoxy-D-galactose. Voir Glycosaminoglycane.

N-acétylglucosamine n. f. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre ; de glucos(e) et amine). [N-acetylglucosamine] Abrév. : GlcNAc – Dérivé aminé et acétylé du glucose sur son carbone 2, constituant le premier résidu fixé sur les peptides par une O-glycosylation (sur une sérine ou une thréonine) ou une N-glycosylation (sur l’amide d’une asparagine). ENCYCL. : La N-acétylglucosamine est présente dans certains glycosaminoglycanes (acide hyaluronique et kératane sulfate). La polymérisation linéaire de N-acétylglucosamines unies par des liaisons β-(1,4) forme un homopolysaccarideO.R. appelé chitine. Formule brute : C₈H₁₅NO₆. Syn. : 2-(Acétylamino)-2-désoxy-D-glucose. Voir Glycosaminoglycane.

N-acétylmuramique adj. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre, et murus, mur). [N-acetylmuramic] Sigles : NAM, MurNAc – Voir Acide N-acétylmuramique.

N-acétylneuraminique adj. (de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre). [N-acetylneuraminic] Sigles : NANA, NeuNAc – Voir Acide N acétylneuraminique.

Acétylsérotonine-O-méthyltransférase n. f. [Acetylserotonin-O-methyltransferase] Sigle : ASMT – Enzyme (EC 2.1.1.4, à coenzyme SAM) de la classe des transférases, homodimérique, présente dans l’épiphyse, qui catalyse la méthylation de la N-acétylsérotonine en mélatonine. Syn. : Hydroxyindole-O-méthyltransférase (= HIOMT).

ACh n. f. (abrév.). [ACh] Abréviation de AcétylCholine. Voir cette entrée.

Achaine, Achène → Akène

AChE n. f. (abrév.). [AChE] Abréviation de AcétylCholinEstérase. Voir cette entrée.

Acheb n. m. [prononcer akeb] (de l’arabe). [Acheb] Formation végétale herbacée du Sahara, constituée d’éphémérophytes, qui se développe très rapidement après une averse.

Achénium n. m. [prononcer aké…] (du gr. a-, préfixe privatif, et khainein, s’ouvrir). [Achenium] Syn. désuet de Akène. Voir cette entrée.

Achlamydé, e adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et khlamys, manteau). [Achlamydeous] Syn. : Apérianthé. Voir cette entrée.

Achlorophyllien, enne adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de chlorophylle, du gr. khlôros, vert, et phullon, feuille). [Achlorophyllous] Qui est dépourvu de chlorophylle. Ex. : Orobanchacées, Rhizanthella (F. Orchidacées), monotropes Monotropa (F. Éricacées).

AChR n. m. (sigle). [AChR] Sigle de l’anglais AcetylCholine Receptor. Voir Récepteur de l’acétylcholine.

Achromatique adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et khrôma, couleur). [Achromatic] Qui ne fixe pas ou mal les colorants cytologiques. Ex. : fuseau achromatique (ou mitotique).

Achyrophyte n. f. [prononcer aki] (du gr. achyron, glume, et phuton, plante). [Achyrophyte] Plante glumiflore, c’est-à-dire dont les fleurs possèdent des glumes. Ex. : Poacées.

Acicole adj. (du lat. acicula, aiguille, et colere, habiter). [Acicolous] Qui vit sur les aiguilles des Pinales (Acrogymnospermes), qui s’en nourrit. Ex. : diprions Neodiprion (O. Hyménoptères), mineuse du pin Exoteleia pinifoliella (O. Lépidoptères), processionnaire du pin Thaumetopoea pityocampa (O. Lépidoptères).

Aciculaire adj. (du lat. acicula, aiguille). [Acicular, Aciculate] Qui a la forme d’une aiguille, qui est piquant comme une aiguille. Ex. : feuilles de la majorité des Pinales. Syn. : Linéaire.

Acicule n. m. (du lat. acicula, aiguille). [Aciculum, pl. -la] ► ① Petit aiguillon fin et droit à la surface de certains organes. Attention, acicule est du genre masculin. Ex. : acicules des tiges et feuilles des rosiers Rosa (F. Rosacées) ;

► ② Chacune des baguettes squelettiques chitineuses reliées à la musculature parapodiale (muscles aciculaires) et qui soutiennent les parapodes des Annélides Polychètes. Attention, acicule est du genre masculin.

Aciculifolié, e adj. (du lat. acicula, aiguille ; empr. au lat. foliatus, feuillu). [Aciculifoliate] Se dit d’une plante dont les feuilles sont en aiguilles, et de la formation végétale qui est constituée de telles plantes.

Aciculisylve ou Aciculisilve n. f. (du lat. acicula, aiguille, et silva, forêt). [Aciculisylvae] Dans la classification des formations végétales de Rübel (1930), un des types de forêt, caractérisé par les conifères (à aiguilles), dans les régions tempérées à froides, surtout dans l’hémisphère Nord. Ex. : abiétaie, cembraie, pinède, taïga. Syn. : Conisylve.

Acide n. m. et adj. (empr. au lat. acidus, aigre, acide). [Acid] ► ① n. m. Dans la théorie de Brønsted-Lowry (1923), ion, molécule capable de céder un ion hydrogène ou hydron H⁺ à la base conjuguée d’un couple acidobasique. ENCYCL. : On peut distinguer de nombreux types d’acides :

a. selon le nombre de protons libérables par l’acide, on distingue les monoacides, les diacides (ex. : H₂SO₄), les triacides (ex. : H₃PO₄) ;

b. selon leur capacité à céder leur proton, on distingue les acides forts qui libèrent facilement leur proton (ex. : acide chlorhydrique HCl), et les acides faibles (acides carboxyliques) qui ne le cèdent pas facilement ;

c. selon leur composition, on distingue les hydracides composés d’hydrogène et d’un non-métal (ex. : acides chlorhydrique HCl, sulfhydrique H₂S) et les oxacides composés d’hydrogène et d’oxygène (ex. : acide sulfurique H₂SO₄) ;

d. selon leur groupe chimique :

– les acides carboxyliques possèdent un ou plusieurs groupes carboxyle –COOH ;

– les acides aminés possèdent au moins une fonction acide et une fonction amine ;

– les acides gras sont formés d’une chaineO.R. hydrocarbonée et sont dits saturés ou insaturés selon la saturation en hydrogène des atomes de carbone de leur chaine ;

– les acides nucléiques (ADN, ARN) sont composés d’oses (ribose ou désoxyribose), de bases azotées et de phosphates ;

► ② n. m. Dans la théorie de Lewis (1923 également), tout corps qui accepte un doublet électronique (= paire d’électrons), et qui doit donc avoir une orbitale vide. Un tel corps est dit électrophile. Ex. : cations métalliques ;

► ③ n. m. Une des saveurs primaires, reconnue par tous les bourgeons gustatifs de la langue. ENCYCL. : L’entrée des protons dans les cellules gustatives par des canaux cationiques de la membrane apicale entraineO.R. la dépolarisation de la cellule ce qui provoque la libération synaptique de sérotonine ;

► ④ adj. Relatif aux acides, au goût acide, qui a les propriétés des acides.

Acide abscissique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de abscission, du lat. abscessio, action de s’éloigner). [Abscisic acid] Sigle : ABA – Phytohormone sesquiterpénique (à 15 C) des végétaux supérieurs, synthétisée à partir de caroténoïdes en période de conditions défavorables pendant laquelle il joue un rôle important dans la réponse à divers stress comme la sècheresseO.R., le froid, les agents pathogènes. Formule brute : C₁₅H₂₀O₄. Syn. anciens : Abscissine (1963, impliquée dans l’abscission des feuilles de cotonnier), Dormine (Wareing 1949, impliquée dans la dormance des bourgeons de frêne).

Acide acétique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. acetum, vinaigre, et suff. -ique). [Acetic acid] Syn. : Acétate (base conjuguée). Voir cette entrée.

Acide acétoacétique ou acétylacétique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. acetum, vinaigre, et suff. -ique). [Acetoacetic ou Acetylacetic acid] Syn. : Acétoacétate (base conjuguée). Voir cette entrée.

Acide N-acétylmuramique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre ; du lat. murus, mur). [N-acetylmuramic acid] Sigles : NAM, MurNAc – Dans le peptidoglycane de la paroi des Bactéries, composé lié par une liaison glycosidique β-(1,4) à la N-acétylglucosamine, ce qui constitue les unités diosidiques des longues chainesO.R. polyosidiques du peptidoglycane. Formule brute : C₁₁H₁₉NO₈.

Acide N-acétylneuraminique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de acét(ique), du lat. acetum, vinaigre ; du gr. neuron, nerf, et amine). [N-acetylneuraminic acid] Sigles : NANA, NeuNAc – Acide sialique obtenu par condensation d’une N-acétylmannosamine et d’un pyruvate, présent dans les gangliosides, les glycosaminoglycanes, les glycoprotéines. Formule brute : C₁₁H₁₉NO₉.

Acide adénylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de adénine, du gr. adên, glande, et suff. -ylique). [Adenylic acid] Syn. : Adénosine-5’-monophosphate (= AMP), Adénylate. Voir AMP, Ribonucléotide.

Acide-alcool n. m. (empr. au lat. acidus, acide ; empr. au lat. alcohol, substance produite par une distillation totale, lui-même empr. à l’ar. āl-kuhl, la poudre d’antimoine). [Acid alcohol] Substance organique possédant au moins une fonction acide (groupe carboxylique –COOH) et une fonction alcool (groupe hydroxyle –OH). Ex. : acide malique HOOC–CH₂–CHOH–COOH (diacide-monoalcool), acide tartrique HOOC–CHOH–CHOH–COOH (diacide-dialcool).

Acide alginique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de algine, du lat. alga, algue). [Alginic acid] Chez les Straménopiles Phéophycées (= algues brunes), polyoside linéaire composé de deux acides hexuroniques, le β-D-mannuronate et le α-L-guluronate, dans des proportions qui dépendent de l’espèce algale. ENCYCL. : Ils sont présents sous forme de sels appelés alginates (ex. : alginate de calcium, de potassium) et forment au contact de l’eau un gel incolore ce qui favorise la rétention d’eau. Formule brute : (C₆H₈O₆)n. Syn. : Alginate.

Acide allantoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; de allantoïne, du gr. allas, boyaux, où elle a été découverte). [Allantoic acid] Acide diaminocarboxylique résultant du catabolisme des nucléotides puriques ((d)AMP et (d)GMP) ou d’une purine, chez les espèces qui possèdent les enzymes nécessaires. ENCYCL. : L’acide allantoïque est excrété chez les Téléostéens et certains Hexapodes. Chez les Chondrichtyens et les Anoures, il est hydrolysé en deux urées H₂N–CO–NH₂et un glyoxylate OHC–COOH grâce à une allantoïcase (EC 3.5.3.4).

Chez les plantes symbiotiques à uréides (ex. : nombreuses Fabacées dont le haricot et le soja), l’acide allantoïque est une forme importante de transport de l’azote réduit, à partir des bactéroïdes des nodosités symbiotiques fixatrices de diazote. L’acide allantoïque sera catabolisé dans les cellules-puits en 4 NH₃, 2 CO₂ et un glyoxylate qui sera transaminé en alanine. Formule : (H₂N–CO–NH)₂–CH–COOH. Syn. : Acide 2,2-diuréidoacétique, Acide 2,2-bis(carbamylamino)acétique (nom IUPAC).

Acide aminé m. (empr. au lat. acidus, acide ; de am(moniac) et suff. -ine). [Amino acid] Composé organique ubiquitaire jouant de très nombreux rôles chez tous les êtres vivants, comportant au moins un groupe carboxyle –COO– et un groupe amine primaire –NH₃⁺ tous deux portés par le carbone α ou C2 (le C1 étant carboxylique). ENCYCL. : Il en existe plusieurs centaines, mais seule une trentaine sont protéinogènes dont 23 sont codés génétiquement. Les acides aminés possèdent :

– un rôle structural et réactionnel car ce sont les monomères des peptides et des protéines structurales et enzymatiques ;

– un rôle métabolique (ex. : la glycine participant à la formation de la créatine et des purines, la cystéine donnant la taurine des sels biliaires) ;

– un rôle fonctionnel car ils fournissent des molécules d’intérêt biologique (ex. : la tyrosine donnant les hormones thyroïdiennes et les catécholamines) ;

– un rôle énergétique car ils peuvent servir de substrats énergétiques aux côtés du glucose, des acides gras et des corps cétoniques : ce sont les acides aminés glucoformateurs (19 parmi les 20 principaux, pas la leucine) et cétoformateurs (6 a. a. : leucine, isoleucine, lysine, phénylalanine, tryptophane et tyrosine).

En plus des 20 acides aminés principaux, il existe quelques autres acides aminés qui en sont dérivés par des modifications post-traductionnelles, protéinogènes aussi mais plus rares. Ex. : 5-hydroxylysine et 4-hydroxyproline dans le collagène, triiodothyronine (T3) et thyroxine (T4) (hormones thyroïdiennes), ε-N-acétyllysine dans les histones. Syn. : Aminoacide.

Acide a-aminoacétique m. (empr. au lat. acidus, acide). [α-Aminoacetic acid] Syn. : Glycine. Voir cette entrée.

Acide 4-aminobutanoïque m. (empr. au lat. acidus, acide). [4-Aminobutanoic acid] Syn. : Acide γ-aminobutyrique. Voir GABA.

Acide g-aminobutyrique m. (empr. au lat. acidus, acide). [γ-Aminobutyric acid] Abrév. : GABA. Voir cette entrée.

Acide 1-aminocyclopropane-1-carboxylique m. (empr. au lat. acidus, acide). [1-Aminocyclopropane-1-carboxylic acid] Abrév. : ACC. Voir cette entrée.

Acide 2-aminopropanoïque m. (empr. au lat. acidus, acide). [2-Aminopropanoic acid] Syn. : α-Alanine. Voir cette entrée.

Acide arachidonique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de arachide). [Arachidonic acid] Acide gras polyinsaturé à quatre doubles liaisons (C20:4, ω-6 tout-cis) présent dans les phospholipides membranaires dont il est détaché par une phospholipase A2 (EC 3.1.1.4). ENCYCL. : L’acide arachidonique est un précurseur des eicosanoïdes :

– il est précurseur de la prostaglandine H2 grâce à la prostaglandine H2 synthase (EC 1.14.99.1), elle-même précurseur des prostaglandines, des prostacyclines et des thromboxanes. L’aspirine ou acide acétylsalicylique inactive irréversiblement cette enzyme en acétylant le résidu sérine 529 ;

– il est précurseur de l’HPETE (= acide HydroxyPeroxyEicosaTétraÉnoïque) grâce à la 5-lipoxygénase (EC 1.13.11.34), lui-même précurseur des leucotriènes.

Formule brute : C₂₀H₃₂O₂. Syn. : Acide 5Z, 8Z, 11Z, 14Z-eicosatétraénoïque.

Acide L-ascorbique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. a-, préfixe privatif, et de scorb(ut)). [Ascorbic acid] γ-Lactone (= hétérocycle à 4 carbones), antiscorbutique, fortement antioxydante, très répandue dans les règnes végétal et animal où elle est synthétisée à partir du L-galactose (végétaux) et de l’acide glucuronique (animaux). ENCYCL. : Quelques Vertébrés comme les Primates Haplorrhiniens (mais les Strepsirrhiniens le synthétisent), les Caviidés (cobayes, maras, capybaras), les chauvesourisO.R. frugivores, ne peuvent pas le synthétiser car il leur manque une enzyme fonctionnelle, la L-gulono-γ-lactone déshydrogénase. Le couple redox ascorbate/déshydroascorbate est une coenzyme donneuse d’électrons pour plusieurs enzymes. Formule brute : C₆H₈O₆. Syn. : Ascorbate, Vitamine C, Vitamine antiscorbutique, Acide oxo-3-L-gulofuranolactone.

Acide L-aspartique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. asparagus, asperge). [Aspartic acid] Symb. : Asp, D – Voir Aspartate.

Acide benzoylaminoacétique ou benzoylaminoéthanoïque m. (empr. au lat. acidus, acide). [Benzoylaminoacetic ou Benzoylaminoethanoic acid] Syn. : Acide hippurique. Voir cette entrée.

Acide biliaire m. (empr. au lat. acidus, acide ; de bile, du lat. bilis). [Bile acid] Groupe de stéroïdes carboxyliques présents dans le foie et la bile, déversés dans le duodénum, constituant ainsi une voie d’élimination du cholestérol. ENCYCL. : Ils solubilisent les acides gras et les monoglycérides sous forme de micelles grâce à leur caractère amphiphile (une partie liposoluble, le stérol, et une partie hydrosoluble, la taurine et la glycine). Les acides biliaires primaires, surtout les acides cholique et chénodésoxycholique, sont synthétisés dans les hépatocytes par hydroxylation du cholestérol. Pour augmenter leur hydrosolubilité, les acides biliaires primaires sont activés par une coenzyme A puis conjugués avec la glycine (acide aminé) ou avec la taurine (dérivé de la cystéine) par une liaison amide (–CO–NH–) avec le carboxyle des acides biliaires.

Acide 2,3-bisphosphoglycérique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. bis, deux fois, phospho(re) et glycérique). [2,3-Bisphosphoglyceric acid] Sigle : 2,3-BPG – Voir 2,3-Bisphosphoglycérate.

Acide butanedioïque m. (empr. au lat. acidus, acide). [Butanedioic acid] Syn. : Acide succinique. Voir Succinate.

Acide caprique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. capra, chèvre). [Capric acid] Acide gras saturé (C10:0) présent dans le lait, l’huile de coco, l’huile de palme, et constitutif des phéromones de Liolaemus (Iguaniens), de divers Insectes et de Mammifères Félidés. Formule : H₃C–(CH₂)₈–COOH. Syn. : Acide décanoïque (nom IUPAC).

Acide caproïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. capra, chèvre). [Caproic acid] Acide gras saturé (C6:0) présent dans le lait, les huiles essentielles, et constitutif des phéromones de Liolaemus (Iguaniens), de Hemidactylus (F. Gekkonidés), de divers Insectes et Mammifères. Formule : H₃C–(CH₂)₄–COOH. Syn. : Acide hexanoïque (nom IUPAC).

Acide caprylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. capra, chèvre). [Caprylic acid] Acide gras saturé (C8:0) présent dans le lait, l’huile de coco, l’huile de palme, et constitutif des phéromones de Liolaemus (Iguanes) et de divers Insectes et Mammifères. Formule : H₃C–(CH₂)₆–COOH. Syn. : Acide octanoïque (nom IUPAC).

Acide cérébronique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. cerebrum, cerveau). [Cerebronic acid] Acide gras saturé α-hydroxylé (à –OH sur le C2) à 24 carbones (C24:0, OH), entrant dans la composition des cérébrosides ou monoglycosylcéramides (= glycosphingolipides liés à un ose). Syn. : Acide 2-hydroxytétracosanoïque.

Acide α-cétoglutarique m. (empr. au lat. acidus, acide ; céto(ne) ; mot-valise, de glu(tamique) et (tar)tarique). [α-Ketoglutaric acid] Syn. : α-Cétoglutarate. Voir cette entrée.

Acide cétonique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de céto(ne)). [Cetonic acid] Syn : Cétoacide. Voir cette entrée.

Acide chénodésoxycholique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. khên, khênos, oie ; du lat. dis-, préfixe privatif, et oxy(gène) ; du gr. kholê, bile). [Chenodeoxycholic acid] Un des deux acides biliaires primaires principaux (l’autre étant l’acide cholique) synthétisé dans les hépatocytes par hydroxylation du cholestérol par une cholestérol 7-α-hydroxylase (EC 1.14.13.17). ENCYCL. : Pour augmenter son hydrosolubilité, il est activé par une coenzyme A puis conjugué soit avec la glycine (acide aminé) soit avec la taurine (dérivé de la cystéine). Ces conjugués sont excrétés dans la bile puis dans l’intestin grêle où ils donnent des sels biliaires de sodium et de potassium hydrosolubles, le glycochénodésoxycholate et le taurochénodésoxycholate. Formule brute : C₂₄H₄₀O₄. Syn. : Chénodésoxycholate. Voir Acide biliaire.

Acide 4-chloro-indole-3-acétique m. (empr. au lat. acidus, acide). [4-Chloroindole-3-acetic acid] Voir Acide indole-3-acétique.

Acide cholique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. kholê, bile). [Cholic acid] Un des deux acides biliaires primaires principaux (l’autre étant l’acide chénodésoxycholique) synthétisé dans les hépatocytes par une double hydroxylation du cholestérol par la 7-α-hydroxylase (sur le C7) puis la 12-α-hydroxylase (sur le C12). ENCYCL. : Pour augmenter son hydrosolubilité, il est activé par une coenzyme A puis conjugué soit avec la glycine (acide aminé) soit avec la taurine (dérivé de la cystéine). Ces conjugués sont excrétés dans la bile puis dans l’intestin grêle où ils donnent des sels biliaires de sodium et de potassium hydrosolubles, le glycocholate et le taurocholate. Formule brute : C₂₄H₄₀O₅. Syn. : Cholate. Voir Acide biliaire.

Acide citrique m. (1782, empr. au lat. acidus, acide ; du lat. citrus, dans lequel il a été découvert, et suff. -ique). [Citric acid] Syn. : Citrate. Voir cette entrée.

Acide cyanhydrique m. [découvert en 1752 dans le bleu de Prusse par Pierre Macquer, chimiste français 1718–1784] (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. kuanos, bleu, et hudôr, eau). [Hydrocyanic acid] Solution aqueuse de cyanure d’hydrogène H–C≡N, composé volatil très toxique présent sous forme d’hétérosides cyanogènes dans une centaine de familles de plantes où il joue un rôle défensif contre les herbivores. ENCYCL. : Les précurseurs du nitrile ≡N sont divers acides aminés comme la phénylalanine pour l’amygdaloside (Rosacées), la valine pour le linamaroside (lin, manioc) et la tyrosine pour le dhurroside (sorgoO.R.). Syn. : Cyanure d’hydrogène (forme gazeuse), Formonitrile, Acide prussique (de bleu de Prusse).

Acide cytidylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de cytid(ine), et suff. -ylique). [Cytidylic acid] Syn. : Cytidine-5’-monophosphate (= CMP). Voir cette entrée.

Acide déshydroascorbique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, et hydro(gène) ; du gr. a-, préfixe privatif, et scorb(ut)). [Dehydroascorbic acid] Voir Acide ascorbique.

Acide désoxyadénylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, et oxy(gène) ; adén(osine), et suff. -ylique). [Deoxyadenylic acid] Syn. : Désoxyadénosine-5’-monophosphate (= dAMP). Voir cette entrée.

Acide désoxycholique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, et oxy(gène) ; du gr. kholê, bile). [Deoxycholic acid] Acide biliaire secondaire formé par les bactéries intestinales (Clostridium, Eubacterium) par déconjugaison par une hydrolase spécifique et par 7-α-déshydroxylation des sels biliaires glycocholate et taurocholate. ENCYCL. : Au cours du cycle biliaire entéro-hépatique ou cycle biliaire de Schiff, l’acide désoxycholique rejoint, par la circulation portale, le foie où il est conjugué en acides glycodésoxycholique et taurodésoxycholique qui seront excrétés dans la bile, puis réabsorbés. Voir Acide biliaire, Acide cholique.

Acide désoxycytidylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, et oxy(gène) ; cytid(ine), et suff. -ylique). [Deoxycytidylic acid] Syn. : Désoxycytidine-5’-monophosphate (= dCMP). Voir cette entrée.

Acide désoxyguanylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, et oxy(gène), guan(osine), et suff. -ylique). [Deoxyguanylic acid] Syn. : Désoxyguanosine-5’-monophosphate (= dGMP). Voir cette entrée.

Acide désoxyribonucléique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, oxy(gène), ribo(se) ; du lat. nucleus, noyau). [Deoxyribonucleic acid] Syn. : ADN. Voir cette entrée.

Acide désoxythymidylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, oxy(gène), thymid(ine), et suff. -ylique). [Deoxythymidylic acid] Syn. : Thymidine-5’-monophosphate (= dTMP). Voir cette entrée.

Acide désoxyuridylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat dis-, préfixe privatif, oxy(gène), urid(ine), et suff. -ylique). [Deoxyuridylic acid] Syn. : Désoxyuridine-5’-monophosphate (= dUMP). Voir cette entrée.

Acide diaminopimélique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du préf. lat. di-, marquant la dualité, et amine ; du gr. pimeles, gras). [Diaminopimelic acid] Voir Acide méso-diaminopimélique.

Acide dipicolinique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. di-, deux fois ; de picoline = méthylpyridine). [Dipicolinic acid] Chez les Bactéries à Gram positif et sporulantes (Bacillus, Clostridium, Sporosarcina), diacide pyridinique présent en grande quantité dans le cortex des endospores sous forme de dipicolinate de calcium, impliqué dans la stabilisation de l’ADN et des ARN en cas de dessiccation et de température élevée. Formule : HOOC–[C₅H₃N]–COOH. Syn. : Acide pyridine-2,6-dicarboxylique (nom IUPAC).

Acide 6,8-dithiooctanoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. di-, deux fois, theion, soufre ; du lat. octo, huit). [6,8-Dithiooctanoic acid] Syn. : Acide lipoïque. Voir cette entrée.

Acide férulique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du genre Ferula, mot lat., férule (F. Apiacées)). [Ferulic acid] Phénylpropanoïde (donc à motif 6C–3C) lié aux polyosides et aux lignines des parois cellulosiques végétales, des téguments des grains de céréales et des graines de certains fruits charnus. ENCYCL. : L’acide férulique est issu de la méthoxylation de l’acide caféique par la caféate O-méthyltransférase (EC 2.1.1.68). Il estérifie les polyosides pariétaux et sert ainsi de site pour l’intussusception des lignines dans la trame polyosidique lors de la lignification des parois. C’est un inhibiteur volatil naturel de la levée de dormance. La levée de dormance a lieu quand l’altération des téguments de la graine permet la volatilisation de l’acide férulique. Formule brute : C₁₀H₁₀O₄. Syn. : Férulate (base conjuguée), Acide coniférique, Acide 3-méthoxy-4-hydroxycinnamique, Acide 3-(4-hydroxy-3-méthoxyphényl)prop-2-énoïque (nom IUPAC).

Acide folique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. folium, feuille (d’épinard), où il a été découvert). [Folic acid] Vitamine B₉ hydrosoluble, ptéridine du para-aminobenzoate et du glutamate. ENCYCL. : Sa forme active, l’acide tétrahydrofolique ou tétrahydrofolate (= THF ou FH4) est tétrahydrogénée au niveau du noyau ptéridine. Le tétrahydrofolate est une coenzyme qui intervient dans plusieurs réactions métaboliques comme la synthèse des nucléotides puriques, la synthèse du dTMP (= désoxythymidine-5’-monophosphate) et l’interconversion de la sérine en glycine. L’acide folique est apporté par l’alimentation sous forme de polyglutamylfolates, surtout dans la levure de bière, le foie, le jaune d’œuf, les châtaignes, les noisettes, les légumes-feuilles. Formule brute : C₁₉H₁₉N₇O₆. Syn. : Vitamine B₉, Vitamine M (désuet), Acide ptéroylglutamique, Folacine.

Acide fumarique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du genre Fumaria, fumeterreF (F. Papavéracées), d’où il a été isolé). [Fumaric acid] Syn. : Fumarate (base conjuguée). Voir cette entrée.

Acide galacturonique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de galact(ose), et uronique, du gr. oûron, urine). [Galacturonic acid] Acide hexuronique, composant principal des pectines, formant des polymères associés à des rhamnoses, les rhamnogalacturonanes. Formule brute : C₆H₁₀O₇. Syn. : Galacturonate (base conjuguée), Acide (2S,3R,4S,5R)-tétrahydroxy-6-oxohexanoïque (nom IUPAC).

Acide gallique m. [isolé et nommé par Henri Braconnot, botaniste et chimiste français 1780–1855] (empr. au lat. acidus, acide ; de galle, où il a été isolé). [Gallic acid] Acide phénolique à motif 6C–1C entrant dans la composition des tanins hydrolysables (glucose estérifié par plusieurs acides galliques en positions 1, 2, 3, 4 et 6), présent dans les plantes, les fruits (surtout les châtaignes) et les galles. Formule : [C₆H₂](OH)₃–COOH. Syn. : Gallate (base conjuguée), Acide 3,4,5-trihydroxybenzoïque (nom IUPAC).

Acide glucuronique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de gluc(ose), et uronique, du gr. oûron, urine). [Glucuronic acid] Syn. : Glucuronate. Voir cette entrée.

Acide glutamique m. (empr. au lat. acidus, acide ; mot-valise, de glut(en) et am(ine)). [Glutamic acid] Syn. : Glutamate. Voir cette entrée.

Acide glycocholique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de glyc(ine), et cholique, du gr. kholê, bile). [Glycocholic acid] Un des acides biliaires primaires, obtenus par conjugaison de l’acide cholique avec la glycine ce qui augmente la solubilité de l’acide cholique. Ne pas confondre avec Acide glycolique. Voir Acide biliaire et Acide cholique.

Acide glycolique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de glycol). [Glycolic acid] Le plus petit des acides α-hydroxylés, constituant un métabolite intermédiaire de la photorespiration, issu de la déphosphorylation dans le chloroplate du phosphoglycocholate, lui-même issu de l’oxydation du ribulose-1,5-bisphosphate par la fonction oxygénase de la rubisco. ENCYCL. : Le glycolate migre ensuite dans les peroxysomes (mais il est excrété chez les algues) où il est oxydé en glyoxylate CHO–COOH par la glycolate déshydrogénase (EC 1.1.99.14), le glyoxylate étant le précurseur de la glycine. Formule : HOCH₂–COOH. Ne pas confondre avec Acide glycocholique. Syn. : Acide hydroxyacétique, Acide hydroxyéthanoïque.

Acide glyoxylique m. (empr. au lat. acidus, acide). [Glyoxylic acid] Syn. : Glyoxylate. Voir cette entrée.

Acide gras m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. crassus, épais, gras). [Fatty acid] Acide carboxylique lipidique à chaineO.R. hydrocarbonée aliphatique (c’est-à-dire sans noyau aromatique), apolaire et hydrophobe, saturée ou non, le plus souvent acyclique et non ramifiée. ENCYCL. : On les rencontre rarement à l’état libre (voir Acide gras libre) mais plutôt estérifiés par un alcool : le glycérol dans les glycérolipides, la sphingosine, la dihydrosphingosine ou la phytosphingosine dans les sphingolipides. Les acides gras ont plusieurs rôles :

– un rôle structural : ils forment les phospholipides des membranes ;

– un rôle physiologique : des dérivés d’acides gras insaturés sont des messagers cellulaires ou des hormones : acides jasmoniques (octadécanoïdes), diacylglycérol, prostaglandines, thromboxanes, leucotriènes ;

– un rôle énergétique : l’oxydation des acides gras fournit de l’acétyl-coenzyme A qui rejoint le cycle du citrate ou la cétogenèse.

Selon le nombre de doubles liaisons C=C et d’autres caractéristiques biochimiques, on distingue :

a. les acides gras saturés dont toutes les liaisons carbone-carbone sont simples, ce qui permet une liberté de rotation de chaque liaison donc une souplesse de la molécule.

b. les acides gras insaturés :

– alcéniques (à liaison C=C double) mono-insaturés (= monoènes) et polyinsaturés (= polyènes) ;

– alcyniques (à liaison C≡C triple) mono-insaturés (= monoynes) et polyinsaturés (= polyynes).

Les acides gras essentiels (= AGE, anciennement vitamine F) pour les humains, c’est-à-dire qu’il ne peut synthétiser par lui-même, sont :

– l’acide α-linolénique (C18:3, ω-3 tout-cis) précurseur des acides gras oméga-3 ;

– l’acide linoléique (C18:2, ω-6 tout-cis) précurseur des acides gras oméga-6.

Acide gras à très longue chaine m. (empr. au lat. acidus, acide). [Very long chain fatty acid (= VLCFA)] Sigle : AGTLC – Groupe d’acides gras dont la chaineO.R. aliphatique comporte au moins 22 atomes de carbone, présents surtout dans les cires (cérides). ENCYCL. : Contrairement aux autres acides gras, ils ne sont pas catabolisés dans les mitochondries mais dans les peroxysomes. Ex. : acide cérotique (C26:0), acide ximénique (C26:1), acide carbocérique (C27:0) acide montanique (C28:0), acide mélissique (C30:0), acide laccéroïque (C32:0).

Acide gras libre m. (empr. au lat. acidus, acide). [Free fatty acid (= FFA)] Sigle : AGL – Acide gras non associé à une autre molécule, mais cependant lié à la sérumalbumine lors de son transport plasmatique. ENCYCL. : Ils représentent environ 5 % des acides gras totaux. Chez les humains, les acides gras libres sont surtout les acides palmitique (C16:0), stéarique (C18:0), oléique (C18:1) et linoléique (C18:2). Syn. : Acide gras non estérifié (= AGNE).

Acide gras non estérifié m. (empr. au lat. acidus, acide). [Non esterified fatty acid (= NEFA)] Syn. : Acide gras libre (= AGL). Voir cette entrée.

Acide guanylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de guanine, de guano, empr. à l’esp. guano, lui-même empr. au quechua huano, fumier). [Guanylic acid] Syn. : Guanosine-5’-monophosphate (= GMP). Voir GMP.

Acide hippurique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. hippos, cheval, et du lat. urina, urine). [Hippuric acid] Acide carboxylique issu de la conjugaison hépatique de l’acide benzoïque [C₆H₅]–COOH et de la glycine H₂N–CH₂–COOH, excrété dans l’urine et constituant une forme d’élimination de l’acide benzoïque. Formule : [C₆H₅]–CO–NH–CH₂–COOH. Syn. : Acide benzoylaminoéthanoïque (nom IUPAC).

Acide hyaluronique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. hualos, verre (car isolé de l’humeur vitrée de l’œil) ; uronique, du gr. oûron, urine). [Hyaluronic acid] Glycosaminoglycane non sulfaté présent dans la matrice extracellulaire de nombreux tissus conjonctifs. ENCYCL. : Il est formé d’un long polymère linéaire de plusieurs milliers d’unités diosidiques d’acide β-D-glucuronique-(1,3)-N-acétyl-D-glucosamine, reliées entre elles par des liaisons β-(1,4). C’est le seul glycosaminoglycane non sulfaté et non conjugué à une protéine. Les groupes carboxyles anioniques (COO–) attirent les molécules d’eau, les polymères ainsi hydratés s’enchevêtrant et formant un gel visqueux. Cette caractéristique confère aux tissus conjonctifs une résistance aux forces mécaniques, et au liquide synovial un rôle de lubrification. Formule brute : (C₁₄H₂₁NO₁₁)n. Syn. : Hyaluronate, Hyaluronane.

Acide 2-hydroxytétracosanoïque m. (empr. au lat. acidus, acide). [2-Hydroxytetracosanoic acid] Syn. : Acide cérébronique. Voir cette entrée.

Acide L-iduronique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de id(ose), et uronique, du gr. oûron, urine). [Iduronic acid] Abrév. : IdoA – Acide uronique hexopyranosique entrant dans la composition des glycosaminoglycanes comme le dermatane sulfate, l’héparine et l’héparane sulfate. Formule : O=CH–(CHOH)₄–COOH. Syn. : Acide L-idopyranuronique (nom IUPAC).

Acide indole-3-acétique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de l’all. Indol, de ind(igo), et suff. -ol). [Indole-3-acetic acid (= IAA)] Sigle : AIA – Acide carboxylique phytohormonal de la classe des auxines, synthétisé à partir du tryptophane dans les méristèmes apicaux et intercalaires des racines et des tiges, dans les jeunes feuilles, dans le tube pollinique, dans les graines en formation. ENCYCL. : Comme toute auxine, il induit l’auxèse, la mérèse, la rhizogenèse (mais inhibe l’auxèse racinaire), la floraison des plantes de jours courts, le développement du fruit, le phototropisme, le gravitropisme. Formule : [C₈H₆N]–CH₂–COOH. Syn. : Acide 2-(1H- indol-3-yl)acétique (nom IUPAC), Acide indolylacétique. Voir.

Acide inosinique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de inosine, du gr. is, inos, fibre). [Inosinic acid] Syn. : Inosine-5’-monophosphate (= IMP). Voir cette entrée.

Acide isocitrique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. isos, égal ; du lat. citrus, citron, dans lequel il a été découvert, et suff. -ique). [Isocitric acid] Syn. : Isocitrate. Voir cette entrée.

Acide jasmonique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de jasmone, de jasmin). [Jasmonic acid] Syn. : Jasmonate. Voir cette entrée.

Acide kaïnique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de Kainin-sou, nom japonais de la Rhodophyte Digenea simplex). [Kainic acid] Syn. : Kaïnate. Voir cette entrée.

Acide lactique m. (1787, empr. au lat. acidus, acide ; du lat. lac, lactis, lait). [Lactic acid] Syn. : Lactate. Voir cette entrée.

Acide laurique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. laurus, laurier). [Lauric acid] Acide gras saturé à moyenne chaineO.R. (C12:0) présent dans certaines graisses végétales (huiles de coco, de palmiste, de laurier) et dans le lait. ENCYCL. : L’acide laurique a des propriétés antimicrobienne et hypercholestérolémiante (surtout une augmentation du taux de HDL ou « bon » cholestérol). C’est aussi un composant des phéromones de certains Insectes, de Félidés, de Squamates (Hemidactylus, Liolaemus, Lacerta). Formule : CH₃–(CH₂)₁₀–COOH. Syn. : Laurate, Acide dodécanoïque (nom IUPAC), Acide dodécylique.

Acide lignocérique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de lign(ine) ; du lat. cera, cire). [Lignoceric acid] Acide gras saturé à très longue chaineO.R. (C24:0) entrant dans la composition des sphingomyélines (phosphosphingolipides à choline) et des cérébrosides (monoglycosylcéramides), et composant des phéromones de Squamates. Formule : H₃C–(CH₂)₂₂–COOH. Syn. : Acide tétracosanoïque (nom IUPAC).

Acide linoléique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. linum, lin, et oleum, huile). [Linoleic acid] Acide gras polyinsaturé à longue chaineO.R. (C18:2, ω-6 tout-cis), essentiel, présent dans les huiles végétales (colza, lin), constitutif des glycérophospholipides, et composant des phéromones de divers Insectes et Acariens, et de Carnivores Félidés et Mustélidés. Syn. : Acide (9Z,12Z)-octadécadiénoïque (nom IUPAC).

Acide linolénique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. linum, lin, et oleum, huile). [Linolenic acid] Acide gras polyinsaturé à longue chaineO.R. (C18:3), essentiel, présent dans les végétaux verts, les noix, les graines, les huiles végétales. ENCYCL. : On distingue deux acides linoléniques en fonction de la position des doubles liaisons :

a. l’acide α-linolénique (C18:3, ω-3 tout-cis), abondant dans les graines (et huiles) de kiwi, de lin, de soja, et dans les membranes des thylacoïdes. Il est le précurseur des acides jasmoniques. C’est aussi un composant des phéromones d’Hyménoptères Apidés. Syn. : Acide (9Z,12Z,15Z)-octadécatriénoïque (nom IUPAC) ;

b. l’acide γ-linolénique (C18:3, ω-6 tout-cis), abondant dans les graines (et huiles) de colza, de cassis, d’onagre bisannuelle. Il est le précurseur de l’acide dihomo-γ-linolénique, lui-même précurseur de la prostaglandine PGH1. Syn. : Acide (6Z,9Z,12Z)-octadécatriénoïque (nom IUPAC).

Acide lipoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; de lip(ide), et suff. -oïque). [Lipoic acid] Acide gras à huit atomes de carbone, portant un hétérocycle dithiolane (c’est-à-dire à deux soufres), et constituant la coenzyme d’au moins cinq complexes enzymatiques de décarboxylation oxydative dont le complexe pyruvate déshydrogénase (le pyruvate donne l’acétyl-CoA) et le complexe α-cétoglutarate déshydrogénase (l’α-cétoglutarate donne le succinyl-CoA). Formule : [C₃H₅S₂]–(CH₂)₄–COOH. Syn. : Lipoate, Coenzyme lipoïque, Acide 6,8-dithiooctanoïque, Acide thioctique, Acide 5-(1,2-dithiolan-3-yl)- pentanoïque (nom IUPAC).

Acide malique m. [découvert dans la pomme en 1785 par Carl Wilhelm Scheele, pharmacien chimiste suédois-allemand 1742–1786] (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. malum, pomme, où il a été découvert). [Malic acid] Syn. : Malate. Voir cette entrée.

Acide méso-diaminopimélique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. di-, deux fois, amin(e), et du gr. pimeles, gras). [Meso-diaminopimelic acid] Abrév. : DAP – Acide diaminé, dérivé ε-carboxylé de la lysine, non protéinogène, constitutif du tétrapeptide du peptidoglycane de la plupart des Bactéries à Gram négatif et de nombreuses Bactéries à Gram positif. ENCYCL. : Chez certaines Bactéries à Gram positif, l’acide diaminopimélique est remplacé par la L-lysine. Le pontage entre deux tétrapeptides de deux chainesO.R. de peptidoglycane a lieu entre le carboxyle de la D-alanine terminale et l’amine ε de l’acide diaminopimélique d’une autre chaine. Formule : C₇H₁₄N₂O₄. Syn. : Acide 2,6-diaminoheptanedioïque (nom IUPAC).

Acide N-méthylguanidoacétique m. (empr. au lat. acidus, acide). [N-methylguanidoacetic acid] Syn. : Créatine. Voir cette entrée.

Acide mévalonique m. (empr. au lat. acidus, acide ; contraction de (dihydroxy)mé(thyl)val(erolact)on(e), et suff. -ique). [Mevalonic acid] Précurseur métabolique de l’IPP (= IsopenténylPyroPhosphate) par la voie du mévalonate, synthétisé par une double réduction de l’HMG-CoA (= 3-Hydroxy-3-MéthylGlutaryl-Coenzyme A) par une HMG-CoA réductase. ENCYCL. : L’IPP et le DMAPP (= diméthylallyl-pyrophosphate) sont les précurseurs du géranylpyrophosphate (en C10) donc des composés qui en sont issus appelés lipides prénylés (terpénoïdes, quinones prénylées, polyprénols). Formule : HOCH₂–CH₂–COH(CH₃)–CH₂–COOH. Syn. : Mévalonate (base conjuguée), Acide (3R)-3,5-dihydroxy-3-méthylpentanoïque (nom IUPAC).

Acide mycolique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de Myco(bacterium), et suff. -lique). [Mycolic acid] Famille de plusieurs centaines d’acides gras complexes, à très longue chaineO.R. (de 60 à 90 C), composants majeurs de la paroi de certaines Bactéries comme Mycobacterium, Nocardia et Rhodococcus (O. Actinomycétales). ENCYCL. : Très hydrophobes, ils protègent les bactéries contre la plupart des composés chimiques (acido-alcoolo-résistance, résistance aux antibiotiques) et contre la dessiccation. Voir Acido-alcoolo-résistant.

Acide myristique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de l’espèce Myristica fragrans, muscadier). [Myristic acid] Acide gras saturé à longue chaineO.R. (C14:0) présent dans les graisses animales, dont le spermacétiO.R., et dans les huiles de muscade, de palmiste, de noix de coco, et dans les phéromones d’Hyménoptères, de Carnivores Canidés et Félidés et de Liolaemus (Iguaniens). ENCYCL. : Dans le réticulum endoplasmique rugueux, lors de la traduction des protéines destinées à être ancrées à la membrane plasmique, l’acide myristique est fixé à une glycine N-terminale des protéines (= myristoylation), par exemple dans la sous-unité α des protéines G, la protéine kinase AMPc dépendante, et la calcineurine B. Formule : H₃C–(CH₂)₁₂–COOH. Syn. : Acide tétradécanoïque (nom IUPAC).

Acide myristoléique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de Myristica fragrans, Muscadier, et du lat. oleum, huile). [Myristoleic acid] Acide gras mono-insaturé à longue chaineO.R. (C14:1, ω-5 cis), présent en grande quantité dans l’huile de graines de muscade, synthétisé à partir de l’acide myristique par la delta-9 désaturase (EC 1.14.19.1). Syn. : Acide (9Z)-tétradécénoïque.

Acide nicotinique m. [découvert en 1873 dans la nicotine par Hugo Weidel, chimiste autrichien 1849–1899] (empr. au lat. acidus, acide ; de nicotine, de nicotiane, de Jean Nicot). [Nicotinic acid] Acide carboxylique à noyau pyridine, constituant une des deux molécules de la vitamine B₃, l’autre étant son amide appelé nicotinamide. ENCYCL. : La carence vitaminique provoque la pellagre (effets : les 4 D : Diarrhée, Dermatite, Démence, Décès), et la vitamine B₃ est aussi appelée vitamine PP (angl. : Pellagra Preventive). L’acide nicotinique est le précurseur de deux coenzymes, le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD⁺) et le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP⁺), impliquées dans au moins 200 réactions biochimiques. Formule : [C₅H₄N]–COOH. Syn. : Niacine (mot-valise, de l’angl. Ni(cotinic) ac(id) (vitam)in), Acide pyridine-3-carboxylique (nom IUPAC), Vitamine B₃ ou PP.

Acide nucléique m. [découvert en 1869 par Johannes Friedrich Miescher, médecin et biologiste suisse 1844–1895] (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. nucleus, noyau). [Nucleic acid] Biopolymère non ramifié composé de nucléotides, généralement très nombreux, reliés entre eux par des liaisons covalentes 3’,5’-phosphodiester, essentiel pour toutes les formes de vie eucaryotiques, procaryotiques et virales, en leur permettant de coder, de transmettre et d’exprimer l’information génétique. ENCYCL. : Selon la nature du pentose, on distingue deux grands types d’acides nucléiques, les acides ribonucléiques (= ARN) et l’acide désoxyribonucléique (= ADN) : l’ARN possède un D-ribose alors que l’ADN possède un 2’-désoxy-D-ribose, c’est-à-dire dépourvu d’hydroxyle –OH sur le carbone 2’ (le « prime » permettant de distinguer les carbones du pentose de ceux des bases).

L’ADN constitue le support de l’information génétique dans le noyau, les mitochondries, les chloroplastes et les adénovirus. Les ARN sont de plusieurs types, à rôle spécifique :

– les ARN messagers (= ARNm) transfèrent l’information codée par l’ADN vers les sites de synthèse des protéines (ribosomes) ;

– les ARN de transfert (= ARNt) apportent dans un ordre précis les acides aminés nécessaires à la peptidogenèse ;

– les ARN ribosomiques (= ARNr) constituent les ribosomes ;

– d’autres ARN : microARN pour la régulation de certains gènes, petits ARN nucléaires pour la maturation des ARN.

Syn. : Polynucléotide. Voir ARN et ADN.

Acide okadaïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; de Halichondria okadai (Démosponges), d’où il a été d’abord isolé). [Okadaic acid] Polyéther d’un acide gras à 38 atomes de carbone, constituant une toxine synthétisée par des Dinoflagellés (ex. : Dinophysis). ENCYCL. : Bioconcentré par les organismes marins filtreurs, particulièrement les Bivalves, il cause régulièrement des intoxications alimentaires et sa cytotoxicité est aggravée par la présence concomitante de métaux lourds. Formule brute : C₄₄H₆₈O₁₃. Syn. : 9,10-Déépithio-9,10-didéshydroacanthifolicine.

Acide oxalique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. oxalis, oseille). [Oxalic acid] Voir Oxalate.

Acide oxaloacétique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. oxalis, oseille, et acetum, vinaigre). [Oxaloacetic acid] Syn. : Oxaloacétate. Voir cette entrée.

Acide pantothénique m. [découvert en 1933 par Roger John Williams, biochimiste américain 1893–1988] (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. pantothen, de toutes parts, car présent dans la plupart des aliments). [Pantothenic acid] Vitamine B₅, hydrosoluble, formée par la combinaison d’un acide pantoïque (dérivé de l’acide butyrique) et d’une β-alanine, unis par une liaison amide, d’importance centrale en tant que composant de la coenzyme A et groupe prosthétique de plusieurs protéines porteuses : ACP (angl. : Acyl Carrier Protein) de l’acide gras synthase et des polycétides synthases, PCP (angl. : Peptidyl Carrier Protein) et ArCP (angl. : Aryl Carrier Protein) des NRPS (angl. : NonRibosomal Peptide Synthetase). ENCYCL. : L’acide pantothénique n’est pas synthétisé par les Vertébrés. Il est apporté par les aliments sous forme de pantothénol, de pantothénate de calcium et surtout de coenzyme A, qui est hydrolysée dans la lumière intestinale en acide pantothénique. Formule : HOH₂C–C(CH₃)₂–CHOH–CO–NH–(CH₂)₂–COOH. Syn. : Pantothénate (anion), Vitamine B₅, Acide 3-(2,4-dihydroxy-3,3-diméthylbutanamido)propanoïque (nom IUPAC). Voir Acétyl-coenzyme A.

Acide para-aminobenzoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. para, à côté de, amine, et du lat. benzoe, rad. de benzoinum, latinisation de benjoin). [Para-aminobenzoic acid] Sigle : PABA – Acide carboxylique benzénique entrant dans la composition de l’acide folique ou vitamine B₉. ENCYCL. : Il est synthétisé par les plantes, les Eumycètes et les Bactéries, notamment intestinales, à partir du chorismate. La synthèse de l’acide folique est inhibée par les antibiotiques de la famille des sulfamides qui sont des analogues structuraux de l’acide para-aminobenzoïque. Formule : H₂N–[C₆H₄]–COOH. Syn. : Acide 4-aminobenzoïque (nom IUPAC), Vitamine B₁₀ (désuet). Voir Acide folique.

Acide periodique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. per-, préfixe indiquant l’intensité voire l’excès, et de iode). [Periodic acid] Oxoacide d’iode (nombre d’oxydation de l’iode : +VII) de formules H₅IO₆ (acide orthoperiodique) ou HIO₄ (acide métaperiodique), constituant, avec le réactif de Schiff, le colorant acide periodique-réactif de Schiff utilisé en microscopie photonique pour colorer en rouge-rose (magenta) les polyosides (glycogène, amidon, cellulose), les glycoprotéines, les protéoglycanes et les glycolipides, notamment dans le glycocalyx, la lame basale, le mucus. ENCYCL. : L’acide periodique oxyde les diols vicinaux des oses, c’est-à-dire deux hydroxyles –OH liés à deux atomes de carbone adjacents. Les aldéhydes obtenus se fixent sur le réactif de Schiff incolore qui devient rouge-rose (magenta). Attention, « periodique » ne porte pas d’accent aigu dans cette acception. Voir Coloration PAS.

Acide phosphatidique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de phosphate). [Phosphatidic acid] Glycérophospholipide obtenu par estérification du glycérol par deux acides gras et un phosphate, constituant le précurseur des acylphosphatides où le phosphate est estérifié : phosphatidylcholines (lécithines), phosphatidyléthanolamines, phosphatidylsérines (céphalines), phosphatidylinositols.

Acide phosphoénolpyruvique m. (empr. au lat. acidus, acide). [Phosphoenolpyruvic acid] Syn. : Phosphoénolpyruvate. Voir cette entrée.

Acide 2-phosphoglycérique m. (empr. au lat. acidus, acide). [2-Phosphoglyceric acid] Syn. : 2-Phosphoglycérate. Voir cette entrée.

Acide 3-phosphoglycérique m. (empr. au lat. acidus, acide). [3-Phosphoglyceric acid] Syn. : 3-Phosphoglycérate. Voir cette entrée.

Acide phytanique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de phytol, du gr. phuton, plante, et (alco)ol). [Phytanic acid] Acide gras branché, à 20 C, tétraméthylé, produit par oxydation du phytol de la chlorophylle, notamment par les bactéries du rumen des Ruminants. Formule brute : C₂₀H₄₀O₂. Syn. : Acide 3,7,11,15-tétraméthylhexadécanoïque (nom IUPAC).

Acide phytique m. [découvert en 1903] (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. phuton, plante). [Phytic acid] Acide cyclique formé d’un inositol portant six phosphates, présent dans les globoïdes des grains d’aleurone des graines (surtout le son) sous forme de phytate de calcium et de magnésium (phytine), constituant une forme de réserve de minéraux. ENCYCL. : Les animaux non ruminants ne peuvent pas digérer le phytate, son phosphore n’est pas absorbé et est rejeté dans les excréments. Il diminue l’absorption intestinale des cations en les complexant. Chez les Ruminants, les bactéries symbiotiques du rumen produisent une phytase qui digère le phytate. Formule brute : C₆H₁₈O₂₄P₆. Syn. : Phytate (anion), Acide myo-inositol hexaphosphorique, Inositol hexakisphosphate (= IP6).

Acide polyadénylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. polus, nombreux, adén(ine), et suff. -ylique). [Polyadenylic acid] Syn. : Queue poly-A. Voir Polyadénylation.

Acide propionique m. [découvert en 1844 par Johann Gottlieb, chimiste autrichien 1815–1875] (empr. au lat. acidus, acide ; du lat. pro, avant, et du gr. piôn, graisse, cet acide étant le premier dans la série des acides gras). [Propionic acid] Acide carboxylique saturé à trois carbones, jouant de nombreux rôles métaboliques. ENCYCL. :

a. Dans la β-oxydation des acides gras à nombre impair de carbones, il apparaitO.R. à la fin du dernier tour sous forme de propionyl-CoA. Ce dernier est ensuite carboxylé en succinyl-CoA (en C4) qui entre dans le cycle du citrate. L’acide propionique issu de ces acides gras impairs est la seule partie glucoformatrice des acides gras, lors de la voie de la néoglucogenèse.

b. Dans la biosynthèse des acides gras à nombre impair de carbones, le premier tour synthétique commence par le transfert du propionyle du propionyl-CoA sur la β-cétoacyl synthase du complexe enzymatique acide gras synthase (= AGS).

c. Dans le catabolisme de la méthionine, de l’isoleucine et de la désoxythymidine-5’-monophosphate (= dTMP).

d. Dans la fermentation propionique, l’acide propionique est produit par les bactéries Propionibacterium (O. Actinomycétales). Il est synthétisé par les microbiotes cutané et colique.

C’est aussi un constituant des phéromones de divers Insectes et Canidés. Formule : H₃C–CH₂–COOH. Syn. : Propionate (anion), Acide propanoïque (nom IUPAC), Propanoate (anion), Acide méthylacétique (désuet). Voir Fermentation propionique.

Acide ptéroylglutamique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de ptér(idine) et (acide) glutamique). [Pteroylglutamic acid] Syn. : Acide folique. Voir cette entrée.

Acide pyruvique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. pur, feu, et du lat. uva, raisin). [Pyruvic acid] Syn. : Pyruvate. Voir cette entrée.

Acide rétinoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; de rétin(ol), et suff. -oïque). [Retinoic acid] Lipide isoprénoïde de la famille des rétinoïdes, constituant une des trois formes de la vitamine A, et un facteur de transcription activant ou réprimant des amplificateurs du complexe homéotique Hox. ENCYCL. : L’acide rétinoïque est issu de l’oxydation du rétinal par les rétinal déshydrogénases (EC 1.2.1.36), le rétinal provenant de l’oxydation du rétinol par les rétinol déshydrogénases. Au niveau du centre organisateur de Spemann (lèvre dorsale et nœud de Hensen), il participe à la détermination de l’axe antéro-postérieur et favorise l’apparition de structures neurales du tronc plutôt que des structures cérébrales. Les isomères 13-cis, 9-cis et tout-trans se fixent sur les récepteurs nucléaires hétérodimériques RAR/RXR qui se lient à l’ADN au niveau des séquences RARE (angl. : Retinoic Acid Response Element). Formule : [C₆H₆](CH₃)₃–(CH)₂–C(CH₃)–(CH)₃–C(CH₃)–CH–COOH. Syn. : Rétinoate (anion).

Acide ribonucléique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de ribo(se), et nucléique, du lat. nucleus, noyau). [Ribonucleic acid] Sigle : ARN. Voir cette entrée et Acide nucléique.

Acide sialique m. [découvert et nommé en 1952 par Gunnar Blix, biochimiste suédois 1894–1981] (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. sialon, salive). [Sialic acid] Famille d’oses complexes formés par combinaison de l’acide neuraminique (D-mannosamine associée à un acide pyruvique) avec l’acide acétique ou l’acide glycolique, constitutifs de divers glycosphingolipides acides (gangliosides) et de glycoprotéines. ENCYCL. : Ils jouent un rôle dans la stabilisation des membranes, dans la protection des molécules contre les protéases et les glycosidases, dans l’affinité des récepteurs membranaires intervenant notamment dans le fécondation, la croissance et la différenciation cellulaires. Ex. : acide N-acétylneuraminique (= NANA ou Neu5Ac), acide N-glycolylneuraminique (= Neu5Gc). Syn. : Sialate (anion).

Acide succinique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de succin, ambre jaune, où il a été découvert). [Succinic acid] Syn. : Succinate. Voir cette entrée.

Acide L-tartrique m. [isolé en 1769 par Carl Wilhelm Scheele, pharmacien chimiste suédois-allemand 1742–1786] (empr. au lat. acidus, acide ; de tartre (du vin)). [L-tartaric acid] Acide carboxylique α-hydroxylé présent dans de nombreux fruits dont le raisin, provenant de la dihydroxylation de l’acide ascorbique. ENCYCL. : C’est le principal acide du vin, présent sous forme de bitartrate de potassium (= gravelle) insoluble dans l’alcool, et qui cristallise donc sur les parois des futsO.R. et des bouteilles. Formule : HOOC–CH(OH)–CH(OH)–COOH. Syn. : Tartrate (base conjuguée), Acide 2,3-dihydroxybutanedioïque (nom IUPAC), Acide uvique (désuet), Acide thréarique (désuet).

Acide taurocholique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de taurine, et du gr. kholê, bile). [Taurocholic acid] Voir Acide biliaire et Acide cholique.

Acide téichoïque ou teichoïque m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. teikhos, mur fortifié). [Teichoic acid] Famille de polymères de glycérolphosphates ou de ribitolphosphates liés par des liaisons phosphodiester, dans la paroi des bactéries à Gram⁺ (Firmicutes et Actinobactéries) mais absents des bactéries à Gram–, conférant une rigidité à la paroi bactérienne. ENCYCL. : Des acides aminés dont la D-alanine sont attachés au glycérol ou au ribitol et apportent un caractère zwittérionique. Les acides téichoïques sont liés soit au peptidoglycane soit aux lipides de la membrane plasmique (acides lipotéichoïques). Ils sont impliqués dans la fixation des bactéries pathogènes aux tissus de leur hôte et favorisent ainsi l’infection. Ils sont antigéniques et activent les macrophages en se liant à leurs récepteurs éboueurs SR-A (angl. : Scavenger Receptor class A).

Acide tétrahydrofolique m. (empr. au lat. acidus, acide ; du gr. tettares, quatre, et hudôr, eau ; du lat. folium, feuille). [Tetrahydrofolic acid] Forme active tétrahydrogénée de l’acide folique. Voir Acide folique.

Acide thymidylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de thymid(ine), de thymus où la thymine a été isolée, et suff. -ylique). [Thymidylic acid] Syn. : Thymidine-5’-monophosphate (= TMP). Voir cette entrée.

Acide uridylique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de urid(ine), du gr. oûron, urine, et suff. -ylique). [Uridylic acid] Syn. : Uridine-5’-monophosphate (= UMP). Voir cette entrée.

Acide urique m. (empr. au lat. acidus, acide ; de ur(ine), du lat. aurina, de aurum, or). [Uric acid] Acide hétérocyclique à quatre atomes d’azote, constituant une forme d’excrétion de l’azote purique et aminé chez certains animaux, synthétisé par oxydation de l’hypoxanthine et de la xanthine par la xanthine déshydrogénase (EC 1.17.1.4) ou par la xanthine oxydase (EC 1.17.3.2). ENCYCL. : Ces deux bases azotées hypoxanthine et xanthine proviennent soit du catabolisme des nucléotides puriques ((d)AMP et (d)GMP), soit de l’uricogenèse de novo. La formation d’acide urique, forme non toxique de l’ammoniac, permet d’économiser la grande quantité d’eau nécessaire à l’excrétion de l’ammoniac et constitue ainsi une adaptation à la vie terrestre. Il est excrété chez les humains et les singes anthropoïdes, les Oiseaux, les reptiles, les Urochordés, les Insectes terrestres, les Gastéropodes terrestres lors de l’estivation ou de l’hibernation et les Gastéropodes marins (ex. : littorines Littorina) lors de l’exondation à marée basse. Une augmentation de sa concentration dans le sang, appelée hyperuricémie, est responsable d’arthropathies et de lithiase rénale (goutte) traitées par un inhibiteur compétitif de la xanthine oxydase, l’allopurinol (analogue structurel de l’hypoxanthine). Formule : C₅H₄N₄O₃. Syn. : Urate (base conjuguée), 7,9-Dihydro-1H-purine-2,6,8(3H)-trione (nom IUPAC), 2,6,8-Trioxypurine.

Acidémie n. f. (de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide ; du gr. haima, sang). [Acidemia] État du sang dont le pH est inférieur à la normale (= 7,35 chez les humains) par augmentation de la concentration d’un acide, notamment dans certaines maladies métaboliques héréditaires : acidémies propionique, méthylmalonique, isovalérique. Ne pas confondre avec Acidose.

Acidicline ou Acidocline adj. (de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide, et du gr. klinein, pencher). [Acidocline] Se dit d’un individu, d’une espèce, d’un peuplement qui préfère, sans obligation, un sol ou une eau légèrement acide (pH < 5,5). Ex. : arabette des dames Arabidopsis thaliana (F. Brassicacées), châtaignier Castanea sativa (F. Fagacées), hêtre Fagus sylvatica (F. Fagacées). S’oppose à Basicline, Neutrocline. Remarque : La forme « acidicline » est plus fréquente en français.

Acidicole adj. (de acide, du lat. acidus, aigre, acide, et colere, habiter). [Acidicolous] Syn. : 2. Acidophile. Voir cette entrée.

Acidification n. f. (de acidifier, de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide). [Acidification] Diminution du pH d’un biotope édaphique ou aquatique, d’origine naturelle (par enrésinement, par podzolisation) ou anthropique (par la pollution atmosphérique, les engrais, le drainage minier). ENCYCL. :

1. L’acidification des sols [Soil acidification] a de nombreux effets négatifs : elle diminue l’activité biologique (donc l’humification), la fixation du diazote atmosphérique, la structure physique du sol, l’assimilabilité des macroéléments (phosphore, soufre, potassium, calcium, magnésium), et augmente la dissolution donc l’assimilabilité d’éléments toxiques à forte teneur (aluminium) et des métaux lourds (mercure, plomb, chrome, nickel).

2. L’acidification des océans [Ocean acidification] correspond à une baisse du pH de 8,15 à 8,05 en 200 ans, due à la dissolution du CO₂ atmosphérique, des oxydes d’azote et des composés soufrés issus des combustibles fossiles. Elle perturbe la physiologie (surtout le système olfactif) et le comportement des animaux aquatiques, dégrade les écosystèmes (récifs coralliens), diminue la calcification des animaux à coquille calcaire : Mollusques, crustacés, coraux, Échinodermes, Foraminifères, Haptophytes (anciens Coccolithophoridés).

Acidimétrie n. f. (1855, de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide ; du gr. metron, mesure). [Acidimetry] Méthode d’analyse volumétrique pour mesurer la concentration d’une solution acide, notamment par neutralisation avec une base de concentration connue. L’usage de ce terme est déconseillé et peut être remplacé par « titrage acide-base » ou « protométrie ». Ant. : Alcalimétrie.

Acidiphile → Acidophile

Acidiphilie → Acidophilie

Acidiphyte → Acidophyte

Acido-alcoolo-résistant, e adj. [Alcohol-acid-fast] Sigle : AAR – Se dit des mycobactéries (Actinobactéries) dont le peptidoglycane porte des acides mycoliques (acides gras complexes à très longue chaineO.R.) qui empêchent la décoloration des cellules par le mélange acide/alcool de la coloration de Ziehl-Neelsen. Les bactéries non résistantes sont décolorées par le lavage puis colorées par un contrecolorantO.R. (bleu de méthylène). Voir Coloration de Ziehl-Neelsen.

Acidobactéries (Acidobacteria) n. f. pl. (empr. au lat. acidus, acide ; empr. au lat. bacterium, du gr. baktêrion, petit bâton). [Acidobacteria] Clade de Bactéries de type bâtonnet de 1 à 3 μm, parfois mobiles par un flagelle. Acidobacterium est chimioorganotrophe et acidophile. ENCYCL. : Les espèces sont soit aérobies strictes soit anaérobies strictes. Elles sont présentes dans les sols, les sédiments, les sources hydrothermales. Leur répartition est mondiale. 23 espèces sont connues, réparties dans 3 classes : Acidobactéries, Blastocatellies et Holophagées.

Acidophile ou Acidiphile adj. (1897, de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide ; du gr. philos, ami). [Acidophilic] ► ① Se dit d’un organite, d’une macromolécule qui fixe les colorants acides c’est-à-dire des colorants porteurs d’auxochromes anioniques carboxyle –COO– ou hydroxyle –OH–, comme l’éosine, le rose Bengale, l’acide picrique, la fuchsine acide. Ex. : mitochondrie, collagène, protéines cytoplasmiques. Ant. : Basophile ;

► ② Se dit d’un organisme qui se développe préférentiellement ou obligatoirement dans un milieu acide de pH < 5. Certaines espèces peuvent vivre à un pH < 1 comme Cyanidium caldarium (Rhodophytes > Cyanidiophycées). Syn. : Acidicole, Basophobe. Ant. : Basophile, Alcalinophile ;

► ③ Se dit d’une plante qui pousse préférentiellement ou obligatoirement sur un sol acide, souvent riche en silice. Ex. : bruyères Erica, myrtilles Vaccinium, petite oseille Rumex acetosella, rhododendron ferrugineux Rhododendron ferrugineum. Syn. : Silicicole, Siliciphile, Calcifuge. Ant. : Basophile, Calciphile.

Remarque : La forme « acidophile » est plus fréquente.

Acidophilie ou Acidiphilie n. f. (de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide ; du gr. philos, ami). [Acidophilia] Caractère des espèces acidophiles. Ant. : Basophilie, Alcalinophilie, Calciphilie. Remarque : La forme « acidophilie » est plus fréquente. Voir Acidophile.

Acidophyte n. f. (de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide, et du gr. phuton, plante). [Acidophyte] Plante acidophile, c’est-à-dire qui pousse préférentiellement ou obligatoirement sur un sol acide, souvent riche en silice. Ex. : bruyères Erica, myrtilles Vaccinium, petite oseille Rumex acetosella, rhododendron ferrugineux Rhododendron ferrugineum. Ant. : Basophyte.

Acidose n. f. (1909, de acide, empr. au lat. acidus, aigre, acide, et suff. -ose). [Acidosis] Trouble de l’hémostase acidobasique se traduisant par une augmentation de l’acidité du plasma (pH < 7,35). ENCYCL. : On peut distinguer l’acidose métabolique due à la synthèse excessive d’acides métaboliques, l’acidose respiratoire ou gazeuse due à l’excrétion insuffisante de CO₂ (hypercapnie) par les poumons, et l’acidose tubulaire rénale due à un défaut soit de la réabsorption tubulaire des ions bicarbonate soit de la sécrétion des protons. Elle se manifeste par plusieurs symptômes : fatigue, somnolence, vertiges, céphalées, confusion, vomissement, diarrhée. Ne pas confondre avec Acidémie. Ant. : Alcalose.

Acine n. m. Vx (du lat. acinus, grain de raisin, baie). [Acinus] Type de baie caractérisée par un épicarpe ou un conceptacle très fin et une pulpe molle succulente, fortement aqueuse, comme les grains de raisin. Attention, acine est du genre masculin. Ex. : grume Vitis (F. Vitacées), groseille et cassis Ribes (F. Grossulariacées).

Acinète → Akinète

Acineux, euse adj. (de acinus, mot lat., grain de raisin, baie). [Acinar ou Acinous] Se dit d’une glande, d’un épithélium glandulaire, d’une cellule lorsqu’ils sont organisés en acinusO.R., unités sécrétoires exocrines plus ou moins sphériques. Ex. : pancréas, glandes salivaires, sébacées, mammaires. Voir Acinus.

Acinus n. m. [pl. : acinusO.R. ou acini] (mot lat., grain de raisin, baie). [Acinus, pl. Acini] Unité sécrétoire des glandes exocrines caractérisée par une disposition plus ou moins sphérique des cellules sécrétrices acineuses. ENCYCL. : Les cellules acineuses présentent un réticulum endoplasmique rugueux et un appareil de Golgi bien développés et sont riches en granules sécrétoires. Les glandes constituées d’acinus sont dites acineuses, simples ou composées (plusieurs acinusO.R.). Ex. : pancréas, glandes salivaires, sébacées, mammaires.

Acmé n. f. (Acad.) ou m. (empr. au gr. akmê, partie aigüeO.R. puis apogée, du rad. ak- exprimant l’idée de pointe). [Acme] Période d’abondance maximale d’une espèce ou de diversité maximale d’un groupe, au cours des temps géologiques. S’oppose à Extinction.

Acœle adj. [prononcer acèle] (du gr. a-, préfixe privatif, et koilos, creux). [Acoelous] ► ① Se dit d’une vertèbre dont les faces antérieure et postérieure du corps vertébral sont planes et parallèles. Le type acœle n’existe que chez les Mammifères. Syn. : Biplan ;

► ② Qui est dépourvu de cavité. Ex. : l’embryon au stade morula est acœle.

Acœlomates n. m. pl. [prononcer acélo…] (du gr. a-, préfixe privatif ; de cœlome, du gr. koilôma, cavité). [Acœlomata] Groupe taxinomique désuet qui regroupait tous les animaux triploblastiques dont le mésoderme n’est pas creusé d’une cavité cœlomique. ENCYCL. : Les acœlomates sont les Acanthocéphales, les Cycliophores, les Gastrotriches, les Kinorhynches, les Loricifères, les Mésozoaires, les Nématodes, les Nématomorphes, les Némertes, les Plathelminthes, les Priapuliens, les Rotifères. La phylogénie moléculaire montre que tous les organismes triploblastiques proviennent d’un ancêtre commun cœlomate, ce qui rend caducs les concepts d’acœlomate et de pseudocœlomate en systématique phylogénétique. Ant. : Cœlomates.

Aconitase n. f. (de cis-aconitique, de aconit, du lat. aconitum, du gr. akoniton, plante toxique). [Aconitase] Dans le cycle du citrate, enzyme mitochondriale (EC 4.2.1.3, chr. 22), de la classe des lyases, qui catalyse l’isomérisation réversible (par déshydratation/réhydratation) du citrate en isocitrate via le cis-aconitate. ENCYCL. : Il existe une isoenzyme cytosolique (889 a. a., chr. 9), appelée protéine régulatrice du fer 1 (= IRP1, Iron Regulatory Protein 1), constituant un régulateur traductionnel qui se fixe aux éléments IRE de l’UTR (angl. : UnTranslated Region) des ARNm codant des protéines régulatrices de la concentration intracellulaire du fer comme la ferritine, la transferrine, la ferroportine et le transporteur de métal divalent 1 (= DMT1). Syn. : Aconitate hydratase, Citrate hydro-lyase.

Aconitine n. f. (de aconit, du lat. aconitum, du gr. akoniton, plante toxique). [Aconitine] Alcaloïde diterpénique cardioneurotoxique présent seulement chez les aconits Aconitum (F. Renonculacées), particulièrement dans la racine tubérisée et les graines, et qui leur vaut d’être les plantes les plus toxiques de la flore européenne. ENCYCL. : L’aconitine est un agoniste des canaux à sodium voltage-dépendants dans les membranes des cellules excitables, qui provoque l’ouverture des canaux, la dépolarisation de la membrane et la suppression des potentiels d’action. La DL₅₀ par voie orale est de 1 mg/kg chez la souris et serait de 2 à 5 mg/kg chez les humains. Formule brute : C₃₄H₄₇NO₁₁.

Aconte adj. et n. m. (du gr. a-, préfixe privatif, et kontos, bâton). ► ① adj. [Akont] Syn. : Amastigote. Voir cette entrée ;

► ② n. m. pl. [Akonta] Groupe taxinomique désuet qui regroupait des organismes ne présentant aucun stade flagellé (ni centrioles) dans leur cycle de reproduction : les Rhodophytes, les Zygnématophycées (Chloroplastidés).

Acorales n. f. pl. [1835, C. F. P. von Martius] (du genre Acorus, acoreM). [Acorales] Clade (rang : ordre) le plus basal de l’arbre phylogénétique des Angiospermes Monocotylédones, monofamilial (F. Acoracées) et monogénérique (acoresMAcorus), regroupant des plantes rhizomateuses palustres, aromatiques, à feuilles distiques. ENCYCL. : Elles sont originaires d’Asie et ont été importées en Europe et en Amérique du Nord. 4 espèces sont connues, réunies dans la famille unique des Acoracées (ex. : acore odorant Acorus calamus).

Acotylédone ou Acotylédoné, e (du gr. a-, préfixe privatif, et kotulêdôn, creux, cavité). ► ① adj. [Acotyledonous] Se dit d’une graine, et de la plante qui la porte, qui est dépourvue de cotylédons bien développés. Ex. : lentilles d’eau Lemna, cuscutes Cuscuta, Orchidées, dont les cotylédons sont vestigiaux ;

► ② n. f. pl. Acotylédones [Acotyledons] Groupe taxinomique désuet qui constituait, avec les Monocotylédones et les dicotylédones, l’une des trois grandes divisions du règne végétal, regroupant les champignons, les mousses et les fougères.

Acoustique adj. (1700, empr. au gr. akoustikos, qui concerne l’ouïe, de akouein, entendre). [Acoustic] Relatif à l’ouïe, à la perception des sons. Voir Réflexe acoustique.

Acquis, e adj. (de acquérir, du lat. acquirere). [Acquired] Se dit d’un caractère biologique non héréditaire qui apparaitO.R. au cours de la vie dans les cellules somatiques en réaction à un facteur de l’environnement, permettant une accommodation phénotypique à une condition spécifique du milieu de vie. ENCYCL. : L’aptitude à posséder un caractère acquis peut dépendre d’une information génétique héréditaire dont l’expression phénotypique est modifiée par l’environnement. Un caractère congénital, c’est-à-dire déjà présent à la naissance, peut être quand même acquis (ex. : malformation due au tabac ou à l’alcool). Ex. : le bronzage permettant de se protéger contre les rayons solaires, une callosité permettant à la peau de résister à des frottements répétés. Ant. : Héréditaire, Inné.

Acrasine n. f. (de Acrasia, sorcière du poème épique « The Faerie Queene » de Edmund Spenser 1551–1599, qui attire les chevaliers errants, du gr. akhrasia, -as, dérèglement, et suff. -ine). [Acrasin] Terme générique correspondant à plusieurs molécules chimiotactiques sécrétées par les Acrasiomycètes (Conosés), favorisant l’agrégation des myxamibes en un pseudoplasmode. Les acrasines sont l’AMPc (= Adénosine MonoPhosphate cyclique) chez Dictyostelium discoideum, des dérivés de la ptérine chez Dictyostelium lacteum, la glorine (= N-propionyl-γ-L-glutamyl-L-ornithine-δ-lactame éthylester) chez Polysphondylium pallidum et P. violaceum. Ne pas confondre avec Acrosine.

Acraspède adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et kraspedon, frange, bordure). [Acraspedote] Se dit des méduses dont le corps n’est pas obturé sur sa face ventrale par un vélum ou craspédon. Les méduses acraspèdes se rencontrent chez les Scyphozoaires (Cnidaires > Médusozoaires). Ant. : Craspédote.

Acridine orange f. (du lat. acer, acris, âcre). [Acridine orange] Colorant fluorescent des acides nucléiques, à noyau dibenzopyridinique tétraméthylé, utilisé comme colorant vital en cytogénétique car il traverse les membranes cellulaires et interagit avec les acides nucléiques par des liaisons électrostatiques ou par intercalation entre les bases. ENCYCL. : Liée aux ARN, l’acridine orange reste monomérique et émet une fluorescence rouge sombre (650 nm). Liée à l’ADN, elle se polymérise et émet une fluorescence verte (525 nm). Formule brute : C₁₇H₁₉N₃. Syn. : Tétraméthylacridine-3,6-diamine (nom IUPAC).

Acridophage adj. et n. m. (du gr. akris, -idos, sauterelle, et phagein, manger). [Acridophagous] Qui se nourrit de criquets (O. Orthoptères > s.O. Cælifères) ou de sauterelles et/ou de leurs œufs. Ce caractère s’appelle l’acridophagie. Ex. : Oiseaux (cigognes, milans, faucons, aigles), larves d’Hyménoptères (Sphécidés, Scélionidés, Chalcidoïdés…), larves de Diptères (Asilidés, Calliphoridés, Muscidés…).

Acritarche n. m. [mot créé en 1963 par William R. (Bill) Evitt, paléontologue américain 1923–2009] (du gr. akritos, confus, et arkhaios, ancien). [Acritarch] Tout microfossile palynomorphe, en forme de sphère hérissée d’épines, dont la nature est multiple (œufs, spores, kystes de Dinoflagellés…), rencontré dans les sédiments marins et dulçaquicoles, du Précambrien à l’actuel. Ils sont parmi les plus anciens fossiles connus (3,2 Ga).

Acrocarpe adj. et n. f. (1838, du gr. akros, à l’extrémité, et karpos, fruit). [Acrocarpous ou Acrocarpic] Se dit des mousses (Bryophytes s. s.) et des hépatiques (Marchantiophytes) dont les archégonesM donc les sporophytes (qui parasitent le gamétophyte) sont acrocaules, c’est-à-dire qu’ils se forment au sommet de la tige feuillée gamétophytique, et non latéralement comme chez les pleurocarpes. La majorité des mousses sont acrocarpes. Syn. : Acrogyne. Ant. : Pleurocarpe, Anacrogyne.

Acrocaule adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et kaulos, tige). [Acrocaulous] Qui est à l’extrémité d’une tige, d’un rameau, d’un pédoncule. Ex. : fleur centrale d’une cyme bipare, bourgeon apical, archégone des mousses acrocarpes.

Acrocentrique adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et centr(omér)ique)). [Acrocentric] Se dit d’un chromosome dont le centromère est situé près d’une extrémité, les deux bras étant donc de longueurs très inégales. Ex. : chez les humains : chromosomes no 13, 14, 15, 21 et 22. Syn. : Acrocentromérique. Ant. : Métacentrique.

Acrocentromérique adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et de centromère). [Acrocentromeric] Syn. : Acrocentrique. Voir cette entrée.

Acroconte ou Acroconté, e adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et kontos, bâton). [Acrokont] Se dit d’une cellule qui possède un ou plusieurs flagelles à une seule extrémité. Ex. : spermatozoïde. Syn. : Acrotriche.

Acrodendrophile adj. (du gr. akros, à l’extrémité, dendron, arbre, et philos, ami). [Acrodendrophilous] Qui vit, niche au sommet des arbres, particulièrement dans la canopée. La canopée représente les trois quarts de la biodiversité d’une forêt tropicale. Ce caractère s’appelle l’acrodendrophilie. Ex. : grand corbeau Corvus corax (O. Passériformes).

Acrodonte adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et odous, odontos, dent). [Acrodont] Se dit d’une denture dont les dents sont implantées par leur base sur le bord supérieur de la mâchoire dépourvue d’alvéoles dentaires. Ce caractère appelé acrodontie est présent chez la plupart des Squamates, chez le sphénodon (Rhynchocéphales) et chez les Téléostéens. S’oppose à Pleurodonte, Thécodonte.

Acrodrome adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et dromos, course). [Acrodromous] Se dit de la nervation d’une feuille avec au moins deux nervures primaires ou secondaires fortes qui divergent de la base du limbe et qui, incurvées, convergent vers l’apex en suivant la courbure de la marge du limbe. Ex. : feuilles des Orchidacées, des gentianes Gentiana et Gentianella (F. Gentianacées), des plantains Plantago (F. Plantaginacées), des sceaux-de-Salomon Polygonatum (F. Asparagacées).

Acrofuge adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et du lat. fugere, fuir). [Acrofugal] Syn. : Basipète. Voir cette entrée.

Acrogamie n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et gamos, union). [Acrogamy] Mode de fécondation des Angiospermes dans lequel, le micropyle étant obturé, le tube pollinique entre dans l’ovule par les tissus nucellaires supérieurs. Ant. : Porogamie (entrée par le micropyle), Chalazogamie (entrée par la chalaze).

Acrogyne adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et gunê, femelle). [Acrogynous] Syn. : Acrocarpe. Voir cette entrée.

Acron n. m. (du gr. akros, à l’extrémité de). [Acron] Chez les Euarthropodes, partie la plus antérieure de la tête des Mandibulates et du céphalothorax des Chélicérates, en avant du premier métamère, connectée au protocérébron. ENCYCL. : L’acron porte les yeux composés et les ocellesM, mais aucun appendice. Il porte aussi l’organe frontal olfactif chez les Mérostomes et les organes de Tömösváry chez les Myriapodes.

Acronématé, e adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et nêma, -atos, filament). [Acronemate] Se dit d’un flagelle lisse, dépourvu de mastigonèmes, et qui se rétrécit près de son extrémité distale en un fin filament terminal. Ant. : Pleuronématé, Pantonématé.

Acropause n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et du lat. pausa, arrêt). [Acropause] Limite supérieure de la végétation, toit végétal. ENCYCL. : Par extension, l’acropause peut inclure la mince couche d’atmosphère ou aérostrate située juste au-dessus du toit végétal, directement modifiée par la composition et le fonctionnement de la végétation (variations de la teneur en vapeur d’eau, en CO₂, en O₂…).

Acropète adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et du lat. petere, tendre vers). [Acropetal] Se dit d’un développement, particulièrement d’une inflorescence, se réalisant de la base vers le sommet. Ex. : floraison acropète des lilas Syringa (F. Oléacées), des épilobesMEpilobium (F. Onagracées), des linaires Linaria (F. Plantaginacées). Syn. : Basifuge. Ant. : Acrofuge, Basipète.

Acrophyte n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et phuton, plante). [Acrophyte] Toute plante orophile qui pousse à très haute altitude, dans les étages alpin et nival. Ex. : édelweissO.R. (F. Astéracées), certaines saxifrages Saxifraga (F. Saxifragacées), certaines joubarbes Sempervivum (F. Crassulacées).

Acropode n. m. (du gr. akros, à l’extrémité, et pous, podos, pied). [Acropodium, pl. -dia] Chez les Tétrapodes, extrémité distale de l’autopode (main ou pied) du membre chiridien, composée des doigts (huit primitivement), des phalanges.

Acropodial, ale, aux adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et pous, podos, pied). [Acropodial] Relatif à l’acropode. Voir cette entrée.

Acrosarque n. m. (du gr. akros, à l’extrémité, et sarkos, chair). [Acrosarc] Type de fruit charnu angiocarpique issu d’un ovaire infère adhérent, dont l’épicarpe est entouré d’un conceptacle fin, et dont les graines sont entourées d’une pulpe succulente. Ex. : airelle et canneberge Vaccinium (F. Éricacées), groseille et cassis Ribes (F. Grossulariacées).

Acroscopique adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et skopein, voir). [Acroscopic] Se dit d’une structure, d’un organe qui est situé près de l’apex ou en direction de l’apex de l’organe qui le soutient. Ex. : marge supérieure d’une penne d’une fronde. Ant. : Basiscopique.

Acrosine n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et suff. -ine). [Acrosin] Enzyme de type sérine-protéase (EC 3.4.21.10) stockée dans l’acrosome des spermatozoïdes des Mammifères sous forme de proacrosine (402 a. a.) et libérée lors de la réaction acrosomique précédant la fécondation. ENCYCL. : Elle est formée d’une chaineO.R. lourde (301 a. a.) et d’une chaine légère (23 a. a.) liées par deux ponts disulfure. L’acrosine rompt les longues chaines de glycoprotéines ZP1, ZP2 et ZP3 de la zone pellucide, ce qui facilite le passage du spermatozoïde vers la membrane de l’ovule. Ne pas confondre avec Acrasine. Voir Acrosome.

Acrosome n. m. (du gr. akros, à l’extrémité, et sôma, corps). [Acrosome] Organite antérieur de la tête spermatique, à l’avant du noyau et l’entourant partiellement comme un capuchon. ENCYCL. : La liaison des kinases transmembranaires de la tête spermatique à la glycoprotéine ZP3 de la zone pellucide active des protéines G ce qui déclenche une cascade de réactions aboutissant à l’ouverture des canaux calciques membranaires du spermatozoïde. L’augmentation du calcium intracellulaire provoque des fusions ponctuelles de la membrane de l’acrosome avec la membrane plasmique de la tête spermatique ce qui crée des pores par lesquels plusieurs enzymes dont la hyaluronidase et l’acrosine sont libérées. Voir Acrosine.

Acrosomial, ale, aux adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et sôma, corps). [Acrosomal] Syn. : Acrosomique. Voir Acrosome.

Acrosomien, enne adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et sôma, corps). [Acrosomal] Syn. : Acrosomique. Voir Acrosome.

Acrosomique adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et sôma, corps). [Acrosomal] Relatif à l’acrosome. Syn. : Acrosomial, Acrosomien (syn. moins usités). Voir Acrosome.

Acrospore n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et spora, semence). [Acrospore] Spore naissant à l’extrémité d’une hyphe.

Acrostichoïde adj. [prononcer stiko…] (du genre Acrostichum, et suff. -oïde, du gr. eidos, aspect). [Acrostichoid] Chez les Fougères lato sensu, se dit de la répartition des sporanges sur la surface inférieure de la fronde sans être regroupés en sores. Ex. : Acrostichum (F. Ptéridacées), Elaphoglossum (F. Dryoptéridacées).

Acrotonie n. f. (du gr. akros, à l’extrémité, et tonos, tension). [Acrotony] Mode de ramification végétale caractérisé par des rameaux de longueur croissante du sommet vers la base du végétal. L’acrotonie caractérise les arbres, notamment les Acrogymnospermes. Ant. : Basitonie.

Acrotriche adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et thrix, trikhos, poil). [Acrokont] Syn. : Acroconte. Voir cette entrée.

Acrotrophique adj. (du gr. akros, à l’extrémité, et trophê, nourriture). [Acrotrophic] Se dit d’un ovaire méroïstique d’Insectes dont les cellules nourricières ou trophocytes n’accompagnent pas les ovocytes mais restent dans la partie antérieure appelée germarium où elles forment un tissu trophique. ENCYCL. : L’approvisionnement des ovocytes par les cellules nourricières est réalisé par quelques cordons trophiques issus du tissu trophique. Ce type d’ovariole, plus primitif que le type polytrophique, se rencontre chez les Hémiptères et les Coléoptères Polyphages. Syn. : Télotrophique. Ant. : Polytrophique. Voir Méroïstique.

ACRP30 n. f. (sigle de l’anglais Adipocyte Complement-Related Protein 30 kDa). [ACRP30] Syn. : Adiponectine. Voir cette entrée.

ACTH n. f. (sigle de l’angl. AdrenoCorticoTropic Hormone). [ACTH] Syn. : Corticotropine. Voir cette entrée.

Actine n. f. [découverte en 1942 par Brunó Ferenc Straub, biochimiste hongrois 1914–1996] (du lat. actus, mouvement, et suff. -ine). [Actin] Protéine (375 a. a.) cytoplasmique la plus abondante, multifonctionnelle et ubiquitaire, impliquée dans de nombreuses fonctions cellulaires comme la contraction musculaire (avec la myosine), la locomotion cellulaire (mouvements amiboïdes), la division cellulaire (anneau contractile), la forme cellulaire, la structure cellulaire (microvillosités et stéréocil), la relation intercellulaire (liaison à la matrice extracellulaire ou à d’autres cellules). ENCYCL. : Elle existe sous forme monomérique soluble, l’actine G (pour Globulaire), et sous forme polymérique linéaire, l’actine F (pour Filamenteuse). L’actine F forme des microfilaments dimériques hélicoïdaux dextres de 7 nm de diamètre.

α-Actinine n. f. (de actine, du lat. actus, mouvement, et suff. -ine). [α-Actinin] Protéine fibrillaire cytosquelettique, du groupe des ABP (angl. : Actin-Binding Protein), qui permet la liaison des filaments d’actine aux stries Z des sarcomères des fibres musculaires squelettiques ainsi qu’aux intégrines membranaires, et qui maintient une distance régulière entre les filaments d’actine.

β-Actinine ou Actinine β n. f. (de actine, du lat. actus, mouvement, et suff. -ine). [β-Actinin] Syn. : CapZ. Voir cette entrée.

Actinique adj. (1866, du gr. aktis, -inos, rayon, et suff. -ique). [Actinic] Se dit d’une radiation électromagnétique, visible ou non, qui a des effets photochimiques ou photobiologiques, notamment dans la photosynthèse, le phototactisme, la phototaxie, la vision, dans la synthèse de mélatonine et de vitamine D₂. Ce caractère s’appelle l’actinisme et son étude s’appelle l’actinobiologie. Ex. : rayons X (de 0,01 à 10 nm), rayons ultraviolets (de 10 à 380 nm), rayons visibles (de 380 à 780 nm), rayons infrarouges (de 780 nm à 1 mm).

Actinisme n. m. (1877, du gr. aktis, -inos, rayon, et suff. -isme). [Actinism] Voir Actinique.

Actinistiens (Actinistia) n. m. pl. [Cope 1872] (du gr. aktis, -inos, rayon). [Actinistians] Clade (rang : classe) de Vertébrés Gnathostomes Ostéichtyens, constituant le groupe frère des Rhipidistiens dans le clade des Sarcoptérygiens, regroupant de nombreuses espèces fossiles et seulement deux espèces actuelles, les cœlacanthes. 2 espèces sont connues, dans la famille des Latimériidés : Latimeria chalumnae (1939, vit dans les ilesO.R. Comores), L. menadoensis (1999, vit dans l’ile Célèbes).

Actinobactéries (Actinobacteria) n. f. pl. [Cavalier-Smith 2002] (du gr. aktis, -inos, rayon ; empr. au lat. bacterium, du gr. baktêrion, petit bâton). [Actinobacteria] Clade de Bactéries à Gram positif, aérobies, non mobiles, à taux élevé de guanine et de cytosine, incluant l’ancien groupe des actinomycètes et quelques autres groupes. ENCYCL. : Certaines sont des bâtonnets isolés, d’autres forment des files de cellules, ressemblant à des hyphes, et produisent des spores asexuées ou conidies parfois flagellées. C’est le clade de Bactéries ayant la diversité spécifique la plus grande avec 4 210 espèces connues, réparties en 6 classes : Acidimicrobies, Actinobactéries, Coriobactéries, Nitriliruptores Rubrobactéries, Thermoléophiles.

Actinobiologie n. f. (du gr. aktis, -inos, rayon, bios, vie, et logos, discours). [Actinobiology] Partie de la biologie qui étudie les effets des rayonnements électromagnétiques sur les êtres vivants, notamment dans la photosynthèse, le phototactisme, la vision, la synthèse de mélatonine et de vitamine D₂, les mutations génétiques.

Actinocongestine n. f. (du gr. aktis, -inos, rayon ; du lat. congerere, accumuler). [Actinocongestin] Chez les Cnidaires, toxine urticante voire mortelle synthétisée par les cnidoblastes et inoculée en un mouvement rapide par le filament urticant pour paralyser ou tuer les proies.

Actinodrome adj. (du gr. aktis, -inos, rayon, et dromos, course). [Actinodromous] Syn. : Palmatinervé. Voir cette entrée.

Actinomorphe adj. (du gr. aktis, -inos, rayon, et morphê, forme). [Actinomorphic, Actinomorphous] Se dit d’une fleur, d’une coroleO.R., qui présente une symétrie radiaire, c’est-à-dire dont les pétales (ou les tépales) sont semblables et disposés en cercle autour du réceptacle. Ce caractère s’appelle l’actinomorphie. Ex. : Brassicacées (à 4 pétales), Géraniacées (à 5 pétales), ornithogalesMOrnithogalum (à 6 tépales), dryade Dryas octopetala (à 8 pétales). Syn. : Régulier. Ant. : Zygomorphe.

Actinomorphie n. f. (du gr. aktis, -inos, rayon, et morphê, forme). [Actinomorphy] Voir Actinomorphe.

Actinomycine D n. f. [isolée en 1940 par les microbiologistes américains Selman Abraham Waksman 1888–1973, et Harold Boyd Woodruff 1917–2017] (du genre Actinomyces, et suff. -ine). [D Actinomycin] Antibiotique de la classe des actinomycines, polypeptidique, polycyclique, antitumoral, synthétisé par des Bactéries du genre Actinomyces. ENCYCL. : L’actinomycine D est un agent d’intercalation au voisinage des paires de bases guanine-cytosine (GC) de l’ADN, et empêche ainsi la transcription. Formule : C₆₂H₈₆N₁₂O₁₆.

Actinoptérygiens (Actinopterygii) n. m. pl. [Klein 1885] (du gr. aktis, -inos, rayon, et pterugion, nageoire). [Actinopterygians] Clade (rang : classe) de Vertébrés Gnathostomes, constituant le groupe frère des Sarcoptérygiens dans le clade des Ostéichtyens, appelés communément poissons (sans les Chondrichtyens, les cœlacanthes et les dipneustes). Ils vivent dans tous les habitats aquatiques à toutes les profondeurs. 30 675 espèces sont connues, réparties en deux clades : les Actinoptères (30 661 esp.) et les Cladistiens (14 esp.).

Actinorhize n. f. (de Actino(mycètes), et du gr. rhiza, racine). [Actinorhiza, pl. -ae] Nodule racinaire (= bactériorhize) où a lieu la fixation symbiotique et la réduction du diazote atmosphérique en ammoniac par des Actinobactéries du genre Frankia. ENCYCL. : Les plantes actinorhiziennes sont adaptées aux sols pauvres donc colonisatrices, et permettent la protection des sols contre l’érosion et la réhabilitation de sols dégradés. On rencontre cette symbiose chez près de 300 espèces ligneuses réparties dans 8 familles de Fabidées, dont les Bétulacées (tous les aulnes Alnus), les Casuarinacées (genres Allocasuarina, filaos Casuarina, Ceuthostoma, Gymnostoma) et les Éléagnacées (toutes les esp. des genres Elaeagnus, argousiers Hippophae, Shepherdia). Syn. : Nodule actinorhizien.

Actinorhizien, enne adj. (de actinorhize, de Actino(mycètes), et du gr. rhiza, racine). [Actinorhizal] Voir Actinozhize.

Actinostèle n. f. (du gr. aktis, -inos, rayon, et stêlê, colonne). [Actinostele] Un des trois types de protostèle (stèle sans moelle axiale), caractérisé par un massif de xylème central plein, au contour cannelé apparaissant étoilé en coupe transversale. ENCYCL. : Le phloème entoure les lobes de telle façon que les deux tissus conducteurs de sève s’interpénètrent. Ce type est rencontré chez les ptéridophytes fossiles dans les tiges et les racines, et chez les ptéridophytes actuelles dans les tiges des Psilotales et de certaines Lycopodiales, dans les racines des Fougères lato sensu, et dans la structure primaire des racines des Spermatophytes. Voir Protostèle, Haplostèle, Plectostèle.

Actinotriche n. m. (du gr. aktis, -inos, rayon, et thrix, trikhos, poil). [Actinotrichium, pl. -ia] Chacun des rayons exosquelettiques, d’origine dermique, soutenant la partie périphérique, non musculaire, des nageoires des poissons. ENCYCL. : Les actinotriches sont constitués d’élastoïdine, une sorte de collagène riche en tyrosine. Ils sont absents chez les raies (Chondrichtyens) et chez les Sarcoptérygiens (cœlacanthes et dipneustes). Voir Lépidotriche.

Actinotroque adj. (du gr. aktis, -inos, rayon, et trokhos, roue). Larve actinotroque [Actinotroch larva] Larve planctonique ciliée des Phoronidiens (Protostomiens > Spiraliens), issue du développement de la gastrula. ENCYCL. : Cette larve constitue une synapomorphie du clade des Phoronidiens. Elle est longue de 400 μm et porte, de l’avant vers l’arrière, un capuchon préoral ou épisome, une collerette postorale de tentacules ciliés appelée paratroqueM et un télotroque postérieur à longs cils locomoteurs.

Action dynamique spécifique des aliments f. [Specific dynamic action of food (= SDA)] Sigle : ADS – Augmentation de la dépense d’énergie en supplément du métabolisme basal, après la digestion d’un aliment, due au coutO.R. énergétique de conversion des nutriments en protéines et en substances de réserve (triglycérides et glycogène). ENCYCL. : L’ADS dépend du type d’aliments ingérés : l’ADS des lipides est d’environ 5 % du métabolisme basal (conversion simple), celle des glucides est de 5 à 10 % pour la conversion en glycogène, et celle des protides de 20 à 30 % pour la synthèse des acides aminés essentiels et la protéogenèse. Syn. : Thermogenèse post-prandiale, Thermogenèse induite par l’alimentation, Effet thermique des aliments.

Activateur (transcriptionnel) n. m. (de activer). [Activator] Facteur de transcription codé par un gène régulateur, qui stimule la transcription d’un gène ou d’un opéron en se liant :

– soit à des séquences régulatrices spécifiques situées près du promoteur à moins de 200 paires de bases en amont du site du début de la transcription ;

– soit à un amplificateur (= enhancer) situé de 200 à plusieurs milliers de paires de bases en amont du promoteur.

Chez les Eucaryotes, plusieurs activateurs coopératifs peuvent former sur un amplificateur un complexe multiprotéique appelé enhanceosome. Ex. : protéine bactérienne NtrC (angl. : Nitrogen regulatory protein C), protéine GAL4. Ant. : Répresseur.

Activateur des plaquettes m. [découvert en 1972 par Jacques Benveniste, immunologiste français 1935–2004] (de activer). [Platelet-activating factor (= PAF)] Syn. : Facteur d’activation plaquettaire. Voir cette entrée.

Activateur tissulaire du plasminogène m. (de activer). [Tissue-type plasminogen activator (= tPA)] Sigle : tPA (angl.) – Enzyme sérine-protéase (EC 3.4.21.68, chr. 8) synthétisée par les cellules endothéliales, qui clive le plasminogène inactif en plasmine responsable de la fibrinolyse donc de la dissolution du caillot sanguin. Ne pas confondre avec Activateur du plasminogène de type urokinase (uPA).

Activateur du plasminogène de type urokinase m. [découvert en 1947 par Mc Farlane et Pilling) (de activer). [Urokinase-type plasminogen activator (= uPA)] Sigle : uPA (angl.) – Enzyme sérine-protéase (EC 3.4.21.73, chr. 10) qui clive le plasminogène inactif en plasmine responsable de la fibrinolyse donc de la dissolution du caillot sanguin. ENCYCL. : Cette enzyme est présente dans le sang et dans la matrice extracellulaire où elle est liée à son récepteur urokinase (uPAR) membranaire à ancre GPI, ce qui localise près de la cellule la formation de plasmine. Ne pas confondre avec Activateur tissulaire du plasminogène (tPA).

Activation f. (de activer). [Activation] ► ① Déclenchement d’une fonction cellulaire, jusqu’alors en latence, ou d’une chaineO.R. de réactions métaboliques ;

► ② Liaison d’un métabolite avec un donneur de groupes, ce qui permet au métabolite de participer à une réaction biochimique. Ex. : activation du glucose par liaison avec l’ADP dans la synthèse d’amidon ;

► ③ Dépolarisation d’une membrane excitable.

Activation du complément f. (de activer). [Complement activation] Déclenchement d’une longue chaineO.R. de réactions enzymatiques entre les facteurs du système du complément, selon trois voies d’activation possibles :

– par la voie classique [Classical pathway] déclenchée par la liaison du facteur C1q aux fragments Fc des IgG1, IgG3 et IgM de complexes immuns, ce qui active C1r ;

– par la voie alterne [Alternative pathway] déclenchée par l’activation du facteur C3 par les endotoxines bactériennes, par les lipopolysaccaridesO.R. ;

– par la voie des lectines [Lectin pathway] déclenchée par la liaison de lectines appelées MBL (angl. : Mannose-Binding Lectin) à des oses dans des glycoprotéines de Bactéries et champignons. La liaison oses-MBL activent des sérine-protéases MASP (angl. : Mannose-binding lectin-Associated Serine Protease) qui cliveront C4 et C2.

Activation d’un acide aminé f. (de activer). [Amino acid activation] Liaison d’un acide aminé avec son ou ses ARNt spécifiques correspondants, catalysée par l’une des aminoacyl-ARNt synthétases. ENCYCL. : Une liaison ester est formée entre le groupe carboxyle –COOH de l’acide aminé et un hydroxyle –OH libre 2’ ou 3’ du ribose de l’adénylate situé à l’extrémité CCA-3’OH commune à tous les ARNt.

Activation enzymatique f. (de activer ; de enzyme). [Enzymatic activation] Acquisition ou augmentation réversible ou irréversible du pouvoir catalytique d’une enzyme, par clivage protéolytique (clivage du zymogène en une forme active), par phosphorylation ou déphosphorylation, par liaison de l’apoenzyme avec une coenzyme (cosubstrat comme NAD, NADP, ou groupement prosthétique comme FAD, FMN), par contrôle allostérique positif, par une protéine de contrôle comme le complexe Ca²⁺/calmoduline. Syn. : Bioactivation. Ant. : Inactivation enzymatique.

Activation transcriptionnelle f. (de activer ; de transcription). [Transcriptional activation] Activation de la transcription d’un gène ou d’un opéron, par liaison d’un activateur soit sur une séquence régulatrice spécifique située près du promoteur (site de fixation de l’ARN polymérase) à moins de 200 paires de bases en amont du site du début de la transcription, soit à un amplificateur (= enhancer) situé de 200 à plusieurs milliers de paires de bases en amont du promoteur. Voir Activateur transcriptionnel.

Activine n. f. (de activer, et suff. -ine). [Activin] Chacune des protéines dimériques activatrices de la famille des facteurs de croissance transformants (= TGF β), synthétisées dans les cellules granuleuses des ovaires et dans les cellules de Sertoli des testicules, activant la sécrétion de FSH par l’hypophyse. ENCYCL. : Elles sont formées de deux sous-unités β de 114 à 116 acides aminés (βA, βB, βC, βD, βE) reliées par un pont disulfure unique. Ce sont des facteurs inducteurs du mésoderme dans le centre de Nieuwkoop. Elles sont aussi impliquées dans de nombreuses fonctions : prolifération et différenciation cellulaires, apoptose, cicatrisation, sécrétion de l’insuline, sécrétions gonadiques, survie neuronale. Ant. : Inhibine.

Activité catalytique f. (de activer ; de catalyse). [Catalytic activity] Symb. : z – Grandeur du système international d’unités mesurant la quantité d’enzymes fonctionnelles qui catalysent la transformation d’une mole de substrat en produit en une seconde, exprimée en katal (= mol.s⁻¹, symb. : kat) ou en UI (= μmol/min, 1 kat = 6 × 10⁷ UI). Attention, l’activité catalytique n’est pas la mesure de la vitesse d’une réaction.

Activité optique f. (de activer ; du gr. optikos, relatif à la vue). [Optical activity] Syn. : Pouvoir rotatoire. Voir cette entrée.

Actomyosine n. f. (de act(ine) et myosine). [Actomyosin] Complexe protéique formé d’actines F et de myosines, obtenu in vitro en l’absence d’ATP. ENCYCL. : La fixation d’ATP aux têtes de myosine provoque la dissociation des deux filaments protéiques. In vivo, l’actomyosine, responsable des contractions musculaires, est liée à la tropomyosine et au complexe des troponines. Voir Actine, Myosine, Tropomyosine, Troponine.

Actophile adj. et n. m. (du lat. actus, mouvement, et du gr. philos, ami). [Actophilous (adj.), Actophile (n.)] Qui vit sur les rivages rocheux dans la zone touchée par les vagues. ENCYCL. : Ce caractère s’appelle l’actophilie. Il nécessite de résister à la fois au battement des vagues et aux contraintes de la zone intertidale : variation importante de température, dessiccation, milieu de vie moins porteur. Ex. : nombreux oursins, crabes, Mollusques Bivalves et Polyplacophores.

Actualisme n. m. (1898, de actuel). [Actualism] Théorie admise selon laquelle les phénomènes géologiques et biologiques passés étaient régis par les mêmes lois que les phénomènes actuels. ENCYCL. : L’actualisme est appliqué lors de la reconstitution des organismes et des paléoenvironnements. Formulé d’abord par James Hutton (1726–1797), l’actualisme s’oppose au catastrophisme soutenu notamment par Georges Cuvier (1769–1832) selon lequel les phénomènes passés sont survenus par des processus différents, plus rapides et plus violents, que les phénomènes actuels. L’actualisme n’interdit pas la possibilité de modifications rapides par la survenue d’événements catastrophiques, ponctuels et non habituels. Syn. : Uniformitarisme [Uniformitarianism]. S’oppose à catastrophisme.

Acuité sensorielle n. f. (du lat. acutus, aigu, et de sens). [Sensorial acuity] Degré de sensibilité, c’est-à-dire seuil de perception ou pouvoir de discrimination d’un organe sensoriel. ENCYCL. : Chez les humains :

– l’acuité visuelle de la fovéa est de 1,2 mm à une distance de 10 m, soit un écart de 2 μm sur la rétine ;

– l’acuité auditive, seuil d’audibilité des sons, dépend de la fréquence sonore, de 20 à 20 000 Hz ;

– l’acuité tactile, distance minimale permettant de distinguer deux points de contact, est plus grande sur les régions mobiles (doigts, langue, lèvres), environ 1 mm, que sur les régions fixes (dos, ventre), de 1 à 3 cm ;

– l’acuité gustative, seuil de perception du goutO.R., dépend de l’état métabolique (jeûne, satiété) ;

– l’acuité olfactive, seuil de détection d’une odeur, est faible chez les humains par rapport à celle de la plupart des autres Mammifères.

Aculé, e adj. (du lat. aculeus, aiguillon). [Aculeate] Qui est pourvu d’un aiguillon, d’une épine.

Aculéolé, e adj. (du lat. aculeus, aiguillon). [Aculeate] Chez les Eumycètes Agaricomycètes, se dit d’un type d’hyménophore dont les spores sont portées par des aiguillons, que l’on rencontre chez quelques familles : Hydnacées (O. Cantharellales), Bankéracées (O. Théléphorales), Auriscalpiacées (O. Russulales). Syn. : Hydné.

Acumen n. m. (mot lat., pointe). [Acumen] Extrémité d’un organe, particulièrement d’un limbe, qui est brusquement rétréci, effilé en une pointe longue. L’organe est dit acuminé. Ex. : apex des feuilles des noisetiers Corylus (F. Bétulacées), des tilleuls Tilia (F. Malvacées).

Acuminé, e adj. (de acumen, -inis, mot lat., pointe). [Acuminate] Voir Acumen.

Acuminifolié, e adj. (du lat. acumen, -inis, pointe, et foliatus, garni de feuilles). [Acuminifoliate] Se dit d’une plante dont les feuilles sont acuminées. Ex. : noisetiers Corylus (F. Bétulacées), tilleuls Tilia (F. Malvacées). Voir Acumen.

Acutiflore adj. (du lat. acutus, aigu, et flos, floris, fleur). [Acutiflorous] Se dit d’une plante dont les pétales et/ou les sépales sont étroits voire effilés, ou seulement terminés en pointe. Ex. : soldanelle des Alpes Soldanella alpina (F. Primulacées), gentiane asclépiade Gentiana asclepiadea (F. Gentianacées), parisette à quatre feuilles Paris quadrifolia (F. Mélanthiacées).

Acutifolié, e adj. (du lat. acutus, aigu, et foliatus, garni de feuilles). [Acutifoliate] Se dit d’une plante dont les feuilles sont aigüesO.R., terminées en pointe. Ex. : polémoine bleue Polemonium caeruleum (F. Polémoniacées).

Acutilobé, e adj. (du lat. acutus, aigu, et de lobe). [Acutilobate] Se dit d’une feuille, d’un limbe dont les lobes sont pointus voire piquants. Ex. : feuilles du houx Ilex (F. Aquifoliacées), de l’érable plane Acer platanus (F. Sapindacées).

Acyclique adj. (du gr. a-, préfixe privatif ; de cycle). [Acyclic] ► ① Se dit d’une fleur, d’un périanthe dont les pièces florales sont disposées sur une hélice et non sur un cycle. Les deux dispositions peuvent coexister dans une même fleur dite hémicyclique ou hémispiralée ou spirocyclique (ex. : renoncules Ranunculus). Ex. : Nymphéacées. Syn. : Spiralé. Ant. : Verticillé, Cyclique ;

► ② Se dit d’un composé à chaineO.R. ouverte, qui ne contient pas de cycle. ENCYCL. : Les acides aminés protéinogènes sont acycliques sauf 6 (sur 23) : 3 sont hétérocycliques : histidine, proline, pyrrolysine, et 3 sont aromatiques : phénylalanine, tryptophane, tyrosine ;

► ③ Se dit d’un phénomène qui n’est pas soumis à un cycle. Ex. : transfert acyclique des électrons entre l’eau (donneuse d’électrons) et le NADP⁺ (récepteur d’électrons) lors de la photosynthèse oxygénique.

Acylation n. f. (de acyle, de ac(ide) et suff. -yle). [Acylation] Fixation d’un groupe acyle R–C=O sur un composé organique, le donneur de groupe acyle (agent acylant) étant le plus souvent la coenzyme A qui se lie à l’acyle par une liaison thioester C=S à haut potentiel énergétique entre le carbonyle C=O de l’acyle et le sulfhydryle terminal –SH de la coenzyme A. ENCYCL. : L’acylation intervient :

– dans de nombreuses voies biochimiques avec plusieurs groupes acyles différents : acétoacétyle (synthèse du cholestérol, métabolisme des corps cétoniques), acétyle, coumaroyle (synthèse des flavonoïdes), HMG (synthèse des isoprénoïdes), malonyle (synthèse des acides gras), succinyle (synthèse de l’hème) ;

– dans la modification post-traductionnelle des protéines destinées à être ancrées à la membrane plasmique (ex. : sous-unité α des protéines G, protéine kinase AMPc dépendante, calcineurine B) : groupes myristoyle (myristoylation), palmitoyle (palmitoylation).

Acyl-CoA n. f. (de acyl(e) et co(enzyme) A). [Acyl-CoA] Abrév. de Acyl-coenzyme A. Voir cette entrée.

Acyl-coenzyme A n. f. (de acyl(e) et co-enzyme A). [Acyl-coenzyme A] Abrév. : acyl-CoA – Tout thioester de la coenzyme A et d’un acyle R–C=O. ENCYCL. : Plus particulièrement, forme activée des acides gras, lors de leur oxydation, résultant de la liaison thioester avec une coenzyme A grâce à une acyl-CoA synthétase (EC 6.2.1.3) sur la face externe de la membrane mitochondriale externe.

Acylglycérol n. m. (de acyl(e) et glycérol). [Acylglycerol] Glycérolipide du groupe des radylglycérols, formé d’un glycérol HOH₂C–CHOH–CH₂OH dont un, deux ou trois hydroxyles –OH sont estérifiés par le carboxyle d’un acide gras ce qui donne un mono-, di- ou triacylglycérol. Syn. : Glycéride. Voir Diacylglycérol et Triglycéride.

Acystidié, e adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et de cystide). [Acystidiate] Chez les Basidiomycètes, se dit de l’hyménium, de l’hyménophore, du sporophore qui ne porte pas de cystides (éléments stériles). Ex. : lactaireM humide acystidié Lactarius uvidus var. acystidiosus. Ant. : Cystidié.

ADA n. f. (sigle). [ADA] Sigle de Adénosine DésAminase. Voir cette entrée.

Adamantoblaste n. m. (du gr. adamos, adamantos, diamant, et blastos, germe). [Ameloblast] Syn. : Améloblaste. Voir cette entrée.

Adaptateur, trice n. m. et adj. (de adapter). [Adaptor] ► ① Oligonucléotide capable de réaliser la jonction entre deux fragments d’ADN dont les séquences terminales ne sont pas complémentaires, notamment lors de l’intégration d’un ADN étranger dans un vecteur ;

► ② Syn. : Protéine adaptatrice. Voir cette entrée.

Adaptation n. f. (de adapter). [Adaptation] ► ① Caractère héréditaire anatomique, physiologique ou comportemental d’un organisme, d’une population, d’une espèce, conférant un avantage qui augmente leur chance de survie et leur reproduction dans un milieu donné. Le terme désigne aussi le processus aboutissant au caractère. Ne pas confondre avec Accommodation. Voir Adaptationnisme ;

► ② Processus par lequel une cellule sensorielle, un organe modifie sa sensibilité, sa réaction à un stimulus. Ex. : adaptations à l’obscurité, à la lumière, à la chaleur, au froid, à la pression, aux bruits, aux odeurs.

Adaptationnisme n. m. (de adaptation, de adapter). [Adaptationism] Théorie controversée selon laquelle les caractères sont uniquement le résultat d’une adaptation aux contraintes exercées par la sélection naturelle. ENCYCL. : Ses détracteurs opposent à cette théorie plusieurs situations qu’elle n’explique pas, qu’elle ne prend pas en compte :

– la dérive génétique peut fixer des mutations défavorables malgré la sélection naturelle, ou perdre des mutations favorables ;

– la morphologie peut être la conséquence d’une sélection sur un autre caractère (cas de l’allométrie et de la pléiotropie) ;

– des caractères sélectionnés ne sont pas forcément adaptatifs ;

– une adaptation peut être postérieure à l’apparition du caractère, phénomène appelé exaptation : ex. : apparition des plumes des Dinosaures Théropodes qui ne servaient pas initialement pour le vol mais pour la thermorégulation.

Adapté, e adj. (de adapter). [Adapted] Se dit d’un organisme, d’une espèce qui présente des caractères héréditaires lui permettant l’adaptation à son milieu de vie. Ne pas confondre avec Accommodé.

Adaptine n. f. (de adapt(er), et suff. -ine). [Adaptin] Syn. : Protéine adaptatrice. Voir cette entrée.

Adaxial, ale, aux adj. (du lat. ad, près de, et axis, axe). [Adaxial] Qui est situé près de l’axe, tourné en direction de l’axe. Ex. : face adaxiale (ou ventrale) d’une feuille, tournée vers le haut, ou contre l’axe. Ant. : Abaxial.

ADCC n. f. (sigle). [ADCC] Sigle de l’anglais Antibody-Dependent Cell-mediated Cytotoxicity, Cytotoxicité à médiation cellulaire dépendant des anticorps. Voir cette entrée.

Adducteur n. m. et adj. m. (1690, du lat. adducere, conduire vers). [Adductor (n.), Adducent (adj.)] Voir Adduction.

Adduction n. f. (1541, empr. au lat. adductio, de adducere, conduire vers). [Adduction] Mouvement qui rapproche une partie du corps de l’axe de symétrie, réalisé par les muscles adducteurs. Ant. : Abduction.

Adélomorphe adj. (du gr. adelos, peu visible, et morphê, forme). [Adelomorphous, Adelomorphic] Qui n’a pas de forme définie. Ex. : cellules adélomorphes (ou principales) des glandes gastriques sécrétant le pepsinogène. Ant. : Délomorphe.

Adelphe adj. (du gr. adelphos, frère). [Adelphous] Se dit d’une fleur, d’un androcée dont les étamines sont soudées en un (monadelphe, ex. : Malvacées), deux (diadelphe, ex. : Fabacées) ou plusieurs faisceaux (polyadelphe, ex. : Hypéricacées). Ce caractère s’appelle l’adelphie. Syn. : Gamostémone, Synstémone. Ant. : Dialystémone, Apostémone.

Adelphophagie n. f. (du gr. adelphos, frère, et phagein, manger). [Adelphophagy] Type de cannibalisme réalisé par les embryons de certaines espèces animales qui se nourrissent des autres embryons frères moins développés ou abortifs. ENCYCL. : On rencontre l’adelphophagie dans plusieurs groupes, notamment chez les Mollusques Gastéropodes (F. Buccinidés, Calyptréidés, Muricidés, Vermétidés), les Annélides (Boccardia, Lumbricus, Nereis), les Téléostéens, les salamandres (Urodèles) et les requins vivipares mais aplacentaires de l’ordre des Lamniformes. La consommation d’œufs s’appelle l’oophagie.

Adénine n. f. [isolée et nommée (Adenin) en 1885 par Albrecht Kossel, biochimiste allemand 1853–1927] (empr. à l’all. Adenin, du gr. adên, glande, et suff. -ine). [Adenine] Symb. : A – Nucléobase azotée formée d’un noyau purique aminé (soit au total 5 atomes d’azote), entrant dans la composition de l’AMP (= Adénosine-5’-MonoPhosphate) et du dAMP (= désoxyAdénosine-5’-MonoPhosphate), de l’ADP et de l’ATP, de l’AMPc (= Adénosine MonoPhosphate cyclique) et des coenzymes NAD⁺ (= Nicotinamide Adénine Dinucléotide) et FAD (= Flavine Adénine Dinucléotide). Son nom provient du fait qu’elle a été isolée la première fois (en 1885) des nucléoprotéines d’une glande (en gr. : adên), le pancréas. Formule brute : C₅H₅N₅. Syn. : 6-Aminopurine, Vitamine B₄ (désuet). Voir AMP, ADP, ATP, AMPc, NAD, FAD.

Adénographie n. f. (du gr. adên, glande, et graphein, écrire). [Adenography] Syn. : Adénologie. Voir cette entrée.

Adénohypophyse n. f. (du gr. adên, glande ; empr. au gr. hupophusis, croissance en dessous, du gr. phuein, croitreO.R.). [Adenohypophysis] Partie glandulaire de l’hypophyse qui comprend le lobe antérieur (= pars distalis), le lobe intermédiaire (= pars intermedia) et une partie de la tige hypophysaire, le lobe tubéral (= pars tuberalis). ENCYCL. : L’adénohypophyse, opposée histologiquement à la neurohypophyse, possède de nombreux types de cellules hormonogènes qui sécrètent treize hormones (y compris celles issues de clivages protéolytiques) qui sont déversées dans la circulation sanguine : corticostimuline, endorphine, folliculostimuline, hormone lutéinisante, β-lipotropine, γ-lipotropine, mélanostimulines (α-MSH, β-MSH, γ-MSH), prolactine, somatostimuline, thyréostimuline, ainsi que le CLIP (angl. : Corticotropin-Like Intermediary Peptide). Ces hormones sont sécrétées sous contrôle de l’hypothalamus qui sécrète en amont des facteurs de libération, les libérines.

Adénoïde adj. (du gr. adên, glande, et eidos, aspect). [Adenoid] ► ① Qui a l’aspect d’une glande. Ex. : carcinome adénoïde ;

► ② Relatif aux ganglions lymphatiques. Ex. : végétations adénoïdes (hypertrophie des amygdales pharyngiennes).

Adénologie n. f. Vx (du gr. adên, glande, et logos, discours). [Adenology] Partie de l’anatomie qui traite des glandes. Le (la) spécialiste est l’adénologiste. Syn. : Adénographie.

Adénophylle adj. (du gr. adên, glande, et phullon, feuille). [Adenophyllous] Se dit d’une plante dont les feuilles sont glandulaires, particulièrement les plantes carnivores dont les feuilles sécrètent le suc digestif, et les plantes à huiles essentielles (Lamiacées), à résine (conifères), à latex (Euphorbiacées, Papavéracées).

Adénosine n. f. [mot créé en all. (Adenosin) en 1909 par Levere et Jacobs] (empr. à l’all. Adenosin, de Adenin, du gr. adên, glande, os(e), et suff. -ine). [Adenosine] Symb. : A, ADO – Ribonucléoside constitutif des ARN et des nucléotides AMPc, ADP et ATP, formé par la combinaison d’une adénine (sur le N9) et d’un ribose (sur le C1) par une liaison β-N9-glucoside. Formule brute : [C₅H₉O₄]–[C₅H₄N₅]. Syn. : 2-(6-Aminopurin-9-yl)-5-(hydroxyméthyl)oxolane-3,4-diol (nom IUPAC).

Adénosine-5’-diphosphate n. f. [Adenosine-5’-diphosphate] Sigle : ADP. Voir cette entrée.

Adénosine diphosphate glucose n. m. [Adenosine diphosphate glucose] Syn. : ADP-glucose. Voir cette entrée.

Adénosine-5’-monophosphate n. f. [Adenosine-5’-monophosphate] Sigle : AMP. Voir cette entrée.

Adénosine-5’-monophosphate cyclase n. f. [Adenosine-5’-monophosphate cyclase] Syn. : Adénylate cyclase. Voir cette entrée.

Adénosine-5’-monophosphate cyclique f. [Cyclic adenosine monophosphate] Sigle : AMPc. Voir cette entrée.

Adénosine-5’-phosphosulfate n. f. (empr. à l’all. Adenosin, de Adenin, du gr. adên, glande, os(e), et suff. -ine). [Adenosine-5’-phosphosulfate] Sigle : APS – Nucléotide sulfaté issu de la combinaison d’un ATP et d’un sulfate par la sulfate adénylyltransférase (EC 2.7.7.4), constituant un intermédiaire de la réduction des sulfates SO₄2– en sulfites SO₃2– lors de l’assimilation des sulfates par les végétaux ou par les bactéries réduisant les sulfates. Syn. : Adénylate sulfate. Voir Phosphoadénosine-5’-phosphosulfate (= PAPS).

Adénosine triphosphatase n. f. [Adenosine triphosphatase] Sigle : ATPase. Voir cette entrée.

Adénosine-5’-triphosphate n. f. [Adenosine-5’-triphosphate] Sigle : ATP. Voir cette entrée.

Adénovirus n. m. [découvert dans les amygdales en 1953 par Wallace Prescott Rowe, virologiste américain 1926–1983] (empr. à l’angl. adenovirus, du gr. adên, glande, car isolé des amygdales, et virus). [Adenovirus, pl. -uses] Tout virus de la famille des Adénoviridés, d’un diamètre de 60 à 100 nm, non enveloppé, caractérisé par un ADN double brin linéaire de 26 000 à 46 000 paires de bases, et une capside icosaédrique formée de 252 capsomères. ENCYCL. : L’infection adénovirale peut se traduire par une conjonctivite, une amygdalite, une bronchiolite, une gastroentérite.

Adénylate n. m. (de (acide) adényl(ique), et suff. -ate). [Adenylate] Base conjuguée de l’acide adénylique ou adénosine-5’-monophosphate. Voir AMP.

Adénylate cyclase n. f. (de (acide) adényl(ique), et suff. -ate). [Adenylate cyclase] Sigle : AC – Enzyme (EC 4.6.1.1) membranaire intrinsèque qui catalyse la conversion de l’ATP en AMPc. ENCYCL. : Six classes I à VI ont été décrites, l’adénylate cyclase de classe III étant la plus étudiée : elle constitue un élément important de l’amplification cellulaire du signal car une seule molécule de ligand active plusieurs enzymes qui catalyseront chacune la formation de nombreuses molécules d’AMPc. Syn. : Adénosine-5’-monophosphate cyclase, Adénylyl cyclase. Voir AMPc.

Adénylate kinase n. f. (de (acide) adényl(ique), et suff. -ate). [Adenylate kinase] Sigle : AK ou ADK – Enzyme (EC 2.7.4.3) ubiquitaire qui catalyse la transphosphorylation entre nucléotides adényliques (2 ADP ⇆ AMP + ATP) et joue un rôle mineur dans l’homéostasie bioénergétique des cellules en les réapprovisionnant en ATP. Syn. : Myokinase.

Adénylique adj. (de adén(ine), et suff. -ylique). Acide adénylique [Adenylic acid] Voir AMP et Ribonucléotide.

ADH n. f. (sigle). [ADH] Sigle de l’angl. AntiDiuretic Hormone. Syn. : Vasopressine. Voir cette entrée.

Adhérent, e adj. (du lat. adhaerens, de ad, près de, et haerere, être fixé). [Adherent] Se dit d’un organe qui est soudé à la formation voisine. Ex. : étamines soudées à d’autres pièces florales. Syn. : Adné.

Adhésine n. f. (de adhés(ion), et suff. -ine). [Adhesin] Tout facteur de virulence protéique, glucidique ou lipidique qui permet l’adhérence des bactéries, première étape de l’infection bactérienne, en se liant soit à des récepteurs spécifiques de leur cellule hôte soit à un substrat inerte spécifique (ex. : émail). Les adhésines sont souvent constitutives de l’extrémité des fimbriae. Ex. : FimH, acides téichoïques. Syn. : Facteur d’adhérence.

Adipeux, euse adj. (1503, du lat. adeps, adipis, graisse). [Adipose] Chez les animaux, se dit d’un organe, d’un tissu ou d’une cellule, qui est riche en lipides de réserve (triglycérides). Ex. : tissu adipeux, cellule adipeuse. Voir Adipocyte, Tissu adipeux.

Adipocyte n. m. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. kutos, cavité, cellule). [Adipocyte] Cellule conjonctive des tissus adipeux blanc et brun, spécialisée dans le stockage d’énergie sous forme d’inclusions lipidiques de glycérides et d’esters de cholestérol. Syn. : Cellule adipeuse, Lipocyte. Voir Adipocyte blanc, Adipocyte brun.

Adipocyte blanc m. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. kutos, cavité, cellule). [White adipocyte] Cellule adipeuse fréquente surtout dans l’hypoderme, le mésentère et la moelle osseuse, mesurant de 100 à 150 μm de diamètre, de forme plutôt arrondie et possédant une grosse gouttelette lipidique (cellule uniloculaire) comprimant un cytoplasme peu abondant contenant peu de mitochondries à la périphérie de la cellule. ENCYCL. : Les adipocytes blancs présentent des récepteurs pour l’insuline, les glucocorticoïdes, l’hormone de croissance, l’adrénaline et la noradrénaline. Sous l’action de l’insuline, ils synthétisent des glycérides (lipogenèse) à partir des acides gras provenant du sang. Sous l’action des autres ligands hormonaux, ils hydrolysent les triglycérides en acides gras (lipolyse) qui sont libérés dans le sang. Ils sécrètent diverses hormones peptidiques ou adipokines : la leptine, l’adiponectine, la résistine. Voir Adiponectine, Leptine.

Adipocyte brun m. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. kutos, cavité, cellule). [Brown adipocyte] Cellule adipeuse responsable de la thermogenèse chimique sans frisson chez les animaux adaptés au froid, les hibernants et les nouveau-nés, mesurant 30 μm de diamètre, de forme plutôt polygonale, possédant de nombreuses petites gouttelettes lipidiques (cellule multiloculaire) dans un cytoplasme abondant avec de nombreuses mitochondries riches en cytochromes (dans la chaineO.R. respiratoire) qui leur donnent leur couleur brune. ENCYCL. : Les adipocytes bruns sont surtout présents autour du cœur, des reins et des gros vaisseaux (aorte, carotides, veines brachiales, jugulaires et caves), sont bien vascularisés et sont innervés par des fibres nerveuses sympathiques noradrénergiques (libérant de la noradrénaline). Ils possèdent la thermogénine ou UCP1 (angl. : UnCoupling Protein), une protéine thermogène qui forme un canal ionique conduisant les protons de l’espace intermembranaire vers la matrice pour dissiper le gradient électrochimique transmembranaire sans production d’ATP mais en libérant de la chaleur qui est transmise au sang. Voir Thermogénine.

Adipogenèse n. f. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. genesis, formation). [Lipogenesis] Syn. : Lipogenèse. Voir cette entrée.

Adipolyse n. f. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. lusis, dissolution). [Lipolysis] Syn. : Lipolyse. Voir cette entrée.

Adiponectine n. f. [découverte en 1995] (du lat. adeps, adipis, graisse, et nectere, attacher). [Adiponectin] Protéine (226 a. a., chr. 3) sécrétée en grande quantité dans le sang (0,01 % des protéines plasmatiques) par les adipocytes (c’est une adipokine), possédant de nombreux rôles dans le métabolisme du glucose et des lipides. ENCYCL. : L’adiponectine stimule la β-oxydation des acides gras, augmente la sensibilité des récepteurs à l’insuline, augmente la translocation des transporteurs GLUT4 vers la membrane plasmique donc l’absorption de glucose par les tissus, diminue la néoglucogenèse. Elle empêche la formation des plaques d’athérome (= athérogenèse) en inhibant l’expression des cytokines inflammatoires et des molécules d’adhérence sécrétées par les cellules endothéliales endommagées. Syn. : ACRP30 (angl. : Adipocyte Complement-Related 30 kDa Protein), apM1 (angl. : adipose Most abundant gene transcript 1).

Adipopexie n. f. (du lat. adeps, adipis, graisse ; du gr. pêxis, fixation). [Adipopexis] Syn. : Lipogenèse. Voir cette entrée.

Adjuvant immunologique m. [inventé en 1925 par Gaston Ramon, vétérinaire et biologiste français 1886–1963] (du lat. adjuvare, aider). [Immunologic adjuvant] Toute substance organique ou inorganique qui augmente la réponse immunitaire spécifique à un antigène, sans être elle-même antigénique, particulièrement dans les vaccins. ENCYCL. : Les adjuvants peuvent agir en favorisant la migration des antigènes vers les ganglions lymphatiques, en ralentissant l’élimination des antigènes, en augmentant la réaction immunitaire locale au site d’injection. Ex. : sels d’aluminium (alun, hydroxyde d’aluminium, phosphate d’aluminium), squalène, muramyl-dipeptide, oligonucléotides de synthèse, adjuvant 65 (à base d’huile d’arachide), saponines. Syn. : Immunoadjuvant, Immunomodulateur.

L’adjuvant incomplet de Freund est une émulsion formée d’eau, d’huile minérale et d’un agent émulsifiant (mono-oléate de mannitol ou de sorbitol). L’adjuvant complet de Freund contient en outre des fragments de bactéries tuées comme Mycobacterium tuberculosis.

Adlittoral, ale, aux adj. (du lat. ad, près de ; empr. au lat. littoralis, du rivage). [Adlittoral] Se dit d’une zone littorale ou d’un organisme hygrohalin, c’est-à-dire jamais immergé mais en contact avec la mer par les embruns. Les organismes adlittoraux doivent être adaptés à une forte salinité du sol (halophiles) et à une diminution de la disponibilité de l’eau. Syn. : Juxtalittoral.

ADN ou A.D.N. n. m. [découvert en 1869 (nucléine) par Johannes Friedrich Miescher, médecin et biologiste suisse 1844–1895] (sigle de Acide DésoxyriboNucléique). [DNA (DeoxyriboNucleic Acid)] Macrobiomolécule polynucléotidique non ramifiée composée généralement d’une double chaineO.R. hélicoïdale de désoxyribonucléotides qui constitue le support des informations génétiques de tous les êtres vivants et des virus à ADN (groupes I et II). ENCYCL. : Chez les Eucaryotes, l’ADN est situé majoritairement dans le noyau des cellules, et une partie dans les mitochondries et les chloroplastes. Chez les procaryotes, l’ADN (nucléoïde) est situé dans le cytoplasme. Chez les virus à ADN, il est protégé par la capside. Chez les Eucaryotes et certaines Archées (ex. : Euryarchéotes), la molécule d’ADN est enroulée autour de protéines appelées histones ce qui permet sa compaction en chromatine et chromosomes. Chaque monomère ou nucléotide est formé d’une nucléobase azotée purique (adénine A et guanine G) ou pyrimidique (cytosine C et thymine T), liée à un désoxyribose, lui-même lié à un phosphate. Les deux chainesO.R. hélicoïdales appelées brins sont antiparallèles et complémentaires selon les règles d’appariement suivantes : l’adénine est liée à la thymine par deux liaisons hydrogène, et la guanine est liée à la cytosine par trois liaisons hydrogène.

L’ordre d’enchainementO.R. des nucléotides d’un brin constitue la séquence porteuse de l’information génétique transmise héréditairement. La modification de la séquence constitue une mutation génétique qui peut être pour l’organisme avantageuse, silencieuse, désavantageuse voire létale. On distingue de nombreux types d’ADN selon plusieurs caractéristiques :

a. les types d’ADN selon leur localisation dans la cellule : ADN chloroplastique (= ADNcp), ADN chromosomique, ADN extrachromosomique, ADN mitochondrial (= ADNmt), ADN nucléaire, ADN plasmidique ;

b. les types d’ADN selon le nombre de brins :

– ADN à un brin : ADN simple brin ou ADN monocaténaire ou ADN monobrin [Single-stranded DNA (ssDNA)] ADN des virus du groupe II (classification de Baltimore) ;

– ADN à deux brins : ADN double brin ou ADN bicaténaire ou ADN duplex [Double-stranded DNA (dsDNA)] Conformation naturelle la plus courante de l’ADN, formée de deux brins complémentaires antiparallèles ;

– ADN à trois brins : ADN triple brin ou ADN tricaténaire ou ADN triplex ou ADN H [Triple-stranded DNA] ADN composé soit de deux brins polypuriques et un brin polypyrimidique, soit d’un brin polypurique et deux brins polypyrimidiques, formant dans les deux cas une triple hélice ;

– ADN G-quadruplex ou ADN G [G-Quadruplex] Conformation de l’ADN rencontrée au niveau des télomères et des promoteurs de certains gènes, caractérisée par au moins quatre guanines appariées par des liaisons de type Hoogsteen pour former une structure planaire carrée appelée tétrade, stabilisée par un cation monovalent en son centre. Les quadruplex diminuent l’activité de la télomérase qui est responsable du maintien de la longueur des télomères des chromosomes, et sont impliqués dans la plupart des cancers.

c. les types d’ADN selon la conformation spatiale de la spirale :

– ADN A [A-DNA] Conformation dont les tours de spires sont plus courts et plus larges que ceux de l’ADN B. Cette conformation existe lorsqu’il y a un manque d’eau pour hydrater l’hélice et n’existe donc pas dans les conditions physiologiques ;

– ADN B [B-DNA] Conformation naturelle, la plus courante, de l’ADN en solution ;

– ADN circulaire [Circular DNA] ADN sans extrémité libre, rencontré chez les procaryotes, les virus à ADN, les mitochondries, les chloroplastes et les plasmides.

ADN antisens m. (du gr. anti, contre, et sens). [Antisense DNA] Séquence complémentaire de la séquence considérée. L’ADN antisens d’un gène est le brin non transcrit. Ant. : ADN sens.

ADN centromérique m. (de centromère, de centre, et du gr. meros, partie). [Centromeric DNA] ADN constitutif des centromères des chromosomes, composé surtout d’ADN satellite, hautement répété, formé de courtes séquences de 1 à 500 paires de bases répétées en tandem jusqu’à plusieurs milliers de fois. ENCYCL. : Dans cet ADN, l’histone H3 des nucléosomes est remplacée épigénétiquement, en présence de petits ARN interférents (= ARNsi pour small interfering) et de cohésine, par une histone spécifique des centromères, comme CENP-A chez les humains (angl. : CENtromere Protein A), importante pour le recrutement et l’assemblage du kinétochore sur le centromère.

ADN chimère m. (du gr. khimeira, monstre mythologique à tête de lion, ventre de chèvre et queue de dragon). [Chimeric DNA] Syn. : ADN recombiné. Voir cette entrée.

ADN chloroplastique m [découvert en 1962] (de chloroplaste, du gr. khlôros, vert ; de plaste, du gr. plassein, modeler). [Chloroplast DNA (= cpDNA)] Abrév. : ADNcp – ADN des chloroplastes composé de 120 à 170 kpb, long de 30 à 60 μm, circulaire ou linéaire, dépourvu d’histones. ENCYCL. : Présent en une centaine de copies (dans les chloroplastes jeunes), il code de nombreuses molécules : des ARNr, une trentaine d’ARNt, des protéines ribosomiques, les photosystèmes I et II, les cytochromes et diverses enzymes : des ARN polymérases, la grosse sous-unité de la rubisco, l’ATP synthase, la NADH déshydrogénase, l’acétyl-CoA carboxylase.

ADN codant m. (de coder). [Coding DNA] Séquence d’ADN composée de l’ensemble des exons, transcrite en pré-ARNm et ARNm, eux-mêmes traduits en polypeptides. Ant. : ADN non codant.

ADN complémentaire m. (de complément). [Complementary DNA (= cDNA)] Abrév. : ADNc – ADN double brin synthétisé à partir d’un ARNm grâce à une transcriptase inverse chez les rétrovirus (VIH), ainsi qu’in vitro en présence de désoxynucléotides triphosphate pour la synthèse du premier brin d’ADN, d’une ARNase pour digérer l’ARN et d’une ADN polymérase pour synthétiser l’ADN complémentaire du premier brin.

ADN de jonction ou de liaison m. (de joindre, et de lier). [Linker DNA] Syn. : ADN internucléosomique. Voir cette entrée.

ADN dénaturé m. (p. p. de dénaturer, du lat. dis, indiquant l’éloignement, et de nature). [Denatured DNA] ADN simple brin formé in vitro par rupture des liaisons hydrogène des paires de nucléobases d’un ADN double brin grâce à des agents chimiques (solutions ioniques, pH extrême) ou à des agents physiques (température élevée, la température où 50 % de l’ADN est dénaturé s’appelant température de fusion moléculaire).

ADN égoïste m. (du lat. ego, moi, car il ne confère aucun avantage à la cellule). [Selfish DNA] Syn. : ADN mobile. Voir cette entrée.

ADN espaceur m. (de espacer). [Spacer DNA] Région d’ADN non codant présent soit à l’intérieur (ADN espaceur transcrit interne = ITS) soit entre (ADN espaceur transcrit externe = ETS) les unités de transcription répétées en tandem transcrites en ARN ribosomiques et en petits ARN nucléaires. Syn. : ADN intercalaire.

ADN génique m. (de gène). [Genic DNA] Ensemble de l’ADN des gènes et des gènes nécessaires à leur expression, comprenant :

– l’ADN codant les polypeptides (exons) ;

– les introns (ADN non codant) ;

– les domaines de contrôle de l’expression (ex. : amplificateurs) ;

– les gènes répétés en tandem transcrits en ARNr et en petits ARN nucléaires (ARNsn) et nucléolaires (ARNsno) ;

– les gènes répétés transcrits en ARNt et en histones.

Ant. : ADN non génique.

ADN glycosylase n. f. [DNA glycosylase] Enzyme (EC 3.2.2.x) de réparation de l’ADN par excision de base (BER, angl. : Base Excision Repair) qui catalyse l’hydrolyse de la liaison N-glycosidique entre le désoxyribose et une base spécifique endommagée ou mal appariée dans l’ADN (comme l’hypoxanthine et l’uracile). Syn. : ADN glycosidase.

ADN hélicase n. f. [découverte en 1976 chez Escherichia coli] (de hélice (d’ADN)). [DNA helicase] Enzyme (EC 3.6.4.12) motrice qui catalyse le déroulement de la double hélice d’ADN en utilisant l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP pour rompre les liaisons hydrogène entre bases complémentaires. ENCYCL. : Il existe de nombreuses hélicases (1 % des gènes eucaryotiques codent des ADN ou ARN hélicases) spécialisées dans de nombreuses activités cellulaires qui nécessitent le déroulement de l’hélice : réplication, transcription, traduction, recombinaison, réparation.

ADN hétéroduplex m. (du gr. heteros, autre ; empr. au lat. duplex, double). [Heteroduplex DNA] ADN double brin recombiné dont les brins proviennent de molécules d’ADN différentes et dont les appariements des nucléobases sont imparfaits. ENCYCL. : L’hybridation de l’ADN suivie de la dénaturation de l’hétéroduplex constitue une méthode d’analyse phylogénétique : la température de fusion moléculaire de l’hétéroduplex, pour laquelle 50 % de l’ADN est dénaturé, est proportionnelle à la complémentarité des bases donc à la parenté évolutive des espèces qui ont fourni les brins. Ant. : ADN homoduplex.

ADN homoduplex m. (du gr. homos, semblable ; empr. au lat. duplex, double). [Homoduplex DNA] ADN double brin issu de la combinaison de deux brins entièrement complémentaires, à stringence très élevée, dont l’appariement des bases se fait sans erreur. Ant. : ADN hétéroduplex.

ADN hybride m. (du lat. hybrida, de sang mêlé). [Hybrid DNA] Syn. : ADN recombiné. Voir cette entrée.

ADN intercalaire m. (du lat. intercalarius). [Spacer DNA] Syn. : ADN espaceur. Voir cette entrée.

ADN intercistronique adj. (du lat. inter, entre ; de cis, et trans). [Intercistronic] ADN situé entre les gènes d’un opéron polycistronique.

ADN internucléosomique m. (du lat. inter, entre ; de nucléosome). [Internucleosomal DNA, Linker DNA] Segment d’ADN double brin reliant deux nucléosomes successifs, long de 10 à 80 paires de bases selon les espèces d’Eucaryotes et le tissu, et stabilisé par l’histone H1. Syn. : ADN de jonction, ADN de liaison, ADN lieur.

ADN lieur m. (de lier). [Linker DNA] Syn. : ADN internucléosomique. Voir cette entrée.

ADN ligase n. f. (de l’angl., du lat. ligare, lier). [DNA ligase] Enzyme (EC 6.5.1.1) de la classe des ligases qui catalyse la formation d’une liaison phosphodiester entre deux nucléotides consécutifs d’un brin d’ADN, en utilisant l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP en AMP (Eucaryotes et bactériophage T4) ou du NAD⁺ en nicotinamide mononucléotide NMN (procaryotes). ENCYCL. : Chez les Mammifères, il existe trois ligases agissant légèrement différemment, codées par des gènes portés par des chromosomes différents : l’ADN ligase I (chr. 19), l’ADN ligase III (chr. 17) et l’ADN ligase IV (chr. 13).

ADN méthyltransférase n. f. [DNA methyltransferase] Abrév. : ADN MTase ou DNMT – Enzyme (EC 2.1.1.x, à coenzyme S-adénosylméthionine) qui catalyse la méthylation épigénétique d’adénines et de cytosines de l’ADN, le donneur de méthyle étant la S-adénosylméthionine (= SAM). ENCYCL. : Il existe différentes enzymes spécifiques d’un type de méthylation (au niveau du C5 d’une cytosine ou du N6 d’une adénine ou du N4 d’une cytosine).

ADN mitochondrial m. (de mitochondrie, du gr. mitos, filament, et khondrion, petit grain). [Mitochondrial DNA (= mtDNA)] Abrév. : ADNmt – ADN double brin des mitochondries, circulaire sauf chez certains unicellulaires et certains Cnidaires, de taille très variable, non associé à des histones, codant des ARNr, des ARNt et des protéines mitochondriales. ENCYCL. : Chez les humains, il contient 16 569 paires de bases formant 37 gènes, 13 codant des polypeptides (ATP synthase, cytochrome c oxydase, NADH déshydrogénase, cytochrome b), 22 codant des ARN de transfert et 2 codant les ARNr des ribosomes mitochondriaux (12 S et 16 S). Le code génétique mitochondrial diffère du code standard et en fonction des espèces.

ADN mobile m. [découvert en 1948 dans le maïs par Barbara McClintock, généticienne américaine, P. N. 1983 de physiologie, 1902–1992] (du lat. mobilis, qui se meut). [Mobile DNA] ADN moyennement répété, dispersé dans le génome des Eucaryotes et des procaryotes, et capable de se déplacer, se transposer, dans le génome. ENCYCL. : Il constitue de 25 à 50 % de l’ADN des Mammifères (45 % de l’ADN humain), mais il n’a pas de rôle connu pour la cellule d’où son autre appellation d’ADN égoïste. Il a influencé l’évolution soit en s’insérant à l’intérieur ou près d’une unité de transcription, soit avec des recombinaisons entre répétitions dispersées dans les introns de deux gènes ce qui entraineO.R. un brassage des exons. L’ADN mobile regroupe plusieurs types d’ADN :

– les transposons d’ADN, qui se déplacent dans de nouveaux sites sous forme d’ADN ;

– les rétrotransposons à LTR (angl. : Long Terminal Repeats) qui se déplacent dans de nouveaux sites en étant d’abord transcrits en copies d’ARN qui subissent une transcription inverse en ADN puis une intégration ;

– les rétrotransposons sans LTR (LINE et SINE, angl. : Long and Short Interspersed Nuclear Elements), qui se déplacent en s’associant à des protéines ORF (angl. : Open Reading Frames) codées par les LINE ;

– les pseudogènes remaniés, provenant de copies non fonctionnelles d’ARNm épissés, donc dépourvus d’introns ;

– les copies de gènes codant de petits ARN nucléaires (ARNsn pour small nuclear) et des ARNt.

Syn. : ADN égoïste.

ADN non codant m. [Noncoding DNA] Ensemble de l’ADN non traduit en polypeptides, certaines séquences d’ADN non codant pouvant être transcrites en ARNr, ARNt, petits ARN nucléaires (= ARNsn) et nucléolaires (= ARNsno), microARN, petits ARN interférents (= pARNi). ENCYCL. : Le génome humain contient 98 % d’ADN non codant. L’ADN non codant regroupe plusieurs types d’ADN :

– l’ADN génique excepté les exons ;

– l’ADN mobile ou moyennement répété dispersé (transposons d’ADN, rétrotransposons, pseudogènes remaniés) ;

– l’ADN hautement répété présent dans les centromères et les télomères (ADN satellite, ADN minisatellite, ADN microsatellite).

Ant. : ADN codant.

ADN non génique m. (de gène). [Nongenic DNA] ADN non codant dépourvu de gènes, composé de l’ADN mobile ou moyennement répété dispersé (transposons, rétrotransposons, pseudogènes remaniés) et de l’ADN hautement répété présent dans les centromères et les télomères (ADN satellite, ADN minisatellite, ADN microsatellite). Ant. : ADN génique.

ADN pol n. f. [DNA pol] Abréviation de ADN polymérase. Voir cette entrée.

ADN polymérase n. f. [ADN pol I découverte en 1956 chez Escherichia coli par Arthur Kornberg, biochimiste américain, P. N. 1959 de physiologie, 1918–2007] (du gr. polumerês, en plusieurs parties, et suff. -ase). [DNA polymerase] Abrév. : ADN pol – Groupe d’enzymes (EC 2.7.7.7) qui catalysent l’allongement d’un brin d’ADN à partir d’un brin matrice en ajoutant des désoxyribonucléotides selon les règles d’appariement à l’extrémité 3’-OH d’une amorce d’ADN ou d’ARN, donc dans le sens 5’→3’. ENCYCL. : Les ADN polymérases des procaryotes sont notées de I à V, celles des Eucaryotes avec des lettres grecques et celles des Archées avec des lettres capitales (B et D). Aucune ADN polymérase ne peut débuter la synthèse d’un brin de novo. Selon le brin matrice, on distingue deux types d’ADN polymérases :

– les ADN polymérases ADN-dépendantes, impliquées dans la réplication et la réparation de l’ADN ;

– les ADN polymérases ARN-dépendantes, qui sont des transcriptases inverses qui synthétisent de l’ADN à partir d’un ARN, dans le cycle de reproduction des Rétrovirus et des Pararétrovirus.

Voir les entrées ci-après.

ADN polymérase I n. f. [découverte en 1956 par Arthur Kornberg, biochimiste américain 1918–2007, P. N. de médecine pour cette découverte] (du gr. polumerês, en plusieurs parties, et suff. -ase). [DNA polymerase I] Abrév. : ADN pol I – ADN polymérase procaryotique (EC 2.7.7.7, 928 a. a.) de faible processivité, à double activité exonucléasique 3’→5’ et 5’→3’, responsable de l’ajout des nucléotides nécessaires entre les fragments d’Okazaki du brin retardé, lors de la réplication de l’ADN, et responsable de la réparation de l’ADN et de l’autocorrection. C’est la première ADN polymérase découverte, chez Escherichia coli (Protéobactéries γ).

ADN polymérase II n. f. [découverte en 1970 par Thomas Kornberg, fils d’Arthur Kornberg qui avait découvert l’ADN pol I en 1956] (du gr. polumerês, en plusieurs parties, et suff. -ase). [DNA polymerase II] Abrév. : ADN pol II – ADN polymérase procaryotique (EC 2.7.7.7, 782 a. a.) de faible processivité, à activité exonucléasique 3’→5’, monomérique, responsable de la réparation de liaisons inter-brins de l’ADN et des corrections des erreurs des ADN polymérases III et IV. ENCYCL. : Elle permet la reprise transitoire de la réplication lors d’un blocage de l’ADN polymérase III à la fourche de réplication. Sa liaison avec des protéines augmente sa processivité.

ADN polymérase α n. f. (du gr. polumerês, en plusieurs parties, et suff. -ase). [DNA polymerase α] Abrév. : ADN pol α – ADN polymérase eucaryotique (EC 2.7.7.7) de faible processivité, dépourvue d’activité exonucléasique 3’→5’, responsable de la synthèse des amorces d’ARN des deux brins précoce et retardé (grâce aux sous-unités PRIM1 et 2 à activité primase) et responsable du démarrage de la réplication, allongeant l’amorce d’environ 20 nucléotides.

ADN polymérase β n. f. (du gr. polumerês, en plusieurs parties, et suff. -ase). [DNA polymerase β] Abrév. : ADN pol β – ADN polymérase eucaryotique (EC 2.7.7.7, 335 a. a.) responsable de la réparation de l’ADN par excision de base (= BER, angl. : Base Excision Repair). ENCYCL. : Sa synthèse est étroitement régulée par le facteur de transcription CREB1 qui se lie aux éléments de réponse à l’AMPc (= CRE, angl. : cAMP Response Element) présent dans le promoteur du gène.

ADN primase n. f. (sigle d’Acide DésoxyriboNucléique ; de l’angl. to prime, amorcer). [RNA primase] Lors de la réplication de l’ADN, ARN polymérase de faible processivité qui synthétise de novo de courts segments d’ARN (4 à 12 nucléotides) servant d’amorces à l’ADN polymérase, qui, elle, est incapable de synthétiser de novo. ENCYCL. : Chez les Bactéries, trois primases sont associées à l’hélicase DnaB pour former un complexe appelé primosome. Chez les Eucaryotes, la primase est hétérodimérique (sous-unités PRIM1 et 2) et complexée avec l’ADN polymérase α. Syn. : Primase, DnaG (chez les Bactéries). Voir ADN polymérase α, DnaG.

ADN recombiné ou recombinant m. [Recombinant DNA] ADN double brin dont les brins proviennent de molécules d’ADN différentes. ENCYCL. : L’hybridation de l’ADN suivie de la dénaturation de l’hétéroduplex constitue une méthode d’analyse phylogénétique : la température de fusion moléculaire de l’hétéroduplex, pour laquelle 50 % de l’ADN est dénaturé, est proportionnelle à la complémentarité des bases donc à la parenté évolutive des espèces qui ont fourni les brins. Syn. : ADN chimère, ADN hybride.

ADN répété dispersé m. [Interspersed repetitive DNA] Syn. : ADN mobile. Voir cette entrée.

ADN répété ou répétitif m. [Repetitive DNA] ADN formé de séquences répétées, présent en multiples copies dans le génome, regroupant :

– l’ADN répété en tandem codant les ARNr et les petits ARN nucléaires (= ARNsn) ;

– l’ADN répété codant les ARNt et les histones ;

– l’ADN moyennement répété dispersé ou ADN mobile (transposons d’ADN, rétrotransposons, pseudogènes remaniés) ;

– l’ADN hautement répété en tandem, non codant, présent dans les centromères et les télomères (ADN satellite, ADN minisatellite, ADN microsatellite).

ADN ribosomique m. (de ribosome, de ribo(se), et du gr. sôma, corps). [Ribosomal DNA] ADN génique dont les gènes répétés en tandem codent les ARNr qui s’associent à des protéines pour former les ribosomes. ENCYCL. : L’ADN ribosomique contient de l’ADN espaceur à l’intérieur (ADN espaceur transcrit interne = ITS) ou entre (ADN espaceur transcrit externe = ETS) les unités de transcription répétées en tandem codant les ARNr. Une unité de transcription ribosomique comprend une ETS, les séquences codantes pour les trois ARN 18 S, 5,8 S et 28 S et deux ITS. L’ADN espaceur, hautement polymorphe contrairement aux régions codant les ARNr, est très utilisé en phylogénie moléculaire. L’ADN ribosomique est porté par des régions chromosomiques spécifiques appelées organisateurs nucléolaires (= NOR, angl. : Nucleolus Organizer Region), qui forment ensemble le nucléole (chez les humains, cinq chromosomes : no 13, 14, 15, 21 et 22). Remarque : L’appellation « ADN ribosomal » est un anglicisme, à éviter.

ADN satellite m. (empr. au lat. satelles, satellitis, garde du corps, auxiliaire). [Satellite DNA] Longue région d’ADN hautement répété en tandem, hétérochromatique, non codant, située surtout dans les centromères, formée de séquences répétées jusqu’à plusieurs milliers de fois. ENCYCL. : Chez les humains, on distingue l’ADN alphoïde (171 pb), l’ADN β de 68 pb, l’ADN satellite 1 (de 25 à 50 pb), et les ADN satellites 2 et 3 (5 pb). On distingue aussi deux types particuliers appelés VNTR (angl. : Variable Number Tandem Repeats) :

– l’ADN minisatellite, présent dans les télomères, contient des séquences de 10 à 100 paires de bases, riches en guanine et cytosine ;

– l’ADN microsatellite, dispersé plus ou moins uniformément dans le génome, est formé de courtes séquences de 1 à 13 paires de bases.

ADN topo-isomérase ou Topo-isomérase n. f. [découverte dans les années 70 chez Escherichia coli par James C. Wang, biochimiste sino-américain né en 1936] [(DNA) topoisomerase] Enzyme qui catalyse la rupture suivie de la reformation de liaison phosphodiester dans un ou deux brins d’ADN, afin de résoudre les problèmes de topologie de l’ADN qui apparaissent dans plusieurs processus cellulaires : lors de la réplication et de la transcription (pour supprimer les contraintes de torsion), lors de la recombinaison, lors de la condensation des chromosomes et pour démêler l’ADN répliqué avant la mitose. ENCYCL. : On distingue deux grands types de topo-isomérases structurellement et fonctionnellement différents :

a. le type I (EC 5.99.1.2), indépendant de l’ATP, catalyse la rupture d’un seul des deux brins de la double hélice d’ADN suivi de la reformation de la liaison. Le brin coupé tourne alors autour du brin intact pour supprimer le stress de torsion positive ou négative.

b. le type II (EC 5.99.1.3), ATP-dépendant, catalyse la rupture des deux brins simultanément de l’hélice d’ADN, le passage d’une autre hélice puis la resoudure des brins, ce qui permet d’augmenter ou de diminuer l’enroulement de l’ADN.

Syn. : Facteur de relaxation, Enzyme de relaxation.

ADNase n. f. [DNase] Syn. : Désoxyribonucléase. Voir cette entrée.

ADNc n. m. [cDNA] Abréviation de ADN complémentaire. Voir cette entrée.

ADNccc n. m. (abrév. de ADN circulaire covalentiellement clos). [cccDNA (= covalently closed circular DNA)] ADN double brin viral obtenu par la ligature d’une forme linéaire en un anneau fermé par une ADN ligase, rencontré chez les Pararétrovirus : Caulimoviridés et les Hépadnaviridés (ex. : virus de l’hépatite B = VHB). Syn. : ADN épisomique, Minichromosome viral.

ADNcp n. m. [cpDNA] Abréviation de ADN chloroplastique. Voir cette entrée.

ADNmt n. m. [mtDNA] Abréviation de ADN mitochondrial. Voir cette entrée.

Adné, e adj. (du lat. ad, près de, et né). [Adnate] Syn. : Adhérent. Voir cette entrée.

ADNr n. m. [rDNA] Abréviation de ADN ribosomique. Voir cette entrée.

ADP n. m. (sigle de Adénosine-5’-DiPhosphate). [ADP] Ribonucléotide essentiel pour le flux énergétique cellulaire, formé par la condensation d’un pentose, le ribose, d’une nucléobase purique, l’adénine, liée au carbone 1’ du ribose, et d’un pyrophosphate lié au carbone 5’ du ribose. ENCYCL. : L’ADP est formé par l’hydrolyse de l’ATP et est rephosphorylé en ATP par plusieurs voies : par la phosphorylation oxydative, par la phosphorylation au niveau du substrat et par la photophosphorylation (voir ces entrées). Il se fixe au glucose pour donner l’ADP-glucose, monomère activé qui se fixera à la chaineO.R. d’amidon en formation. Formule brute : C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂.

ADPG n. m. (sigle). [ADPG] Sigle de Adénosine DiPhosphate-Glucose. Voir ADP-glucose.

ADP-glucose n. m. (sigle de Adenosine-DiPhosphate-glucose). [ADP-glucose] Sigle : ADPG – Glucose activé par la liaison de son carbone 1’ avec le phosphate terminal d’une adénosine diphosphate. ENCYCL. : Ainsi activé, le glucose peut se lier à l’extrémité d’une chaineO.R. d’amidon en formation grâce à l’amidon synthase (EC 2.4.1.21), la rupture de la liaison ADP-glucose fournissant l’énergie nécessaire à cette liaison.

ADPR n. m. (sigle). [ADPR] Sigle de Adénosine DiPhosphoRibose. Voir ADP-ribosylation.

ADP-ribosylation n. f. (sigle de Adénosine DiPhosphate ; de ribose). [ADP-ribosylation] Fixation réversible d’un (= monoADP-ribosylation) ou de plusieurs ADP-riboses (= polyADP-ribosylation) sur une protéine par une ADP-ribosyltransférase, le donneur d’ADP-ribose étant le NAD⁺ par hydrolyse de sa liaison N-glycosidique entre l’ADP-ribose et le nicotinamide. ENCYCL. : C’est une modification post-traductionnelle réversible impliquée dans plusieurs mécanismes cellulaires comme la traduction (sur les facteurs eucaryotiques d’élongation), la réparation mono- ou bicaténaire de l’ADN, l’expression génique (modifications des histones donc de la structure chromatinienne), la dégradation des protéines par le système ubiquitine-protéasome et l’apoptose.

Adragante adj. f. (du lat. tragacantha, du gr. tragos, bouc, et akantha, épine). [Tragacanth] Voir Gomme adragante.

Adrénaline n. f. [isolée en 1895 par Napoleon Cybulski, physiologiste polonais 1854–1919] (empr. à l’angl. adrenalin, du lat. ad, près de, rénal, et suff. -ine). [Adrenalin(e)] Hormone et neurotransmetteur du groupe des catécholamines, synthétisée à partir de la phénylalanine et de la tyrosine par les cellules chromaffines et certains neurones du système nerveux central, libérée rapidement lors des moments de stress, d’urgence pour favoriser les réactions de fuite ou de lutte face à un danger et la lutte contre le froid et la fatigue. ENCYCL. : L’adrénaline produit ses différents effets sympathicomimétiques sur les cellules cibles en se fixant sur au moins cinq récepteurs adrénergiques α₁, α₂, β₁, β₂ et β₃ codés par des gènes différents, les effets variant selon le type de récepteurs. Dans le tégument, l’adrénaline participe aux changements de coloration en concentrant les mélanosomes ce qui éclaircit le tégument. Syn. : Épinéphrine (USA), 4-(1-Hydroxy-2-(méthylamino)éthyl)benzène-1,2-diol (nom IUPAC).

Adrénergique adj. (empr. à l’angl. adrenergic, de adrén(aline), et du gr. ergon, travail). [Adrenergic] ► ① Se dit d’une fibre nerveuse dont le neurotransmetteur est l’adrénaline ou la noradrénaline, fibre postganglionnaire du système nerveux orthosympathique, innervant les muscles lisses, le muscle cardiaque, certaines glandes (pancréas, foie, glandes sudoripares, cellules juxtaglomérulaires) ;

► ② Se dit des récepteurs membranaires de types α et β, couplés aux protéines G, appelés adrénorécepteurs (= AdR), auxquels l’adrénaline, la noradrénaline et leurs agonistes (ex. : agmatine) se lient sur les cellules cibles. On distingue les récepteurs α-adrénergiques α₁ (A, B et D), α₂ (A, B et C) et les récepteurs β-adrénergiques β₁, β₂ et β₃, tous codés par des gènes différents. Voir Adrénaline et Adrénorécepteur.

Adrénodoxine n. f. (mot-valise, de adrén(aline) et (ferré)doxine). [Adrenodoxin] Petite protéine (124 a. a., chr. 11) mobile, à centre 2 Fe–2 S, appartenant au complexe enzymatique qui clive la chaineO.R. latérale de six carbones du cholestérol (à 27 C) pour donner la prégnénolone (à 21 C). ENCYCL. : Ce complexe enzymatique, donc l’adrénodoxine, est fixé à la membrane interne des mitochondries de la plupart des cellules, particulièrement des cellules stéroïdogènes du cortex surrénalien, des cellules granuleuses (ovaires) et des cellules de Leydig (testicules). La prégnénolone formée quittera la mitochondrie et rejoindra le réticulum endoplasmique pour être transformée en progestérone. Syn. : Ferrédoxine 1, Hépatorédoxine.

Adrénolytique adj et n. m. (de adrén(aline) ; de lyse, du gr. lusis, dissolution). [Adrenolytic] Toute substance qui diminue ou supprime l’action de l’adrénaline, qui a donc un effet sympatholytique. Ex. : phentolamine et yohimbine α-bloquantes (antagonistes des récepteurs α), propranolol β-bloquant (antagoniste des récepteurs β).

Adrénorécepteur n. m. (de adrén(aline), et récepteur). [Adrenoreceptor] Récepteur adrénergique, c’est-à-dire sensible à l’adrénaline, à la noradrénaline et à leurs agonistes, couplé aux protéines G. ENCYCL. : On distingue plusieurs récepteurs adrénergiques, codés par des gènes différents : α₁ (A, B et D) couplés à la protéine Gq, α₂ (A, B et C) couplés à la protéine Gi/o, β₁, β₂ et β₃ couplés à la protéine Gs. Voir Adrénorécepteur α et β et Adrénaline.

Adrénorécepteur α n. m. (de adrén(aline), et récepteur). [α-Adrenoreceptor] Récepteur adrénergique couplé à la protéine G. ENCYCL. : On distingue deux sous-types :

– adrénorécepteur α₁ couplé à la protéine Gq qui active la phospholipase C qui clive le phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate (= PIP₂) en diacylglycérol (= DAG) et en inositol-1,4,5-trisphosphate (= IP₃). Ce dernier ouvre les canaux calciques du réticulum endoplasmique ce qui augmente la teneur intracellulaire en calcium à l’origine des effets cellulaires ;

– adrénorécepteur α₂ couplé à la protéine Gi/o qui inhibe l’adénylate cyclase ce qui diminue la teneur intracellulaire en AMPc. La protéine kinase A n’est alors pas activée et ne phosphoryle pas diverses enzymes.

Adrénorécepteur β n. m. (de adrén(aline) et récepteur). [β-Adrenoreceptor] Récepteur adrénergique couplé à la protéine Gs qui active l’adénylate cyclase ce qui augmente la teneur intracellulaire en AMPc. ENCYCL. : La protéine kinase A est activée et phosphoryle diverses enzymes. On distingue trois sous-types : β₁ (477 a. a.), β₂ (413 a. a.) et β₃ (408 a. a.).

Adret n. m. (empr. à l’anc. provençal adreg ou adrech, bon côté). [South-facing slope] Versant d’une montagne qui bénéficie de la plus longue exposition au soleil, donc qui est le plus chaud, le plus sec et le mieux éclairé, l’autre versant étant appelé ubac. ENCYCL. : L’adret est généralement exposé au sud dans l’hémisphère Nord et au nord dans l’hémisphère Sud, et inversement pour l’ubac. La flore et la faune sont généralement très différentes entre les deux versants. Syn. : Soulane (dans les Pyrénées et en Corse). Ant. : Ubac.

ADS n. f. (sigle). [SDA (Specific Dynamic Action of food)] Sigle de Action Dynamique Spécifique des aliments. Voir cette entrée.

Advectif, ive adj. (du lat. ad, près de, et vect(eur)). Potentiel advectif, voir Potentiel primaire de régénération.

Adventice adj. et n. f. (du lat. adventicius, qui vient du dehors). [Adventive] ► ① adj. et n. f. Se dit d’un organisme qui colonise spontanément un milieu inhabituel, à la faveur de conditions temporairement favorables. Imparfaitement adapté à ce nouvel habitat, l’organisme disparaitraO.R. lorsque reviendront des conditions plus difficiles (froid, sècheresseO.R.…) ;

► ② adj. et n. f. (1767). Se dit d’une plante, vivace ou annuelle, poussant dans les cultures agricoles, donc indésirable, appelée aussi mauvaise herbe. ENCYCL. : Ces plantes adventices sont nuisibles car elles entrent en concurrence pour l’espace, l’eau, les nutriments, la lumière, elles déprécient la qualité des récoltes et peuvent constituer des réservoirs d’agents pathogènes et de ravageurs. La science qui les étudie s’appelle la malherbologie. Ex. : muscari à toupet Muscari comosum (F. Liliacées) qui est une adventice des vignobles ;

► ③ n. f. (1751). [Tunica adventitia] Tunique fibreuse externe formée de tissu conjonctif aréolaire, entourant certains organes et les reliant aux tissus adjacents, particulièrement les vaisseaux sanguins, la trachée et l’œsophage. ENCYCL. : L’adventice est irriguée par les vasa vasorum formés de petits vaisseaux et est innervée par les nervi vasorum formés de fibres nerveuses. Dans les organes abdominopelviens, l’adventice est remplacée par une séreuse, qui se différencie de l’adventice par le mésothélium (épithélium simple pavimenteux) qui la recouvre. Ne pas confondre avec Adventif.

Adventif, ive adj. (du lat. adventicius, accidentel, inattendu). [Adventitious] ► ① (1852). Se dit d’un organe qui se développe en une position inhabituelle. Ex. : bourgeons adventifs poussant hors des aisselles foliaires, par exemple sur des racines ou sur des feuilles, racines adventives, aériennes, poussant à partir de la tige (ex. : maïs, philodendron). Ne pas confondre avec Adventice ;

► ② Se dit d’un embryon appelé azygote qui se développe à partir d’une cellule n’appartenant pas au sac embryonnaire, donc à partir de tissus sporophytiques, le nucelle (embryon adventif nucellaire) ou le tégument interne (embryon adventif intratégumentaire). Ce mode de développement est un type d’apomixie. Voir cette entrée.

Adynamandrie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, dunamis, force, et anêr, andros, homme). [Adynamandry] ► ① Incompatibilité du pollen sur un stigmate, particulièrement de la même fleur (autostérilité) ;

► ② Stérilité de l’androcée, des étamines.

Adynamogynie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, dunamis, force, et gunê, femme). [Adynamogyny] Stérilité du gynécée, d’un carpelle.

Aequorine n. f. [découverte en 1961 par Osamu Shimomura, biologiste japonais, P. N. 2008 de chimie, 1928–2018] (du genre Aequorea). [Aequorin] Complexe moléculaire présent naturellement chez les méduses du genre Aequorea (Cnidaires Hydrozoaires), formé d’une apoprotéine (= apoaequorine) de 21 kDA et d’un groupement prosthétique chromophore appelé cœlentérazine responsable de la bioluminescence. ENCYCL. : Lorsque l’aequorine est liée au niveau de son motif main EF à un, deux ou trois ions calcium, et en présence d’oxygène, elle subit un changement conformationnel qui permet l’oxydation et l’activation de la cœlentérazine en cœlentéramide, avec rejet d’une molécule de CO₂. Le complexe ainsi formé est aussi appelé protéine à fluorescence bleue car in vitro, son retour à l’état stable émet une lumière bleue avec un pic à 465 nm.

Aérenchyme n. m. (du gr. aêr, air, et (par)enchyme). [Aerenchyma] Parenchyme cortical ou foliaire dont les cellules ménagent entre elles de vastes lacunes aérifères délimitées par une ou deux assises cellulaires, remplies de gaz (dioxygène le jour, CO₂ la nuit), facilitant la flottaison et les échanges gazeux entre les organes émergés et immergés. ENCYCL. : L’aérenchyme est présent chez les Spermatophytes aquatiques ou hydrophytes (ex. : nénuphars, joncs…), qui, contrairement aux algues, sont primitivement aériennes et seulement secondairement aquatiques, restant ainsi inféodées au dioxygène gazeux et non dissoutO.R.. Syn. : Parenchyme aérifère.

Aéricole adj. (du gr. aêr, air ; du lat. colere, habiter). [Aericolous] Qui vit, pousse sans contact ou presque avec le sol, prenant support par exemple sur des arbres. Ex. : épiphytes, martinets Apus (O. Apodiformes), paresseux Bradypus et Choloepus (O. Piloses).

Aérien, enne adj. (du gr. aêr, air). [Aerial] ► ① Qui vit, pousse, se réalise à l’air libre, par opposition à aquatique et souterrain ;

► ② Relatif à l’air, aux gaz non dissous. Ex. : les animaux souterrains et les Mammifères aquatiques ont une respiration aérienne.

Aérifère adj. (1808, du gr. aêr, air ; du lat. ferre, porter). [Aeriferous] Qui est rempli ou fait circuler l’air, des gaz. Ex. : ballonnets des grains de pollen des pins (F. Pinacées), lacunes aérifères des plantes aquatiques, racines aérifères ou pneumatophores des cyprès chauves Taxodium (F. Taxodiacées).

Aéro-anaérobie adj. et n. m. [Aero-anaerobic (adj.)] Voir Aérobie.

Aérobie adj. et n. m. (du gr. aêr, air, et bios, vie). [Aerobic (adj.), Aerobe (n.)] Se dit d’un organisme qui peut vivre en présence d’oxygène (en aérobiose). ENCYCL. : Le dioxygène, fortement électronégatif, est utilisé comme accepteur final des électrons dans la chaineO.R. respiratoire de transfert des électrons, où il fournit de l’eau selon la réaction : ½ O₂ + 2 H⁺ + 2 e– → H₂O. On distingue, en fonction de leur besoin en oxygène :

– les aérobies stricts ou obligatoires dont le métabolisme nécessite obligatoirement la présence d’oxygène, ces organismes ne pouvant réaliser la fermentation ou la respiration anaérobie ;

– les (an)aérobies facultatifs ou aéro-anaérobies qui peuvent soit utiliser l’oxygène comme accepteur d’électrons soit s’en passer en réalisant la fermentation ou la respiration anoxygénique ;

– les microaérobies ou microaérophiles qui nécessitent de l’oxygène, mais à une teneur inférieure à la teneur atmosphérique (21 %) ;

– les anaérobies aérotolérants qui n’utilisent pas l’oxygène mais peuvent vivre en sa présence ;

– les anaérobies stricts qui ne peuvent vivre en présence d’oxygène.

Ant. : Anaérobie.

Aérobiologie n. f. (du gr. aêr, air, bios, vie, et logos, discours). [Aerobiology] Étude interdisciplinaire des organismes et des particules biologiques en suspension dans l’air (pollen, graines, spores, bactéries, virus), de leurs sources, de leur dispersion et de leurs effets sur la santé (allergies, agents pathogènes) et l’agriculture (phytopathogènes, adventices).

Aérobiose n. f. (du gr. aêr, air, et bios, vie). [Aerobiosis] Condition de vie caractérisée par la présence de dioxygène, qu’il soit gazeux ou dissous. Ant. : Anaérobiose. Voir Aérobie.

Aéroblaste n. m. (du gr. aêr, air, et blastos, germe). [Aeroblast] Partie émergée d’une plante amphibie, portant une fleur ou une inflorescence et des feuilles généralement différentes de celles de la partie immergée (hétérophyllie). Ex. : renouée amphibie Persicaria amphibia (F. Polygonacées), sagittaire Sagittaria sagittifolia (F. Alismatacées).

Aérochorie n. f. (du gr. aêr, air, et khôrein, se déplacer). [Aerochory] Syn. : Anémochorie. Voir cette entrée

Aérocyste n. m. (du gr. aêr, air, et kustis, vessie). [Aerocyst] Chez les algues, vésicule aérifère, remplie de gaz (diazote N₂ et dioxygène O₂), jouant le rôle de flotteurs. Ex. : aérocystes des Fucales (F. Fucacées, Sargassacées…).

Aérogamie n. f. (du gr. aêr, air, et gamos, union). [Aerogamy] Syn. : Anémogamie. Voir cette entrée.

Aérohalin, e adj. (du gr. aêr, air, et hals, halos, sel). [Aerohaline] Se dit d’un milieu, d’une station adlittorale, d’un organisme, lorsqu’il est en contact avec la mer seulement par les embruns. ENCYCL. : Les organismes aérohalins doivent être adaptés à une forte salinité du sol (halophiles) et à une diminution de la disponibilité de l’eau. Syn. : Hygrohalin.

Aérohygrophile adj. (du gr. aêr, air, hugros, humide, et philos, ami). [Aerohygrophilous] Se dit d’un organisme vivant dans un habitat à forte hygrométrie atmosphérique, suffisante pour puiser l’eau dont il a besoin sans dépendre de celle du sol. Ce caractère s’appelle l’aérohygrophilie. Ex. : nombreux lichens, Bryophytes et épiphytes (aérohygrophytes). Ant. : Aérohygrophobe (Aérohygrophobie).

Aérohygrophobe adj. (du gr. aêr, air, hugros, humide, et phobos, crainte). [Aerohygrophobous] Se dit d’un organisme qui ne se développe que dans un milieu à faible hygrométrie atmosphérique. Ce caractère s’appelle l’aérohygrophobie. Ant. : Aérohygrophile (Aérohygrophilie).

Aérohygrophyte n. f. (du gr. aêr, air, hugros, humide, et phuton, plante). [Aerohygrophyte] Plante aérohygrophile. Voir Aérohygrophile.

Aéromorphose n. f. (du gr. aêr, air, et morphê, forme). [Aeromorphosis] ► ① Ensemble des changements morphologiques, anatomiques et/ou physiologiques apparaissant chez une plante amphibie lorsqu’une partie passe du milieu aquatique au milieu aérien. Ex. : sagittaire à feuilles en flèche Sagittaria sagittifolia (F. Alismatacées) ;

► ② Syn. : Anémomorphose. Voir cette entrée.

Aéronien, enne n. m. et adj. [L. R. M. Cocks 1971] (vallée d’Aeron < Pays de Galles). [Aeronian] Notation : s2 – Deuxième étage (ou âge) géologique du Silurien (ère Paléozoïque), dans l’époque Llandovery, de –440,8 à –438,5 Ma (durée : 2,3 Ma), précédé par le Rhuddanien et suivi par le Télychien.

Aérophile adj. (du gr. aêr, air, et philos, ami). [Aerophilous] Qui vit dans un milieu terrestre exposé à des vents forts. ENCYCL. : Ce caractère s’appelle l’aérophilie. Les végétaux aérophiles peuvent présenter des accommodations au vent appelés anémomorphoses.

Aérophique adj. (du gr. aêr, air). Se dit d’un habitat, d’un milieu, d’une strate, d’un horizon de sol où l’air est la composante prépondérante. Ex. : stylagé (strate des troncs d’arbres d’une futaie, des stipes d’une palmeraie).

Aérophyse n. m. (du gr. aêr, air, et phusis, production). [Aerophyse] Volume d’air libre contenu dans un habitat ou dans une de ses parties, par rapport au volume total.

Aérophyte n. f. (du gr. aêr, air, et phuton, plante). [Aerophyte] Syn. : Épiphyte. Voir cette entrée.

Aéroplancton n. m. (du gr. aêr, air, et plagktos, errant). [Aeroplankton] Fraction du plancton qui est véhiculée par le vent.

Aérosome n. m. (du gr. aêr, air, et sôma, corps). [Gas vacuole] Chez certaines Archées, Cyanobactéries et Bactéries vertes sulfureuses, vacuole gazeuse formée par l’accolement de nombreuses vésicules gazeuses cylindriques et rigides, aux extrémités coniques, délimitées par une enveloppe protéique (protéines GvpA stabilisées par GvpC, angl. : Gas vesicle synthesis protein), leur permettant de réaliser des mouvements verticaux dans l’eau afin de se placer à la profondeur optimale afin de capter la lumière, le dioxygène, les nutriments, le sulfure d’hydrogène (donneur d’électrons).

Aérotaxie n. f. (du gr. aêr, air, et taxis, arrangement). [Aerotaxis] Mouvement d’orientation des organismes aquatiques libres, déclenché par la teneur en dioxygène dissous, afin de se déplacer vers la zone où la teneur est optimale.

Aestisylve → Estisylve

Aethalium n. m. (du gr. aethalos, suie). [Aethalium, pl. -lia] Chez les Conosés mycétozoaires (Myxomycètes et Acrasiomycètes), plasmode multinucléé, à noyaux diploïdes, sessile, de taille, de forme et de couleur très variables, qui produit dans certaines conditions du milieu des sporophores libérant des spores haploïdes.

Afférent, e adj. (1814, empr. au lat. afferens, de afferre, apporter). [Afferent] Qui conduit de la périphérie vers le centre d’un organisme, d’un organe. Ex. : nerf afférent (= nerf sensitif). Ant. : Efférent.

Affin, e adj. (du lat. adfinis, allié, parent par alliance). [Affine] ► ① Se dit de deux molécules qui présentent une interaction entre elles. Ex. : une enzyme affine pour son substrat, un anticorps affin pour son antigène spécifique ;

► ② Se dit de formes biologiques présentant une forte ressemblance ou affinité, qui ne s’accompagne pas obligatoirement d’une relation de parenté ;

► ③ Se dit de deux ou plusieurs espèces, qui vivent volontiers en présence les unes des autres et qui constituent ainsi des groupements les réunissant chaque fois que les conditions du milieu le permettent.

Affinité n. f. (du lat. adfinis, allié, parent). [Affinity] Voir Affin.

Aflatoxine n. f. [découverte en 1960] (de A(spergillus) fla(vus), et toxine, du gr. toxikon, poison). [Aflatoxin] Groupe d’une vingtaine de mycotoxines, pentacycliques et méthoxylées, sécrétées par diverses espèces du genre Aspergillus (Ascomycètes > Eurotiales) en condition chaude et humide. ENCYCL. : C’est l’un des plus puissants cancérigènes naturels, qui endommagent directement les bases et empêchent ainsi la réplication de l’ADN, ou s’intercalent entre les bases et décalent le cadre de lecture. Ex. : aflatoxines B1 et B2 (fluorescence dans le bleu, angl. : Blue), G1 et G2 (par Aspergillus parasiticus, fluorescence dans le vert, angl. : Green), M1 et M2 (Métabolites respectivement de B1 et B2).

AFP ou α-FP n. f. (sigle). [AFP] Sigle de Alpha-FœtoProtéine. Voir cette entrée.

Afro-alpin, e adj. (du lat. afer, afri, africain, et alpinus, des Alpes). [Afroalpine] Se dit de l’étage alpin des hautes montagnes africaines et des espèces qui y vivent, entre 2 700 m et 4 400 m d’altitude (étage alpin entre 2 100 et 3 200 m dans les Alpes centrales).

Afro-montagnard, e adj. (du lat. afer, afri, africain ; de montagne). [Afromontane] Se dit de l’étage montagnard des montagnes africaines et des espèces qui y vivent, entre 1 500 et 2 000 m d’altitude (étage montagnard entre 800 et 1 800 m dans les Alpes centrales).

Afrosoricides (Afrosoricida) n. m. pl. [Stanhope 1998] (du lat. afer, afri, africain, et sorex, soricis, souris). [Afrosoricids] Petit clade de Mammifères Afro-insectiphiles (Euthériens > Épithériens > Afrothériens), constituant le groupe frère des Macroscélides, et regroupant les potamogales, les taupes dorées et les tenrecs. ENCYCL. : Ils vivent en Afrique subsaharienne et à Madagascar, dans les forêts, les savanes, les steppes et dans les régions marécageuses. Toutes les espèces sont terricoles mais certaines peuvent aussi grimper aux arbres ou nager dans les rivières. Ils sont omnivores, diurnes ou nocturnes. 54 espèces sont connues, réparties en 2 sous-ordres : les Chrysochlorides (taupes dorées) et les Tenrécomorphes (tenrecs).

Afro-subalpin, e adj. (du lat. afer, afri, africain, sub, sous, et alpinus, des Alpes). [Afrosubalpine] Se dit de l’étage subalpin des montagnes africaines et des espèces qui y vivent, entre 1 800 et 3 000 m d’altitude (étage subalpin entre 1 400 et 2 500 m dans les Alpes centrales).

Afrothériens (Afrotheria) n. m. pl. [Stanhope et al. 1998] (du lat. afer, afri, africain, et du gr. thêrion, bête sauvage). [Afrotherians] Petit clade (rang : magnordre) de Mammifères Euthériens, constituant le groupe frère des Boréoeuthériens dans le clade des Épithériens, regroupant les Mammifères placentaires d’origine africaine. ENCYCL. : Ils vivent en Afrique et à Madagascar, au Proche-Orient, en Asie du Sud-Est, au nord de l’Australie, en Nouvelle-Guinée et en Nouvelle-Calédonie. 85 espèces sont connues, réparties en 2 clades : les Afro-insectiphiles (71 esp.) et Pénongulés (14 esp.). Voir ces entrées.

Ag n. m. [Ag] Abréviation de Antigène. Voir cette entrée.

AG n. m. (sigle de Arginine-Guanine). [AG] ► ① Chez les Eucaryotes, doublet nucléotidique arginine-guanine fortement conservé qui marque l’extrémité 3’ des introns des préARNm et qui constitue le site accepteur d’épissage dans la séquence consensus 5’N-C-A-G-[épissage]-G3’ (où N = n’importe quelle base), distante de 20 à 50 bases de l’adénosine du point de branchement (site de fermeture du lasso). Le doublet nucléotidique de l’extrémité 5’ des introns est GU ;

► ② Sigle de Appareil de Golgi. Voir cette entrée.

Agame adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et gamos, union). [Agamic] Se dit d’un être vivant qui est dépourvu de gamètes et d’appareil reproducteur fonctionnel et qui se reproduit donc uniquement par multiplication végétative (par des bulbes, tubercules, rhizomes, stolons, rejets, propagules, hormogonies ; par bourgeonnement, schizogonie, scissiparité, strobilation…). Ce caractère s’appelle l’agamie.

Agamète n. m. (du gr. a-, préfixe privatif, et gametês, époux). [Agamete] Cellule reproductrice asexuée. Ex. : cellules nucellaires à l’origine d’embryons adventifs, antipodes ou synergides du sac embryonnaire (cas d’apogamie). Ant. : Gamète.

Agamie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, et gamos, union). [Agamy] Caractère des organismes agames. Syn. : Multiplication végétative. Voir Agame et Multiplication végétative.

Agamogonie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, gamos, union, et gonos, génération). [Agamogony] Reproduction asexuée des protozaires, par division binaire transversale ou longitudinale, par schizogonie ou par bourgeonnement.

Agamospermie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, gamos, union, et sperma, semence). [Agamospermy] Mode de reproduction végétale apomictique où les graines sont formées mais contiennent un ou plusieurs embryons viables formés sans fécondation. ENCYCL. : Trois types d’agamospermie peuvent être différenciés en fonction de la cellule qui est à l’origine de l’embryon. L’embryon est formé :

– soit par parthénogenèse, c’est-à-dire à partir d’une oosphère non fécondée haploïde ou diploïde (ex. : Alchemilla) ;

– soit par apogamie, c’est-à-dire à partir d’une cellule (agamète : antipodes, synergides) du sac embryonnaire qui n’est pas l’oosphère et qui n’est pas fécondée ;

– soit par développement adventif, c’est-à-dire à partir de cellules sporophytiques nucellaires ou intratégumentaires de l’ovule (ex. : Citrus).

Agamotrope adj. (du gr. a-, préfixe privatif, gamos, union, et tropos, direction). [Agamotropic] Se dit d’une fleur demeurant toujours ouverte après l’anthèse (épanouissement), sans présenter de nasties nycthémérales (mouvements journaliers d’ouverture-fermeture). Remarque : Le terme agamotropique est un anglicisme à éviter.

Agar-agar n. m. [découvert en 1658 par Mino Tarōzaemon, aubergiste japonais] (1865, empr. au malais). [Agar-agar] Mélange polyosidique des parois squelettiques de diverses Rhodophytes appelées agarophytes (Gélidiales, Gigartinales, Gracilariales…). ENCYCL. : Il est utilisé en laboratoire pour la solidification des milieux de culture et dans les gels d’électrophorèse, et en cuisine (gélose). Il se dissout dans l’eau chaude et se solidifie en gel épais en se refroidissant. L’agar-agar est composé de deux types de polyosides linéaires :

– l’agarose, polymère d’un dioside appelé agarobiose : D-galactose lié à un 3,6-anhydro-L-galactopyranose ;

– l’agaropectine, polymère de D-galactose, L-galactose, pyruvylgalactose et galactose sulfate.

C’est un additif alimentaire (E406), insipide et incolore, acalorique, utilisé comme gélifiant et épaississant, permettant de remplacer la gélatine animale. Formule brute : (C₁₂H₁₈O₉)n. Syn. : Gélose, Agar.

Agaropectine n. f. (de agar, et pectine, du gr. pêktos, figé). [Agaropectin] Voir Agar-agar.

Agarose n. m. (de agar et ose). [Agarose] Voir Agar-agar.

AGE n. m. (sigle). [EFA (= Essential Fatty Acid)] Sigle de Acide Gras Essentiel. Voir Acide gras.

Agénésie n. f. (du gr. a-, préfixe privatif, et genesis, formation). [Agenesis] ► ① Croisement entre deux espèces différentes mais proches, donnant des hybrides stériles, notamment à cause des problèmes d’appariement des chromosomes lors de la méiose. Syn. : Hybridité agénésique ;

► ② Absence ou arrêt de développement d’un organe lors de l’embryogenèse.

Agglutinant, e adj. (de agglutiner, du lat. gluten, glutinis, colle). [Agglutinated] Se dit du test de certains Foraminifères, formé de particules exogènes agglomérées par un ciment calcaire, siliceux, chitineux ou mixte.

Agglutination n. f. [découverte en 1896 par Herbert Edward Durham, médecin anglais 1866-1945, et Max von Gruber, scientifique autrichien 1853–1927] (de agglutiner, du lat. adglutinare, coller). [Agglutination] Agrégation en amas de cellules bactériennes, d’hématies ou de virus, due à la liaison d’un agglutinogène fixé à la surface de chaque élément agglutiné à une agglutinine sérique spécifique. Syn. : Réaction de Gruber-Durham.

Agglutinine n. f. (1903, de agglutin(er), et suff. -ine). [Agglutinin] ► ① Anticorps qui provoque l’agglutination d’antigènes spécifiques en se liant à eux par leurs sites de liaison aux antigènes ou paratopes ;

► ② Toute substance qui provoque une agglutination de cellules, de molécules ou de particules en un amas. Ex. : lectines.

Agglutinogène n. m. (1945, de agglutin(er), et du gr. genos, origine). [Agglutinogen] Molécule antigénique de la surface des hématies et des Bactéries qui provoque leur agglutination en présence de l’agglutinine correspondante.

AGL n. m. (sigle). [FFA (= Free Fatty Acid] Sigle de Acide Gras Libre. Voir cette entrée.

Aglycone n. m. ou f. (du gr. a-, préfixe privatif, et glukus, doux). [Aglycon] Partie non osidique d’un hétéroside, combinée au groupe réducteur d’un ose (= glycone) par un hydroxyle alcoolique ou phénolique (O-hétérosides, ex. : amygdaline), par une amine (N-hétérosides, ex. : nucléosides), par un thiol (S-hétérosides, ex. : glucosinolate) ou par un carbone (C-hétérosides, ex. : aloïne, nothofagine). Syn. : Génine. Voir Hétéroside.

Aglyphe adj. (du gr. a-, préfixe privatif, et gluphê, sillon). [Aglyphous] Se dit d’un serpent (O. Squamates) peu ou non venimeux ne présentant pas de crochet à venin. Ex. : couleuvre à collier Natrix natrix (F. Natricidés), couleuvre vipérine Natrix maura (F. Natricidés). Ant. : Glyptodonte.

Agnathe adj. et n. m. [prononcer le g] (du gr. a-, préfixe privatif, et gnathos, mâchoire). [Agnathan] ► ① Se dit d’un animal qui ne possède pas de mâchoires ;

► ② n. m. pl. [Cope 1889] [Agnathans] Groupe paraphylétique de Vertébrés aquatiques pisciformes, dépourvus de mâchoires et qui ne peuvent donc modifier leur ouverture buccale. ENCYCL. : Il regroupe des groupes actuels, les Myxinoïdes (myxines et fossiles) et les Pétromyzontides (lamproies et fossiles), et le groupe éteint des Ostracodermes. Tous les fossiles ont été trouvés dans des sédiments lacustres, les premiers datant de l’Ordovicien, aucun n’ayant été trouvé à partir du Mésozoïque.

Agnation n. f. [prononcer le g] (du lat. agnatio, de agnatus, né à côté). [Agnation] Parenté entre individus qui ont le même père mais pas la même mère. De tels individus sont dits agnats. Ant. : Cognation (et cognat).

Agnostérol n. m. [prononcer anio…] (du lat. agnus, agneau, et stérol). [Agnosterol] Zoostérol triterpénique (à 30 C) présent dans le suint (graisse de la laine).

Agochorie n. f. (du lat. ago, je conduis, et khôrein, se déplacer). [Agochory] Mode de dispersion des diaspores végétales et fongiques par transport humain involontaire, notamment le long des routes et des voies ferrées (= plantes alétophiles : onagre bisannuelle Oenothera biennis (F. Onagracées), molènes Verbascum (F. Scrophulariacées)) et le long des voies fluviatiles ou maritimes pour les plantes aquatiques (Caulerpa taxifolia (F. Caulerpacées), élodée du Canada Elodea canadensis (F. Hydrocharitacées)).

Agoniste n. m. et adj. (du lat. agonista, qui combat dans les jeux). [Agonist (n.), Agonistic (adj.)] ► ① Molécule qui se lie spécifiquement à un récepteur cellulaire et qui déclenche les mêmes effets que le ligand naturel. Ant. : Antagoniste. ENCYCL. :

– Un agoniste partiel se lie et active le récepteur mais déclenche un effet moindre, partiel par rapport à un agoniste complet.

– Un superagoniste déclenche une réponse supérieure au ligand naturel ;

► ② Muscle agoniste [Agonist muscle] Muscle qui participe à la réalisation d’un mouvement. Syn. : Muscle congénère. Ant. : Muscle antagoniste.

Agonistique adj. [inventé en 1951 par Scott, et Fredericson] (de agoniste, du lat. agonista, qui combat dans les jeux). [Agonistic] Se dit d’un comportement permettant de s’approprier une ressource comme un territoire ou de la nourriture, ou d’établir une hiérarchie de dominance dans un groupe social, en évitant un combat qui serait couteuxO.R. en énergie, en temps et en blessures pour les deux adversaires. ENCYCL. : Le comportement agonistique regroupe trois types d’actions :

– un affichage de la force physique, de la taille, de la volonté de gagner ;

– des postures d’hostilité, de menace sans contact avec l’adversaire, associées au hérissement des poils ou des plumes, à l’affichage des dents, à des cris ;

– des postures de soumission (queue abaissée, retournement sur le dos).

Agranulocyte n. m. (du gr. a, préfixe privatif ; de granule, et du gr. kutos, cavité, cellule). [Agranulocyte] Tout leucocyte dépourvu de granulations cytoplasmiques, c’est-à-dire les lymphocytes et les monocytes/macrophages. Ant. : Granulocyte.

Agrécan n. m. (de agré(ger), et suff. -can). [Aggrecan] Protéoglycane majeur du cartilage, particulièrement articulaire, qui se lie par dizaines de façon non covalente à une longue molécule de hyaluronane, ce qui forme de très grands complexes macromoléculaires appelés agrégats qui confèrent au cartilage ses propriétés de gel et sa résistance à la déformation. ENCYCL. : Chaque agrécan est formé d’une longue protéine centrale qui se lie avec une grande affinité par son extrémité N-terminale à un décasaccarideO.R. du hyaluronane. Sur la protéine, une centaine de molécules de kératane sulfate et de chondroïtine sulfate sont liées parallèlement les unes autres autres, à la manière des barbes d’une plume.

Agrégé, e adj. (de agréger). [Aggregate] ► ① Se dit des micro-espèces le plus souvent apomictiques, c’est-à-dire issu d’embryons formés sans fécondation, dont les différences (liées à des mutations somatiques) entre elles sont plus faibles que les différences qui existent entre les espèces d’un genre donné. Ex. : ronce Rubus fruticosus (F. Rosacées), pissenlits Taraxacum (F. Astéracées) ;

► ② Se dit des plantes qui se rassemblent en groupes très denses.

Agressif, ive adj. (de agresser). [Aggressive] Voir Mimétisme agressif.

Agrétope n. m. (de l’angl. Ag (pour antigen) re(cognition) ; du gr. topos, lieu). [Agretope] Segment d’un peptide antigénique, exogène ou endogène, qui est lié aux molécules du CMH de classe I ou II, ce qui permet sa reconnaissance par les récepteurs TCR des lymphocytes T8 et T4.

Agrine n. f. (de agr(éger), et suff. -ine). [Agrin] Protéoglycane (2038 a. a.) des neurones moteurs et des cellules musculaires, impliqué dans le développement, la stabilisation et la plasticité des synapses interneuronales et des jonctions neuromusculaires.

Agrippement n. m. (de agripper, de gripper, du francique gripan, accrocher). Réflexe d’agrippement [Grasp(ing) reflex] Réflexe primitif inné de fermeture des doigts sous l’effet d’une stimulation cutanée de la paume, présent dès la naissance chez les petits des Primates, en particulier des humains, jusqu’à l’âge de quelques mois. Syn. : Réflexe de préhension.

Agrobacterium n. m. [Conn 1942] [découvert en 1897 par Fridiano Cavara, botaniste italien 1857–1929] (du gr. agros, champ, et baktêrion, bâton). [Agrobacterium] Genre de bacilles (Protéobactéries α > O. Rhizobiales > F. Rhizobiacées) à Gram négatif, aérobies stricts, communs dans le sol, pour la plupart phytopathogènes en induisant des tumeurs chez les végétaux par transfert horizontal de gènes. ENCYCL. : Cette capacité de transgenèse est utilisée dans le génie génétique végétal où les plasmides Ti ou Ri rendus non tumorisants servent de vecteurs naturels de séquences d’ADN ayant un intérêt agronomique. Ex. : Agrobacterium tumefaciens responsable de la galle du collet par le plasmide Ti ; Agrobacterium rhizogenes induit la maladie du chevelu racinaire par le plasmide Ri ; Agrobacterium vitis induit la maladie du broussin de la vigne par le plasmide Ti.

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