Couverture : Lionel Rousseau - Amphora

Suivi éditorial et relecture : Delphine Dubois - Amphora
Illustrations : Jeff-r.fr
Illustrations exercices et photo couverture : ©AdobeStock

Édition des versions numériques : IS Edition, via son label Libres d'écrire

©Éditions Amphora - Juin 2020

ISBN 978 275 760 273 7

Nous sommes heureux de reverser 15% des revenus de cet ouvrage au Fonds d’action du CHU de Reims.

Le fonds d’action a pour objet de recevoir et de gérer les dons qui lui sont apportés en vue de les redistribuer au CHU de Reims et assure une triple mission de soins, de formation et de recherche au service de l’ensemble du territoire de Champagne-Ardenne et au-delà.

Le fonds d’action soutient les projets qui s’articulent autour de quatre domaines d’action :

l’innovation médicale et l’acquisition d’équipements médicaux,

la promotion de la recherche médicale,

l’amélioration des conditions d’accueil et des espaces de vie,

les actions culturelles au profit du patient.

Les valeurs du fonds d’action :

Excellence : promouvoir les techniques médicales de demain qui assureront une prise en charge performante du patient.

Proximité : proposer des projets locaux qui répondent aux besoins de nos concitoyens.

Partage : s’engager pour des projets concrets porteurs des valeurs de l’hôpital et du service public.

PREFACES

La crise sanitaire que traverse notre société est sans précédent dans la mémoire collective. Nous faisons face à un véritable risque majeur, c’est-à-dire la possibilité de voir surgir un événement d’origine naturelle ou anthropique, dont les effets peuvent mettre en jeu un grand nombre de personnes, occasionner des dommages importants et dépasser les capacités de réaction de la société. Ce risque nous pousse aujourd’hui à sortir de la normalité. Il oblige les dirigeants de nos pays à prendre des mesures exceptionnelles qui visent à protéger les populations, la santé de nos concitoyens, celle de nos proches.

Ce sont les mesures de confinement imposées à tous les Français, les fermetures des écoles et des crèches, celles de tous les établissements recevant du public à l’exception des indispensables à la vie de la nation. C’est aussi l’application rigoureuse des gestes dits « barrières », la distanciation sociale, l’interdiction de tout rassemblement, même familial, jusqu’à l’imposition de dispositions insoutenables dans le deuil de nos proches. A l’image d’un bain d’eau glacé qui stimule et renforce notre système immunitaire, la société s’auto-défend aujourd’hui avec des mesures restrictives, un ralentissement global de son activité, pour sa propre survie.

Devant l’inédit, face à l’inconnu, les mesures se révèlent toujours adaptatives, la confiance peut être remise en cause, et nous faisons véritablement face à un enjeu de cohésion et d’unité de la nation. Face à une telle crise, nous apprenons en marchant, et il est essentiel que la réaction soit commune, acceptée et partagée par chacune et chacun d’entre nous, pour comprendre et avancer.

En tant que maire, être confronté à ce risque inédit et invisible est une épreuve à laquelle nous ne sommes pas préparés. Il est pourtant essentiel d’encourager ses concitoyens dans cette prise de conscience et de pouvoir faire face ensemble. Il est aussi positif de constater à quel point la société est capable de réagir et de prendre ses responsabilités devant l’urgence et le danger.

A l’image de ce livre qui offre à tous la possibilité de comprendre les causes et les conséquences de la crise qui nous touche, de transmettre les bons réflexes et les bons comportements à adopter pour se défendre, que cela soit en matière d’alimentation ou d’activité physique, il contribue aussi à faire adhérer les individus que nous sommes à l’effort collectif.

Arnaud Robinet
Maire de Reims

Parler de virus, en cette période anxiogène, peut s’avérer être un exercice délicat.

Il est en effet question de transmission de maladie contagieuse d’une personne infectée, qui peut ignorer son état, à une personne saine.

L’étymologie latine du mot épidémie, epidemia (à la maison), la circonscrit à une zone limitée (région, pays), celle grecque de la pandémie (pan- tout ; demos- peuple) désigne une épidémie à plusieurs foyers ; le mal n’est plus limité, il s’étend partout de manière exponentielle.

Son impact et sa gravité en font une épidémie XXXL, à grande vitesse qui plus est, avec des conséquences économiques, sociales et sanitaires sans pareil.

La pandémie actuelle « que nos enfants et petits-enfants raconteront plus tard, s’ajoutera à la longue liste des pandémies les plus mortelles de l’histoire :

La peste noire de 1347 à 1352 a fait 25 millions de victimes en Europe et autant dans le monde.

La grippe espagnole en 1919 qui fit 50 millions de morts.

Le choléra entre 1817 et 1923 qui a durement frappé le monde.

Le sida qui depuis le début des années 1980 a fait 32 millions de morts à travers le monde.

Sans oublier la variole, et la grippe qui sévit sur un mode épidémique saisonnier essentiellement automno-hivernal.

Son ampleur exceptionnelle marquera assurément l’histoire de l’humanité.

Gageons qu’elle accélère l’insatiable recherche du vaccin salvateur qui permettra de retrouver la sérénité d’une vie paisible que nous apprécierons alors à sa juste valeur.

L’ouvrage de Bénédicte Le Panse est d’une brûlante actualité. Il enrichit le débat dans une matière dont la complexité tient à son évolutivité constante. Il n’a pas la prétention d’épuiser le sujet, si tant est que cela soit possible, mais de dégager des pistes de réflexion qui mettent en perspective les champs du possible. En cela, il est une contribution essentielle.

Le praticien que je suis, à sa modeste échelle, continue chaque année le combat, consistant à conseiller et proposer le vaccin antigrippal afin de contenir les conséquences humaines d’un mal dont nous disposons du remède, mais qui fait encore trop de victimes.

Mes remerciements à l’auteure qui m’a fait l’honneur et l’amitié de me réserver la redoutable tâche de préfacier, grâce à laquelle j’ai pu apprécier la rigueur et la haute tenue intellectuelle de son ouvrage.

Dr Faker LEMKECHER

Coronavirus : vers un nouveau monde ?

En pleine pandémie du coronavirus, la proposition de mon amie d’enfance, brillante sportive de haut niveau, Bénédicte, de participer à un ouvrage traitant des virus en général et des solutions pour s’en prémunir, m’a semblé non seulement très excitante, mais aussi indispensable, afin de rafraîchir voire renforcer mes connaissances un peu obsolètes, datant de mes études de Médecine, sur le sujet. Il était important, à travers ce livre, de proposer au grand public des bases saines de connaissances sur les origines et les principes de base de la virologie, en traitant les fondamentaux sur les épidémies, et comment s’en prémunir, au naturel (sans bien sûr chercher à se supplanter à un traitement médical lorsqu’il est nécessaire), par une alimentation saine et adaptée et un mode de vie en accord avec notre environnement. Il était évidemment crucial aussi de rappeler les gestes de base à connaître (le lavage régulier des mains par exemple) qui permettent le plus souvent d’éviter de contracter ces nombreuses maladies virales épidémiques, pour ne pas avoir à bénéficier d’un traitement médical efficace.

Il est vrai que le contexte d’une épidémie, voire d’une pandémie, est un phénomène pour beaucoup d’entre nous totalement inédit, bien que l’histoire, depuis des siècles, a été largement marquée en profondeur par de nombreuses pandémies ravageant le monde comme la grande peste noire du milieu du XIVe siècle, ou la grippe espagnole de 1918.

Dans le contexte actuel, il m’est difficile de ne pas penser au fameux roman de Stephen King, « Le Fléau », publié initialement en 1978 puis nouvellement édité avec révision en 1990, à travers lequel l’auteur dépeint un monde dystopique où une pandémie de grippe créée en laboratoire se répand à travers les USA, faisant disparaître 99% de la population.

Voilà déjà près d’un an, qu’un peu par hasard, je m’intéressais au phénomène un peu sulfureux de la collapsologie. Mais attention, lorsque l’on glisse son doigt dans l’engrenage collapsologique voire survivaliste, celui-ci nous attire inexorablement, sans recul possible, vers un gouffre vertigineux d’informations et de connaissances qui malheureusement finit toujours vers un scénario catastrophiste de fin du monde.

Tout débute en 1968, où l’on voit se créer un groupe international de chercheurs, experts, grands industriels, dont le but est l’étude de l’évolution du monde pris dans sa globalité pour tenter de cerner les limites de la croissance : Le Club de Rome.

C’est en 1972 que paraît le fameux « rapport Meadows », écrit par une équipe de chercheurs du MIT (Massachussetts Institute of Technology), constitué pour l’occasion à la demande des membres du Club de Rome. Ces chercheurs du MIT ont créé une modélisation du monde, en incluant de nombreuses variables interdépendantes telles que la population globale, la superficie cultivable, les ressources naturelles, la production industrielle, la pollution, etc.

Sa conclusion est sans appel : la croissance matérielle perpétuelle ne peut conduire qu’à un effondrement. L’effondrement n’est pas la fin de l’humanité, mais la diminution brutale de la population, liée à la dégradation des conditions de vie. Yves Cochet, ancien ministre de l’environnement et président de l’Institut Momentum, propose la définition suivante :

« L’effondrement est le processus à l’issue duquel les besoins de base (eau, alimentation, logement, habillement, énergie, etc.) ne sont plus fournis (à un coût raisonnable) à une majorité de la population par des services encadrés par la loi. »

L’écrivain américain Jared Diamond (cité par notre premier ministre Edouard Philippe) a publié en 2005 un essai, « Effondrement : Comment les sociétés décident de leur disparition ou de leur survie (Collapse : How Societies Choose to Fail or Survive) ».

Il y décrit comment et pourquoi certaines sociétés du passé se sont effondrées, comme les Mayas, les habitants de l’Île de Pâques, les Vikings. On y retrouve surtout des facteurs comme la surpopulation, la diminution des ressources et la dégradation environnementale.

Même si les « prophètes de malheur » ont toujours existé, de nombreuses études scientifiques, depuis 50 ans, convergent toutes à plus ou moins long terme vers cette théorie de l’effondrement, et c’est finalement une issue relativement instinctive.

La croissance « infinie » (population, production, consommation, marchés boursiers …) et un monde « fini » (ressources naturelles et surface habitable) sont évidemment incompatibles.

Comme l’évoque Jean-Marc Jancovici, ingénieur et conférencier français, spécialiste de l’énergie et du climat, en 1900 il y avait environ un milliard d’individus sur cette planète, et la terre faisait 13000 km de diamètre, la population a doublé en 1940, et quadruplé en 1970, puis s’est multipliée par 8 en 2020, et la terre fait toujours 13000 km de diamètre.

Je pense souvent aux boîtes rondes, dites « de Petri », vases clos dans lesquels on met en culture les micro-organismes telles les bactéries. Celles-ci, sur leur milieu de culture riche en ressources, se multiplient, de plus en plus, mais quand les ressources sont toutes consommées, elles disparaissent totalement. La terre est-elle notre boîte de Petri ?

A plus grand échelle, on évoque souvent la triste histoire des rennes de l’île Saint-Matthieu, une terre de 357 km² située quelque part à l’ouest des côtes de l’Alaska. En 1944, dix-neuf garde-côtes américains y débarquent avec vingt-neuf rennes comme garde-manger, ils quittent l’île quand les alliés gagnent la guerre, sans avoir eu besoin de tuer un seul renne. Ceux-ci se retrouvent seuls, paisibles, vivant de lichen (leur plat préféré) et d’eau fraîche.

En 1957, David Klein, un biologiste, va étudier cette population de rennes, il dénombre 1350 individus. En 1963, il y en a 6000, en pleine santé. David Klein ne repassera sur l’île que trois ans plus tard, il ne comptera plus que quarante-deux rennes : quarante et une femelles, et un mâle stérile.

En 2018, le GIEC (groupe intergouvernemental d’experts sur l’évolution du climat), dont un des membres est Pablo Servigne, auteur de nombreux ouvrages à succès sur l’effondrement, tire le signal d’alarme à propos des conséquences du changement climatique et sur l’accélération du réchauffement lié à l’industrialisation et à la surproduction de CO2, et des conséquences néfastes sur la population. Pablo Servigne ira jusqu’à annoncer en 2019 un effondrement imminent, probablement pour 2020.

Voilà maintenant quelques années que l’on parle de septième extinction de masse, à l’échelle planétaire. Les biologistes et autres experts nous alarment sur le fait qu’en quarante ans, 50% des animaux ont disparu. On impute sans grand mystère ces disparitions à la perte et à la dégradation de l’habitat des animaux, au recul de leur territoire, sous l’effet de l’expansion mercantile de l’agriculture, de l’exploitation forestière, de l’urbanisation et de l’extraction minière. L’industrialisation, surexploitant l’espace vivable, entraîne une sur-pollution, le réchauffement climatique, la disparition des espèces et l’avènement des maladies.

Pour exemple, Milan et Turin sont parmi les dix villes les plus polluées d’Europe, et l’on y constate malheureusement l’hécatombe liée à l’épidémie de covid-19.

En effet, il est bien démontré que la raréfaction de l’habitat naturel des animaux les force à plus de promiscuité, on comprend mieux comment un virus peut être issu du pangolin (l’animal le plus braconné au monde !) et de la chauve-souris. On retrouve volontiers ces espèces dans les tristement fameux wet market, marchés à ciel ouvert, en Chine, où toutes sortes d’animaux sont entassés, dépecés et vendus, le tout dans une hygiène plus que douteuse (pour y avoir été). Ces wet market, qui sont à l’origine de la majorité des grandes épidémies depuis vingt ans (SRAS en 2003).

Que faire ?

Pour cette pandémie du SARS COVID19, les Coréens du sud nous ont bien démontré que l’urgence consiste d’abord à dépister massivement, à confiner les personnes fragiles, à isoler et à traiter les personnes contaminées.

Et une chose est sûre, c’est que face à un tel ennemi, tous les laboratoires de recherche du monde travaillent de concert nuit et jour, oubliant leurs rivalités, et étudiant ce virus, pour rapidement sans nul doute découvrir un traitement et/ou un vaccin, pour enfin éradiquer ce fléau, comme a été éradiquée la variole en 1980.

Quel hasard, on constate que lors des quinze premiers jours de confinement (mesure un peu moyenâgeuse mais mécaniquement efficace), l’eau des canaux de Venise s’est éclaircie…

On peut espérer qu’à l’issue (que l’on espère heureuse) de cette pandémie tragique, certaines « bonnes » décisions seront prises, pour le bien de l’humanité.

En attendant, prenez soin de vous !

Pierre-Etienne Benkö
Chirurgien Orthopédiste

DANS VIRUS…
IL Y A SURVI(E)…

INTRODUCTION

Début d’une nouvelle ère… Les écoles sont fermées, les cafés, les restaurants, les bars sont rideaux baissés. Sans serrer une poignée de main, sans embrasser nos amis. Sans aller rendre visite à nos parents, nos grands-parents, tout simplement notre famille. Les sorties entre copains sont annulées, les repas de famille n’existent plus. Cinéma, concert, théâtre, discothèque… Les activités sociales sont à l’arrêt. Sans se dépenser dans une salle de sport, le corps ne sait plus…

Il faut combattre ce virus…

La mesure est totalement inédite dans l’histoire de France. Jamais le pays n’avait en effet demandé à ses citoyens de se confiner à leur domicile à longueur de journée, comme c’est le cas depuis le mardi 17 mars 2020 à midi.

Les Français doivent rester à leur domicile et limiter leurs déplacements aux trajets nécessaires. Une sorte de mise sous cloche du pays qui a pour but d’éviter les contacts et, donc, la transmission du Covid-19.

Il existe plusieurs types de virus… Comment combattre les virus ? Est-il d’ailleurs possible de les combattre ?

Devons-nous et pouvons-nous renforcer notre système immunitaire ? L’alimentation peut-elle booster nos anticorps ? Faut-il faire une activité physique pour éviter les infections ?

Pour que notre système immunitaire fonctionne le mieux possible, c’est tout un mode de vie qui doit être équilibré.

Quelques grandes règles sont à respecter : adopter une alimentation équilibrée, éviter les carences en vitamines et en nutriments, mais attention, il est inutile, voire dangereux, de prendre des compléments vitaminiques si nous ne sommes pas en carence ! Avoir un sommeil réparateur, éviter les situations stressantes, éviter de fumer et de boire trop d’alcool, se faire vacciner si cela est possible et se laver les mains régulièrement.

Activité physique et alimentation équilibrée jouent un rôle essentiel sur notre santé. Elles diminuent le risque de développer certaines maladies chroniques et augmentent par conséquent l’espérance de vie. En effet, les aliments apportent l’énergie nécessaire au bon fonctionnement de nos cellules et permettent le développement harmonieux de notre corps. Ce sont les protéines, les glucides et les lipides qui vont être nos principales sources énergétiques. Les fibres, les minéraux et les vitamines ont toute leur place dans notre organisme car ils contribuent également au bon fonctionnement de nos cellules. C’est pourquoi il est essentiel de surveiller ce que nous mangeons tant en termes de qualité que de quantité. Une alimentation saine, équilibrée en fonction de nos besoins, est primordiale. Une alimentation équilibrée, c’est éviter aussi tous les plats transformés, reconstitués, et privilégier les aliments de nos petits producteurs !

Manger équilibré et sainement permet d‘équilibrer notre poids mais surtout d’éviter l’apparition de pathologies chroniques. Ces pathologies augmentent les risques d’être atteint de certaines infections :

les maladies cardiovasculaires ;

le diabète de type 2, le surpoids, l’obésité ;

l’hypertension artérielle ;

certains cancers ;

l’ostéoporose ;

l’asthme ;

les troubles pulmonaires.

Ainsi l’alimentation peut venir soutenir le système immunitaire afin de lui donner quelques armes nécessaires contre bactéries et virus. La revue de littérature est pauvre à ce niveau, mais rien n’empêche de favoriser les aliments riches en antioxydants permettant de lutter contre les infections. Manger gourmand mais utile, bouger un minimum de trente minutes par jour et dormir au moins sept heures afin de régénérer notre organisme.

Retenez aussi que les meilleures protections sont des mesures d’hygiène, et les « gestes barrières » face à une pandémie sont à adopter pour bien se protéger.

1

HISTOIRE DE
LA VIROLOGIE

1.1 Naissance de la virologie

Bien qu’en 1883 Louis Pasteur cultivât déjà le rhabdovirus (le virus de la rage) dans le tissu nerveux du lapin, le terme de « virus », utilisé par le docteur Jean Hameau en 1837 dans son exposé Réflexion sur les virus présenté devant la Société Royale de Médecine de Bordeaux, n’a alors pas de sens précis et désigne tout agent pathogène.

A cette époque, l’isolation des agents infectieux était réalisée grâce au filtre en porcelaine de Charles Chamberland (l’un des collaborateurs de Louis Pasteur), mis au point en 1884 et qui avait pour propriété de pouvoir retenir les bactéries. Les virus, eux, restaient totalement inconnus, car les chercheurs n’imaginaient pas qu’il puisse exister un micro-organisme en moyenne mille fois plus petit qu’une bactérie.

1.2 La maladie de la mosaïque du tabac 

On attribue à Dimitri Ivanovsky (1864-1920), biologiste et botaniste russe, la découverte des virus. Il est considéré comme le père de la virologie, et bien qu’il n’ait pas reçu de son vivant la reconnaissance qu’il méritait pour ses découvertes, l’URSS a créé à Moscou l’Institut Ivanovsky de Virologie en l’honneur de son travail, et l’Académie des Sciences Médicales décerne chaque année le prix Ivanovsky pour le meilleur travail de l’année en virologie.

Dimitri Ivanovsky est né près de Saint-Pétersbourg le 28 octobre 1864. Il a soutenu sa thèse « Sur deux maladies des plantes de tabac », et a obtenu son diplôme de sciences en 1888 à l’université de Saint-Pétersbourg. Il s’est préparé à une carrière dans l’enseignement universitaire et a travaillé au laboratoire de botanique.

Encore étudiant, Ivanovsky a été chargé en 1887 et en 1890, par le ministère russe de l’agriculture, d’enquêter sur les causes d’une maladie atteignant les plantations de tabac. Il s’est appuyé sur les travaux antérieurs d’Adolf Mayer, qui avait commencé ses recherches sur les maladies du tabac en Hollande en 1879. Il a été le premier à lui donner un nom permanent et a réalisé la première transmission expérimentale d’une maladie virale chez les plantes.

Dans un article présenté le 12 février 1892 devant l’Académie des sciences de Saint-Pétersbourg, Ivanovsky a rapporté que la maladie de la mosaïque du tabac était causée par un agent infectieux filtrable, car après avoir filtré le jus de plante malade et inoculé le filtrat dans des plantes saines, il a constaté que celles-ci tombaient malades. Il en a conclu que le filtrat pouvait contenir un agent infectieux plus petit qu’une bactérie.

Martinus Beijerinck fut le troisième scientifique à étudier la maladie de la mosaïque du tabac à la fin du XIXe siècle. Il a découvert en 1898 que cet agent causal était certes filtrable, mais il a étendu ses recherches et a démontré que l’agent infectieux était capable de se multiplier dans les plantes vivantes, c’est l’hypothèse du « contagium vivum fluidum » (vie contagieuse).

Ainsi, la maladie de la mosaïque du tabac a joué un rôle majeur dans les origines de la virologie. Dans une petite série d’étapes allant de Mayer à Ivanovsky et à Beijerinck, le concept d’un agent filtrable, trop petit pour être observé au microscope optique mais capable de provoquer des maladies en se multipliant dans les cellules et les tissus vivants, est né.

Bénédicte Le Panse

L’AUTEURE

Après une thèse obtenue en 2006 (doctorat de physiologie) au sein du CHR d’Orléans, Bénédicte Le Panse oriente ses travaux de recherche dans un premier temps à l’institut de prévention et de recherche sur l’ostéoporose (IPROS) dans lequel elle met en avant les bienfaits de l’activité physique sur la densité minérale osseuse aussi bien chez l’adulte sain que chez celui présentant une maladie chronique.

Impliquée également dans le laboratoire d’exploration fonctionnelle respiratoire (EFR), elle dirige ses recherches sur l’absorption de produits pharmaceutiques (bêta-2 Agonistes) afin de montrer les effets ergogéniques métaboliques et hormonaux d’une prise chronique et aiguë de salbutamol.

Sportive de haut niveau en force athlétique et chercheur, Bénédicte fera de ses titres internationaux (en particulier championne de France, d’Europe et du monde à plusieurs reprises) des experiences qu’elle liera à ses travaux de recherche.

Ses 20 années d’expérience dans la recherche et dans l’aspect physico-nutritionnel l’ont amenée à se spécialiser et à conseiller un grand nombre de personnes afin que celles-ci puissent vivre dans un état de santé optimum.

Table des matières de la version complète

Couverture

Copyright

Préfaces

Introduction

1. Histoire de la virologie

1.1 Naissance de la virologie

1.2 La maladie de la mosaïque du tabac

1.3 L’expansion de la virologie

En résumé

2. Qu’est-ce qu’un virus ?

2.1 Le génome

2.2 La capside

2.3 L’enveloppe

2.4 Classification des virus

2.5 Les virus à ADN

2.6 Les virus à ARN

2.7 Le cycle viral

2.8 Physiopathologie des infections virales

2.8.1 Quelques définitions

2.8.2 Propagation des virus dans l’organisme

En résumé

3. Le virus de la grippe (influenza)

3.1 Diagnostic clinique de la grippe

3.2 Parcours du virus dans l’organisme

3.3 La grippe peut tuer

3.4 Prévention et hygiène

3.5 Différences entre grippe et Covid-19

En résumé

4. Le coronavirus

4.1 Les différents types de coronavirus

4.2 Infections bénignes

4.3 Infections graves

5. Coronavirus et Covid-19

6. Idées reçues - Nouveau coronavirus (2019-nCoV) : conseils au grand public

7. Booster son système immunitaire

7.1 Quel est le rôle de notre système immunitaire ?

7.2 Comment est formé le système immunitaire ?

En résumé

7.3 Booster son système immunitaire par l’alimentation et l’activité physique

7.3.1 Booster son système immunitaire par l’alimentation. Équilibre alimentaire et journée type

7.3.2 Booster son système immunitaire par l’activité physique

Fiches activité physique

Conclusion

Lexique

L’Auteure

Bibliographie

Remerciements